Выявление Bordetella holmesii среди больных, госпитализированных в стационар с подозрением на коклюш или коклюшеподобные заболевания


https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-2-45-52

Полный текст:


Аннотация

Цель: выявить и оценить распространенность B. holmesii среди больных, госпитализированных в стационар с подозрением на коклюш и коклюшеподобные заболевания.

Материалы и методы. Исследовано 424 пробы клинического материала от больных с подозрением на коклюш и коклюшеподобные заболевания, госпитализированных в Инфекционную клиническую больницу № 1 в 2017– 2018 гг. Выявление фрагментов генома бордетелл осуществляли в ПЦР-РВ с «АмплиСенс® Bordetella multi-FL». Для идентификации фрагментов генома B. holmesii использовали ПЦР-РВ с праймерами IS481, IS1001 и hIS1001.

Результаты. В исследование включено 424 пациента, из них 57,6% детей до 1 года, 42,3% детей старше 1 года и 2,6% взрослых. При использовании тестсистемы обнаружено 60,4% образцов, содержащих ДНК B. pertussis; 1,9% образцов – ДНК B. parapertussis; в 34,9% образцов получен отрицательный и в 2,8% – сомнительный результаты. Исследование 424 образцов в ПЦР-РВ с помощью IS481, IS1001 и hIS1001 праймеров показало, что 61,1% образцов содержали ДНК B. pertussis; 0,7% образцов – ДНК В. parapertussis и 3,8% образцов – ДНК B. holmesii. В 143 образцах результат был отрицательным. Из 16 ДНК B. holmesii, 9 образцов ранее были отрицательными, в 2 образцах – сомнительный результат и 1 образец был ранее идентифицирован как ДНК B. parapertussis, в 4 образцах обнаружена ДНК B. pertussis и B. holmesii.

Заключение. Исследование свидетельствует о циркуляции B. holmesii на территории России, что под тверждается выявлением положительных образцов в 3,8% случаев среди больных детей и взрослых, госпитализированных в стационар с подозрением на коклюш и коклюшеподобные заболевания. Для повышения эффективности лабораторного подтверждения клинического диагноза коклюша и коклюшеподобных заболеваний рекомендуется совершенствовать генодиагностику коклюшной инфекции с учетом идентификации ДНК B. holmesii.


Об авторах

Н. Т. Гадуа
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия

Гадуа Натия Торникеевна – старший научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций, кандидат медицинских наук 

Москва



А. Б. Борисова
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Россия

Борисова Анастасия Борисовна – младший научный сотрудник клинического отдела Московского научноисследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского; врач-ординатор кафедры инфекционных болезней у детей Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова

Москва



А. С. Пименова
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия

Пименова Алена Сергеевна – научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций, кандидат медицинских наук 

Москва



О. Ю. Борисова
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Россия

Борисова Ольга Юрьевна – руководитель лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского; профессор кафедры микробиологии и вирусологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, доктор медицинских наук, доцент

Москва



М. С. Петрова
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия

Петрова Марина Семеновна – старший научный сотрудник клинического отдела, кандидат медицинских наук

Москва



О. В. Шамшева
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Россия

Шамшева Ольга Васильевна – заведующая кафедрой инфекционных болезней у детей, доктор медицинских наук, профессор

Москва



С. С. Афанасьев
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия

Афанасьев Станислав Степанович – главный научный сотрудник, доктор медицинских наук, профессор 

Москва



Л. И. Кафарская
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Россия

Кафарская Людмила Ивановна – заведующая кафедрой микробиологии и вирусологии, доктор медицинских наук, профессор 

Москва



Е. В. Власов
Инфекционная клиническая больница № 1
Россия

Власов Евгений Валерьевич – заместитель главного врача по медицинской части (детство) 

Москва



М. С. Афанасьев
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Россия

Афанасьев Максим Станиславович – профессор кафедры клинической аллергологии и иммунологии, доктор медицинских наук 

Москва



А. В. Алешкин
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия
Алешкин Андрей Владимирович – главный научный сотрудник, доктор биологических наук, профессор РАН


С. В. Бунин
Инфекционная клиническая больница № 1
Россия

Бунин Сергей Валерьевич – заведующий 3-м педиатрическим инфекционным отделением 

Москва



В. А. Алешкин
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского
Россия

Алешкин Владимир Андрианович – научный руководитель, доктор биологических наук, профессор 

Москва



Список литературы

1. Cherry JD, Pertussis and other Bordetella infections. In: Cherry JD, Demmler-Harrison G, Kaplan S., editors. Feigin and Cherry’s Textbook of Pediatric Infectious Diseases, 8th ed.; 2013; ISBN: 9780323392822; https://www.elsevier.com/books/feigin-and-cherrys-textbook-of-pediatric-infectious-diseases/unknown/978-0-323-39281-5

