jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2026-18-1-62-73jofin-1946Research ArticleОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕORIGINAL RESEARCHОсобенности кишечной микробиоты при выраженном фиброзе и циррозе печени, ассоциированных с хроническим гепатитом СFeatures of the gut microbiota in patients with severe liver fibrosis and cirrhosis associated with chronic hepatitis CСтомаИ. О.StomaI. O.

Стома Игорь Олегович – ректор Гомельского ГМУ, д.м.н., профессор.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-00

Gomel

gsmu@gsmu.byЦейкоЗ. А.TseikoZ. A.

Цейко Зинаида Анатольевна – ассистент кафедры инфекционных болезней Гомельского ГМУ.

Гомель; тел.: +375(29)976-02-53

Gomel

tzeiko.zinaida@yandex.byВоропаевЕ. В.VoropaevE. V.

Воропаев Евгений Викторович – проректор по научной работе Гомельского ГМУ, к.м.н., доцент.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-08

Gomel

voropaev.evgenii@gmail.comКозорезЕ. И.KozorezE. I.

Козорез Елена Ивановна – заведующий кафедрой инфекционных болезней Гомельского ГМУ, к.м.н., доцент.

Гомель; тел.: +375(232)35-79-36

Gomel

elena_kozorez@mail.ruКовалевА. А.KovalevA. A.

Ковалев Алексей Алексеевич – старший преподаватель кафедры медицинской и биологической физики.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-08

Gomel

kovalev.data.analysis.gsmu@yandex.byОсипкинаО. В.OsipkinaO. V.

Осипкина Ольга Викторовна – заведующий научно-исследовательской лабораторией Гомельского ГМУ.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-08

Gomel

olga.osipkina@mail.ruЗятьковА. А.ZiatskovA. A.

Зятьков Алексей Александрович – старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории Гомельского ГМУ.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-08

Gomel

ziatskovaa@gmail.comШафоростА. С.ShaforostA. S.

Шафорост Александр Сергеевич – старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории Гомельского ГМУ.

Гомель; тел.: +375(232)35-97-08

Gomel

asofocl@mail.ruГомельский государственный медицинский университетБеларусьGomel State Medical UniversityBelarus2026270320261816273Copyright © Стома И.О., Цейко З.А., Воропаев Е.В., Козорез Е.И., Ковалев А.А., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С., 20262026Стома И.О., Цейко З.А., Воропаев Е.В., Козорез Е.И., Ковалев А.А., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С.Stoma I.O., Tseiko Z.A., Voropaev E.V., Kozorez E.I., Kovalev A.A., Osipkina O.V., Ziatskov A.A., Shaforost A.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1946Цель

Цель: охарактеризовать специфические изменения в профиле кишечной микробиоты, ассоциированные с прогрессирующим фиброзом печени, у пациентов с хронической HCV-инфекцией.

Материалы и методы

Материалы и методы: проведено одноцентровое поперечное клиническое исследование 88 пациентов с хронической HCV-инфекцией (51 человек с хроническим вирусным гепатитом С и 37 человек с циррозом печени вирусной С этиологии), в рамках которого определен профиль кишечной микробиоты методом метагеномного секвенирования 16S рРНК. Высокопроизводительное секвенирование проводилось с помощью генетического анализатора MiSeq (Illumina, США) с использованием протокола, основанного на анализе вариабельных регионов гена 16S рРНК. Данные анализировали с использованием Kraken2. Уровень значимости принят равным 0,05.

Результаты

Результаты: описаны значительные изменения микробного разнообразия кишечника у пациентов с выраженным фиброзом и циррозом печени. У пациентов с прогрессирующим фиброзом отмечено значительное увеличение представителей семейств Enterobacteriaceae, Lactobacillus, Streptococcus, Enterococcus, Lactococcus и Leuconostoc. Также в составе кишечной микробиоты отмечены нетипичные микроорганизмы, такие как Photobacterium, Spiroplasma, Candidatus Portiera. Совокупность этих изменений указывает на серьезный сдвиг микробного равновесия. В группе пациентов без фиброза печени, напротив, наблюдается увеличение численности Odoribacter и Intestinimonas, являющихся бутират-продуцентами, а также Akkermansia и Barnesiella, что свидетельствует о нормальном функционировании микробного сообщества кишечника.

