Ускоренный метод идентификации бактерий и микромицетов в гемокультурах у детей с использованием мультиплексной пцр в режиме реального времени

Цель: оценить эффективность и клиническую значимость ускоренного метода идентификации микроорганизмов в гемокультурах у детей с использованием мультиплексной ПЦР в режиме реального времени.

Материалы, и методы: всего было исследовано 72 образца крови, полученных от. 62 детей в возрасте от. 3 месяцев до 16 лет. Идентификацию выделенных культур проводили с помощью ПЦР в реальном времени, а также с использованием, классических культуральных микробиологических методов.

Результаты: исходя из частоты выявления и клинической значимости патогенов, выделяемых от. больных, была сформирована панель тест-систем для их идентификации с помощью ПЦР в реальном времени. Показано, что эффективность метода идентификации бактерий и микромицетов с помощью ПЦР в реальном времени по сравнению с микробиологическим методом составила 86,7%. Установлено значительное сокращение времени идентификации возбудителей (с 48 ч до 5—7 ч). Кроме того, использование данного метода позволяет в эти же сроки выявлять ряд генов антибиотикорезистентности (в частности, гены приобретенных карбапене-маз и метициллин-резистентности стафилококков).

Заключение: разработанный метод идентификации микроорганизмов в крови с использованием. ПЦР в реальном. времени показал свою эффективность, клиническую значимость и возможность использования при оказании медицинской помощи педиатрическим, пациентам.. Его применение значительно сокращает сроки получения результатов и, таким, образом., позволяет, начать своевременную этиотропную терапию.

1. Ruth A. McCracken C.E., Fortenberry J.D. et al. Pediatric severe sepsis: current trends and outcomes from the Pediatric Health Information Systems database. Pediatr. Crit. Care Med. 2014 Nov; 15 (9): 828-838.

2. Скрипченко, Н.В. Нейроинфекции у детей в современных условиях / Н.В. Скрипченко [и др.] // Практическая медицина. — 2017. — №111 ('10). — С. 7—15.

3. Скрипченко, Н.В. Гнойные менингиты у детей : руководство для врачей / Н.В. Скрипченко, Ю.В. Лобзин, А.А. Вильниц. - СПб: СИНЭЛ, 2017. - 404 с.

4. Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений: приказ МЗ СССР № 535 от 22 апреля 1985 г. Ссылка активна на 31.08.2018 г. — http://www.alppp.ru/law/zdravoohranenie--fizicheskaja-kultura-i-sport--turizm/zdravoohranenie/64/prikaz-minzdrava-sssr-ot-22-04-1985--535.html

5. Киселева, Е.Е. Алгоритм выявления и видовой идентификации бактерий в крови с использованием ПЦР / Е.Е. Киселева // Вестник гематологии. — 2017. — Т. XIII, №1. — С. 19 — 24.

6. Багирова, Н.С. Бактериемия истинная и ложная: значение критериев оценки клинической значимости положительной гемокультуры / Н.С. Багирова // Клиническая Лабораторная Диагностика. — 2015. — Т. 60, № 8. — С. 55 — 61.

7. Матосова, С.В. Апробация методики на основе ПЦР в режиме реального времени для расшифровки этиологии септических состояний / С.В.Матосова [и др.] // Вестник гематологии. — 2014. — Т. Х, № 4. — С. 39.

8. Hall K.K., Lyman J.A. Updated review of blood culture contamination. Clin. Microbiol Rev. 2006; 19 (4): 788-802.

9. Chebotkevich, V.N., Bessmeltsev S.S., Kiseleva E.E. et al. Bloodstream infections and herpesvirus activation following intensive chemotherapy of adult oncohematological patients. Cellular Therapy and Transplantation. 2016; 5 (4(17)): 21-31.

10. Widerstrom M.,Wistrom J., Edebro H. et al. Colonization of patients, healthcare workers, and the environment with healthcare-associated Staphylococcus epidermidis genotypes in an intensive care unit: a prospective observational cohort study. BMC Infect Dis. 2016; 16: 743.

11. Nayyar C., Thakur P., Tak V., Saigal K. Stenotroph-omonas maltophilia: An Emerging Pathogen in Paediatric Population. Journal of Clinical and Diagnostic Research. 2017; 11 (1): 8-11.

12. Лачкова, Л.В. Клинико-патогенетические особенности и тактика терапии кампилобактериоза у детей : авто-реф. дис. ... канд. мед. наук (14.00.10) / Л.В. Лачкова; НИИ-ДИ. — СПб, 2006.— 24 с

13. Менингококковая инфекция и гнойные бактериальные менингиты в Российской Федерации. Информационно-аналитический обзор. Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора РФ 2016.

14. Кветная, А.С. Стратегия микробиологической диагностики бактериальных гнойных менингитов / А.С. Кветная, Л.И. Железова // Материалы 7-й Российско-итальянской конф. «Актуальные вопросы социально значимых вирусных инфекций». — Великий Новгород, 2009. — С. 68 — 72.

15. Kumar A., Roberts D., Wood E.K. et al. Duration of hypotension before initiation of effective antimicrobial therapy is the critical determinant of survival in human septic shock. Crit. Care Med. 2006; 34 (6): 1589-1596.

16. Weiss S.L., Fitzgerald J.C., Pappachan J. et al. Global Epidemiology of Pediatric Severe Sepsis: The Sepsis Prevalence, Outcomes, and Therapies Study. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2015; 191 (10): 1147—1157.