2. Лобзин, Ю.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика коклюша у детей первых месяцев жизни / Ю.В. Лобзин [и др.] // Детские инфекции. 2011. № 10 (4). С. 5-9. https://elibrary.ru/item.asp?id=17070355

3. Петрова, М.С. Коклюш у детей раннего возраста / М.С. Петрова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2012. № 6. С. 12-24. https://elibrary.ru/item.asp?id=18784227

4. Попова, О.П. Клинические особенности коклюша у взрослых. / О.П. Попова [и др.] // Терапевтический архив. 2014. № 86(11). С. 78-81. https://elibrary.ru/item.asp?id=22880660

5. Rodgers L, Martin SW, Cohn A, et al. Epidemiologic and Laboratory Features of a Large Outbreak of Pertussis-Like Illnesses Associated With Cocirculating Bordetella holmesii and Bordetella pertussis Ohio, 2010-2011. Clin. Infect. Dis. 2013; 56(3): https://doi.org/331.DOI:10.1093/cid/cis888; https://www.ncbi.nlm. http://nih.gov/pubmed/23087388

6. Kamiya H, Otsuka N, Ando Y, et al. Transmission of Bordetella holmesii during pertussis outbreak, Japan. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18(7): 1166-1169. https://doi.org/10.3201/eid1807.120130; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22709586

7. Guthrie JL, Robertson AV, Tang P, et al. Novel duplex realtime PCR assay detects Bordetella holmesii in specimens from patients with pertussis-like symptoms in Ontario, Canada. J. Clin. Microbiol. 2010; 48: 1435-1437. https://doi.org/10.1128/JCM.02417-09; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20181919

8. Njamkepo E, Bonacorsi S, Debruyne M, et al. Significant finding of Bordetella holmesii DNA in nasopharyngeal samples from French patients with suspected pertussis. J Clin. Microbiol. 2011; 49: 4347-4348. https://doi.org/10.1128/JCM.01272-11; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22012009

9. Bottero D, Griffith MM, Lara C, et al. Bordetella holmesii in children suspected of pertussis in Argentina. Epidemiol. Infect. 2013; 141: 714-717. https://doi.org/10.1017/S095026881200132X; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22874073

10. Miranda C, Porte L, Garcia P. Bordetella holmesii in nasopharyngeal samples from Chilean patients with suspected Bordetella pertussis infection. J. Clin. Microbiol. 2012; 50: 1505. https://doi.org/10.1128/JCM.06747-11; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22427606

11. Fong W, Timms V, Holmes N, et al. Detection and incidence of Bordetella holmesii in respiratory specimens from patiens with pertussis-like symptoms in New South Wales, Australia. Pathology. 2018; 50: 322-326. https://doi.org/10.1016/j.pathol.2017.10.014; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29455870

12. Mooi FR, Bruisten S, Linde I, et al. Characterization of Bordetella holmesii isolates from patients with pertussis-like illness in Netherlands. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2012; 64: 289-291. https://doi.org/10.1111/j.1574-695X.2011.00911.x. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22098551

13. Lotfi MN, Nikbin VS, Nasiri O, et al. Molecular detection of Bordetella holmesii in two infants with pertussis-like syndrome: the first report from Iran. Iranian Journal of Microbology. 2017; 9(4): 219-223. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Lotfi+MN+2017

14. Mir-Cros A, Codina G, MartinGomez TM, et al. Emergence of Bordetella holmesii as a Causative Agent of Whooping Cough, Barcelona, Spain. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23 (11): 1856-1859. https://doi.org/10.3201/eid2311.170960; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29052540

15. Yih WK, Silva EA, Ida J, et al. Bordetella holmesiiLike Organisms Isolated from Massachusetts Patiens with Pertussis Like Symptoms, Boston, Massachusetts, USA. Emerg. Infect. Dis. 1999; 5(3): 441-443. https://doi.org/10.3201/eid0503.990317; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10341183

16. Dinu S, Guillot S, Dragomirescu CC, et al. Whooping cough in south-East Romania: a 1-year study. Diagn. Microbiol . Dis. 2014; 78: 302-306. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2013.09.017; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24355701

17. Katfy K, Guiso N, Diawara I, et al. Epidemiology of pertussis in Casablanca (Morocco): contribution of conventional and molecular diagnosis tools. BMC Infect. Dis. 2017; 17: 348. https://doi.org/10.1186/s12879-017-2452-3; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28511667