Заключение

Заключение: изменения кишечной микробиоты при выраженном фиброзе – это формирование устойчивого и самоподдерживающегося патологического микробного сообщества. Выявленные изменения могут быть использованы для разработки методов коррекции, направленных на восстановление баланса кишечной микробиоты.

Objective

Objective: to characterize specific changes in the intestinal microbiome profile associated with progressive liver fibrosis in patients with chronic HCV infection

Materials and methods

Materials and methods: a single-center cross-sectional clinical study of 88 patients with chronic HCV infection (51 people with chronic viral hepatitis C and 37 people with liver cirrhosis of viral C etiology) was conducted, in which the profile of the gut microbiota was determined by 16S rRNA metagenomic sequencing. High-throughput sequencing was performed using a MiSeq genetic analyzer (Illumina, USA) using a protocol based on the analysis of variable regions of the 16S rRNA gene. The data was analyzed using Kraken2. The significance level is assumed to be 0,05.

Results

Results: significant changes in gut microbial diversity have been described in patients with severe liver fibrosis and cirrhosis. In patients with progressive fibrosis, there was a significant increase in representatives of the Enterobacteriaceae, Lactobacillus, Streptococcus, Enterococcus, Lactococcus and Leuconostoc families. Atypical microorganisms such as Photobacterium, Spiroplasma, Candidatus Portiera are also noted in the gut microbiota. The combination of these changes indicates a shift in microbial equilibrium. On the contrary, in the group of patients without liver fibrosis, there is an increase in the number of Odoribacter and Intestinimonas, which are butyrate producers. As well as Akkermansia and Barnesiella, which indicates the normal functioning of the intestinal microbial community.

Conclusions

Conclusions: changes in the intestinal microbiota in severe fibrosis result in the formation of a stable and self-sustaining pathological microbial community. The identified changes can be used to develop corrective methods aimed at restoring the balance of the intestinal microbiota.

