Особенности кишечной микробиоты при выраженном фиброзе и циррозе печени, ассоциированных с хроническим гепатитом С

Цель: охарактеризовать специфические изменения в профиле кишечной микробиоты, ассоциированные с прогрессирующим фиброзом печени, у пациентов с хронической HCV-инфекцией.

Материалы и методы: проведено одноцентровое поперечное клиническое исследование 88 пациентов с хронической HCV-инфекцией (51 человек с хроническим вирусным гепатитом С и 37 человек с циррозом печени вирусной С этиологии), в рамках которого определен профиль кишечной микробиоты методом метагеномного секвенирования 16S рРНК. Высокопроизводительное секвенирование проводилось с помощью генетического анализатора MiSeq (Illumina, США) с использованием протокола, основанного на анализе вариабельных регионов гена 16S рРНК. Данные анализировали с использованием Kraken2. Уровень значимости принят равным 0,05.

Результаты: описаны значительные изменения микробного разнообразия кишечника у пациентов с выраженным фиброзом и циррозом печени. У пациентов с прогрессирующим фиброзом отмечено значительное увеличение представителей семейств Enterobacteriaceae, Lactobacillus, Streptococcus, Enterococcus, Lactococcus и Leuconostoc. Также в составе кишечной микробиоты отмечены нетипичные микроорганизмы, такие как Photobacterium, Spiroplasma, Candidatus Portiera. Совокупность этих изменений указывает на серьезный сдвиг микробного равновесия. В группе пациентов без фиброза печени, напротив, наблюдается увеличение численности Odoribacter и Intestinimonas, являющихся бутират-продуцентами, а также Akkermansia и Barnesiella, что свидетельствует о нормальном функционировании микробного сообщества кишечника.

Заключение: изменения кишечной микробиоты при выраженном фиброзе – это формирование устойчивого и самоподдерживающегося патологического микробного сообщества. Выявленные изменения могут быть использованы для разработки методов коррекции, направленных на восстановление баланса кишечной микробиоты.

1. Liu Z, Shi O, Zhang T, et al. Disease burden of viral hepatitis A, B, C and E: A systematic analysis. Journal of Viral Hepatitis. 2020;27(12):1284-1296. DOI: https://doi.org/10.1111/jvh.13371

2. Fortea JI, Crespo J, Puente Á. Cirrhosis, a Global and Challenging Disease. J Clin Med. 2022;11(21):6512. DOI: https://doi.org/10.3390/jcm11216512

3. Huang, D.Q., Terrault, N.A., Tacke, F. et al. Global epidemiology of cirrhosis — aetiology, trends and predictions. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 20, 388–398 (2023). https://doi.org/10.1038/s41575-023-00759-2

4. Стома И.О. Микробиом в медицине: руководство для врачей. Москва; 2024. 320 с. Stoma IO. Microbiome in medicine: a guide for doctors. Moscow: GEOTAR-Media, 2024. 320 p. (in Russ.).

5. Lee NY, Suk KT. The Role of the Gut Microbiome in Liver Cirrhosis Treatment. International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(1):199. https://doi.org/10.3390/ijms22010199

6. Roehlen N, Crouchet E, Baumert TF. Liver Fibrosis: Mechanistic Concepts and Therapeutic Perspectives. Cells. 2020 Apr 3;9(4):875. doi: 10.3390/cells9040875. PMID: 32260126; PMCID: PMC7226751.

7. Hsu CL, Schnabl B. The gut-liver axis and gut microbiota in health and liver disease. Nat Rev Microbiol. 2023;21(11):719733. DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-023-00904-3

8. Изменения кишечной микробиоты на фоне хронической HCV-инфекции в зависимости от генотипа вируса / И.О. Стома, З.А. Цейко, Е.В. Воропаев [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2025. – Т. 22, № 2. – С. 147-160. – DOI 10.51523/2708-6011.2025-22-2-18. – EDN BWDPSM.

9. Zhang L, Zi L, Kuang T, Wang K, Qiu Z, Wu Z, Liu L, Liu R, Wang P, Wang W. Investigating causal associations among gut microbiota, metabolites, and liver diseases: a Mendelian randomization study. Front Endocrinol (Lausanne). 2023 Jul 5;14:1159148. doi: 10.3389/fendo.2023.1159148. PMID: 37476494; PMCID: PMC10354516.

10. Li S, Zhou C, Liu T, Zhang L, Liu S, Zhao Q, Liu J, Zhao W. Causal relationships between the gut microbiota, inflammatory cytokines, and alcoholic liver disease: a Mendelian randomization analysis. Front Endocrinol (Lausanne). 2024 Oct 21;15:1442603. doi: 10.3389/fendo.2024.1442603. PMID: 39497803; PMCID: PMC11532067.

11. Baldelli V, Scaldaferri F, Putignani L, Del Chierico F. The Role of Enterobacteriaceae in Gut Microbiota Dysbiosis in Inflammatory Bowel Diseases. Microorganisms. 2021; 9(4):697. https://doi.org/10.3390/microorganisms9040697

12. Taylor, S.J., Winter, M.G., Gillis, C.C. et al. Colonocytederived lactate promotes E. coli fitness in the context of inflammation-associated gut microbiota dysbiosis. Microbiome 10, 200 (2022). https://doi.org/10.1186/s40168-022-01389-7

13. Tuomisto, S., Pessi, T., Collin, P. et al. Changes in gut bacterial populations and their translocation into liver and ascites in alcoholic liver cirrhotics. BMC Gastroenterol 14, 40 (2014). https://doi.org/10.1186/1471-230X-14-40

14. Jiang L, Wang J, Liu Z, Jiang A, Li S, Wu D, Zhang Y, Zhu X, Zhou E, Wei Z, Yang Z. Sodium Butyrate Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Inflammatory Responses by DownRegulation of NF-κB, NLRP3 Signaling Pathway, and Activating Histone Acetylation in Bovine Macrophages. Front Vet Sci. 2020 Nov 5;7:579674. doi: 10.3389/fvets.2020.579674. PMID: 33251265; PMCID: PMC7674777.

15. Derrien M, Vaughan EE, Plugge CM, de Vos WM. Akkermansia muciniphila gen. nov., sp. nov., a human intestinal mucindegrading bacterium. Int J Syst Evol Microbiol. 2004 Sep;54(Pt 5):1469-1476. doi: 10.1099/ijs.0.02873-0. PMID: 15388697.

16. Ubeda C, Bucci V, Caballero S, Djukovic A, Toussaint NC, Equinda M, Lipuma L, Ling L, Gobourne A, No D, Taur Y, Jenq RR, van den Brink MR, Xavier JB, Pamer EG. Intestinal microbiota containing Barnesiella species cures vancomycinresistant Enterococcus faecium colonization. Infect Immun. 2013 Mar;81(3):965-73. doi: 10.1128/IAI.01197-12. Epub 2013 Jan 14. PMID: 23319552; PMCID: PMC3584866.