18. Kamachi K, Yoshino S, Katsukawa C. et al. Laboratorybased surveillance of pertussis using multitarget real-time PCR in Japan: evidence for Bordetella pertussis infection in preteens and teens. New Microbes New Infect. 2015; 8:70-4. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2015.10.001. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27076914

19. Weyant RS, Hollis DG, Weaver RE, et al. Bordetella holmesii sp. now., a new gram-negative species associated with septicemia. J. Clin. Microbiol .1995; 33: 1-7. PMC227868; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7699023

20. Shepard CW, Daneshwar MI, Kaiser RM, et al. Bordetella holmesii bacteremia: A newly recognized clinical entity among asplenic patients. Clin. Infect. Dis. 2004; 38: 799 https://doi.org/DOI:10.1086/381888; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Shepard+CW+2004

21. Antila M, He Q, De Jong C, et al. Bordetella holmesii DNA is not detected in nasopharyngeal swabs from Finnish and Dutch patients with suspected pertussis. J. Med. Microbiol. 2006; 55: 1043-1051. https://doi.org/10.1099/jmm.0.46331-0 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16849724

22. Pittet LF, Posfay-Barbe KM. Bordetella holmesii: Still Emerging and Elusive 20 Years On. Microbiology Spectrum. 2016 ;4(2): 1-12. https://doi.org/10.1128/microbiolspec.EI10-0003-2015; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27227292

23. Williams MM, Taylor TH, Jr., Warshauer DM, et al. Harmonization of Bordetella pertussis real-time PCR diagnostics in the United States in 2012. J. Clin. Microbiol. 2015; 53: 118-123. https://doi.org/10.1128/JCM.02368-14; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25355770

24. Mazengia E, Silva EA, Peppe JA, et al. Recovery of Bordetella holmesii from patients with pertussis-like symptoms: use of pulsed-field gel electrophoresis to characterize circulating strains. J. Clin. Microbiol. 2000; 38: 23302333. PMCID:PMC86794; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Mazengia+E+2000

25. Matoo S, Cherry JD. Molecular pathogenesis, epidemiology, and clinical manifestations of respiratory infections due to Bordetella pertussis and other Bordetella subspecies. Clin. Microbiol. Rev. 2005; 18: 326-382 https://doi.org/10.1128/CMR.18.2.326-382.2005; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15831828

26. Harvill ET, Goodfield LL, Ivanov Y, et al. Genome Sequences of Nine Bordetella holmesii Strains Isolated in the United States. Genome Announc. 2014; 2(3): pii: e00438-14. https://doi.org/10.1128/genomeA.00438-14;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24948754

27. Riffelmann M, Von Konig CW, Caro V, et al. Nucleic acid amplification tests for diagnosis of Bordetella infections. J. Clin. Microbiol. 2005; 43: 4925-4929. https://doi.org/10.1128/JCM.43.10.4925-4929.2005; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16207944

28. Tizolova A, Guiso N, Guillot S. Insertion sequences shared by Bordetella species and implications for the biological diagnosis of pertussis syndrome. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2013; 32: 89-96. https://doi.org/10.1007/s10096-012-1718-3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Tizolova+A+2013

29. Dalby T, Fry NK, Krogfelt KA, et al. Evaluation of PCR methods for the diagnosis of pertussis by the European surveillance network for vaccine-preventable diseases (EUVAC.NET). Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2013; 32: 1285-1289. https://doi.org/10.1007/s10096-013-1874-0. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23609510

30. Zhang X, Weyrich LS, Lavine JS, et al. Lack of cross-protection against Bordetella holmesii after pertussis vaccination. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18: 1771-1779. https://doi.org/10.3201/eid1811.111544. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23092514


Дополнительные файлы

Для цитирования: Гадуа Н.Т., Борисова А.Б., Пименова А.С., Борисова О.Ю., Петрова М.С., Шамшева О.В., Афанасьев С.С., Кафарская Л.И., Власов Е.В., Афанасьев М.С., Алешкин А.В., Бунин С.В., Алешкин В.А. Выявление Bordetella holmesii среди больных, госпитализированных в стационар с подозрением на коклюш или коклюшеподобные заболевания. Журнал инфектологии. 2019;11(2):45-52. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-2-45-52

For citation: Gadua N.T., Borisova A.B., Pimenova A.S., Borisova O.Y., Petrova M.S., Shamsheva O.V., Afanas’ev S.S., Kafarskaya L.I., Vlasov E.V., Afanas’ev M.S., Aleshkin A.V., Bunin S.V., Aleshkin V.A. Identification of Bordetella holmesii among the patients hospitalized with suspicion of pertussis and pertussis-like illnesses. Journal Infectology. 2019;11(2):45-52. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-2-45-52

Просмотров: 128

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-6732 (Print)
ISSN 2499-9865 (Online)