хронический гепатит Скишечная микробиотацирроз печенимикробиомметагеномное секвенированиеchronic hepatitis Cgut microbiotaliver cirrhosismicrobiomemetagenomic sequencingReferencesLiu Z, Shi O, Zhang T, et al. Disease burden of viral hepatitis A, B, C and E: A systematic analysis. Journal of Viral Hepatitis. 2020;27(12):1284-1296. DOI: https://doi.org/10.1111/jvh.13371Liu Z, Shi O, Zhang T, et al. Disease burden of viral hepatitis A, B, C and E: A systematic analysis. Journal of Viral Hepatitis. 2020;27(12):1284-1296. DOI: https://doi.org/10.1111/jvh.13371Fortea JI, Crespo J, Puente Á. Cirrhosis, a Global and Challenging Disease. J Clin Med. 2022;11(21):6512. DOI: https://doi.org/10.3390/jcm11216512Fortea JI, Crespo J, Puente Á. Cirrhosis, a Global and Challenging Disease. J Clin Med. 2022;11(21):6512. DOI: https://doi.org/10.3390/jcm11216512Huang, D.Q., Terrault, N.A., Tacke, F. et al. Global epidemiology of cirrhosis — aetiology, trends and predictions. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 20, 388–398 (2023). https://doi.org/10.1038/s41575-023-00759-2Huang, D.Q., Terrault, N.A., Tacke, F. et al. Global epidemiology of cirrhosis — aetiology, trends and predictions. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 20, 388–398 (2023). https://doi.org/10.1038/s41575-023-00759-2Стома И.О. Микробиом в медицине: руководство для врачей. Москва; 2024. 320 с. Stoma IO. Microbiome in medicine: a guide for doctors. Moscow: GEOTAR-Media, 2024. 320 p. (in Russ.).Stoma I.O. Mikrobiom v medicine: rukovodstvo dlya vrachej. Moskva; 2024. 320 s.Lee NY, Suk KT. The Role of the Gut Microbiome in Liver Cirrhosis Treatment. International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(1):199. https://doi.org/10.3390/ijms22010199Lee NY, Suk KT. The Role of the Gut Microbiome in Liver Cirrhosis Treatment. International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(1):199. https://doi.org/10.3390/ijms22010199Roehlen N, Crouchet E, Baumert TF. Liver Fibrosis: Mechanistic Concepts and Therapeutic Perspectives. Cells. 2020 Apr 3;9(4):875. doi: 10.3390/cells9040875. PMID: 32260126; PMCID: PMC7226751.Roehlen N, Crouchet E, Baumert TF. Liver Fibrosis: Mechanistic Concepts and Therapeutic Perspectives. Cells. 2020 Apr 3;9(4):875. doi: 10.3390/cells9040875. PMID: 32260126; PMCID: PMC7226751.Hsu CL, Schnabl B. The gut-liver axis and gut microbiota in health and liver disease. Nat Rev Microbiol. 2023;21(11):719733. DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-023-00904-3Hsu CL, Schnabl B. The gut-liver axis and gut microbiota in health and liver disease. Nat Rev Microbiol. 2023;21(11):719733. DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-023-00904-3Изменения кишечной микробиоты на фоне хронической HCV-инфекции в зависимости от генотипа вируса / И.О. Стома, З.А. Цейко, Е.В. Воропаев [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2025. – Т. 22, № 2. – С. 147-160. – DOI 10.51523/2708-6011.2025-22-2-18. – EDN BWDPSM.Izmeneniya kishechnoj mikrobioty na fone hronicheskoj HCV-infekcii v zavisimosti ot genotipa virusa / I. O. Stoma, Z. A. Cejko, E. V. Voropaev [i dr.] // Problemy zdorov’ya i ekologii. – 2025. – T. 22, № 2. – S. 147-160. – DOI 10.51523/27086011.2025-22-2-18. – EDN BWDPSM.Zhang L, Zi L, Kuang T, Wang K, Qiu Z, Wu Z, Liu L, Liu R, Wang P, Wang W. Investigating causal associations among gut microbiota, metabolites, and liver diseases: a Mendelian randomization study. Front Endocrinol (Lausanne). 2023 Jul 5;14:1159148. doi: 10.3389/fendo.2023.1159148. PMID: 37476494; PMCID: PMC10354516.Zhang L, Zi L, Kuang T, Wang K, Qiu Z, Wu Z, Liu L, Liu R, Wang P, Wang W. Investigating causal associations among gut microbiota, metabolites, and liver diseases: a Mendelian randomization study. Front Endocrinol (Lausanne). 2023 Jul 5;14:1159148. doi: 10.3389/fendo.2023.1159148. PMID: 37476494; PMCID: PMC10354516.Li S, Zhou C, Liu T, Zhang L, Liu S, Zhao Q, Liu J, Zhao W. Causal relationships between the gut microbiota, inflammatory cytokines, and alcoholic liver disease: a Mendelian randomization analysis. Front Endocrinol (Lausanne). 2024 Oct 21;15:1442603. doi: 10.3389/fendo.2024.1442603. PMID: 39497803; PMCID: PMC11532067.Li S, Zhou C, Liu T, Zhang L, Liu S, Zhao Q, Liu J, Zhao W. Causal relationships between the gut microbiota, inflammatory cytokines, and alcoholic liver disease: a Mendelian randomization analysis. Front Endocrinol (Lausanne). 2024 Oct 21;15:1442603. doi: 10.3389/fendo.2024.1442603. PMID: 39497803; PMCID: PMC11532067.Baldelli V, Scaldaferri F, Putignani L, Del Chierico F. The Role of Enterobacteriaceae in Gut Microbiota Dysbiosis in Inflammatory Bowel Diseases. Microorganisms. 2021; 9(4):697. https://doi.org/10.3390/microorganisms9040697Baldelli V, Scaldaferri F, Putignani L, Del Chierico F. The Role of Enterobacteriaceae in Gut Microbiota Dysbiosis in Inflammatory Bowel Diseases. Microorganisms. 2021; 9(4):697. https://doi.org/10.3390/microorganisms9040697Taylor, S.J., Winter, M.G., Gillis, C.C. et al. Colonocytederived lactate promotes E. coli fitness in the context of inflammation-associated gut microbiota dysbiosis. Microbiome 10, 200 (2022). https://doi.org/10.1186/s40168-022-01389-7Taylor, S.J., Winter, M.G., Gillis, C.C. et al. Colonocytederived lactate promotes E. coli fitness in the context of inflammation-associated gut microbiota dysbiosis. Microbiome 10, 200 (2022). https://doi.org/10.1186/s40168-022-01389-7Tuomisto, S., Pessi, T., Collin, P. et al. Changes in gut bacterial populations and their translocation into liver and ascites in alcoholic liver cirrhotics. BMC Gastroenterol 14, 40 (2014). https://doi.org/10.1186/1471-230X-14-40Tuomisto, S., Pessi, T., Collin, P. et al. Changes in gut bacterial populations and their translocation into liver and ascites in alcoholic liver cirrhotics. BMC Gastroenterol 14, 40 (2014). https://doi.org/10.1186/1471-230X-14-40Jiang L, Wang J, Liu Z, Jiang A, Li S, Wu D, Zhang Y, Zhu X, Zhou E, Wei Z, Yang Z. Sodium Butyrate Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Inflammatory Responses by DownRegulation of NF-κB, NLRP3 Signaling Pathway, and Activating Histone Acetylation in Bovine Macrophages. Front Vet Sci. 2020 Nov 5;7:579674. doi: 10.3389/fvets.2020.579674. PMID: 33251265; PMCID: PMC7674777.Jiang L, Wang J, Liu Z, Jiang A, Li S, Wu D, Zhang Y, Zhu X, Zhou E, Wei Z, Yang Z. Sodium Butyrate Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Inflammatory Responses by DownRegulation of NF-κB, NLRP3 Signaling Pathway, and Activating Histone Acetylation in Bovine Macrophages. Front Vet Sci. 2020 Nov 5;7:579674. doi: 10.3389/fvets.2020.579674. PMID: 33251265; PMCID: PMC7674777.Derrien M, Vaughan EE, Plugge CM, de Vos WM. Akkermansia muciniphila gen. nov., sp. nov., a human intestinal mucindegrading bacterium. Int J Syst Evol Microbiol. 2004 Sep;54(Pt 5):1469-1476. doi: 10.1099/ijs.0.02873-0. PMID: 15388697.Derrien M, Vaughan EE, Plugge CM, de Vos WM. Akkermansia muciniphila gen. nov., sp. nov., a human intestinal mucindegrading bacterium. Int J Syst Evol Microbiol. 2004 Sep;54(Pt 5):1469-1476. doi: 10.1099/ijs.0.02873-0. PMID: 15388697.Ubeda C, Bucci V, Caballero S, Djukovic A, Toussaint NC, Equinda M, Lipuma L, Ling L, Gobourne A, No D, Taur Y, Jenq RR, van den Brink MR, Xavier JB, Pamer EG. Intestinal microbiota containing Barnesiella species cures vancomycinresistant Enterococcus faecium colonization. Infect Immun. 2013 Mar;81(3):965-73. doi: 10.1128/IAI.01197-12. Epub 2013 Jan 14. PMID: 23319552; PMCID: PMC3584866.Ubeda C, Bucci V, Caballero S, Djukovic A, Toussaint NC, Equinda M, Lipuma L, Ling L, Gobourne A, No D, Taur Y, Jenq RR, van den Brink MR, Xavier JB, Pamer EG. Intestinal microbiota containing Barnesiella species cures vancomycinresistant Enterococcus faecium colonization. Infect Immun. 2013 Mar;81(3):965-73. doi: 10.1128/IAI.01197-12. Epub 2013 Jan 14. PMID: 23319552; PMCID: PMC3584866.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.