Формирование микробиоты детей: ее роль в общем метаболизме
https://doi.org/10.22625/2072-6732-2022-14-1-20-30
Аннотация
Прогресс в изучении микробиома у человека, его влияния на поддержание здоровья рассматривается как одно из наиболее значимых достижений современной биологии и медицины. Изучение населяющих организм бактерий, понимание закономерностей взаимодействия человека с миром микроорганизмов помогут лучше определить их роль в метаболизме, влияние на функционирование различных систем организма, сформировать более точное представление о патогенезе заболеваний, стать основой для профилактики и микробной терапии инфекций, ожирения, диабета.
На качественный и количественный состав микробиома, от которого во многом зависит будущее здоровье человека, влияет способ рождения, характер и тип питания новорожденного.
Об авторах
Л. А. ДжапаридзеРоссия
Джапаридзе Людмила Александровна – старший научный сотрудник, к.б.н.
Санкт-Петербург
О. А. Солдатова
Россия
Солдатова Ольга Александровна – младший научный сотрудник
Санкт-Петербург
Список литературы
1. Шапошникова, Л.И. Микробиота человека как основной физиологический орган / Л.И. Шапошникова // Успехи современного естествознания. – 2006. – № 9. – C. 80–82.
2. Джапаридзе, Л.А. Изучение микробиома человека как основы для коррекции инфекционных и неинфекционных патологий / Л.А. Джапаридзе, А.Н. Суворов // Региональная экология. – 2018. – № 4 (54). – C. 16–27.
3. Беляева, И.А. Онтогенез и дизонтогенез микробиоты кишечника у детей раннего возраста: триггерный механизм нарушений детского здоровья / И.А. Беляева [и др.] // Вопросы современной педиатрии. – 2017. – Т. 16, №1. – C. 29–38.
4. Aagaard K., Ma J., Antony K.M., et al. The Placenta Harbors a Unique Microbiome // Science Translational Medicine. 2014. Vol.6, N 237. P. 237-237. doi:10.1126/scitranslmed.3008599
5. Mayer E.A., Knight R., Mazmanian S.K., et al. Gut microbes and the brain: paradigm shift in neuroscience // J. Neurosci. 2014. N 34. P. 15490–15496. doi:10.1523/JNEUROSCI.3299-14.2014
6. Rajilić-Stojanović M., Heilig H.G., Molenaar D., et al. Development and application of the human intestinal tract chip, a phylogenetic microarray: analysis of universally conserved phylotypes in the abundant microbiota of young and elderly adults // Environmental Microbiology. 2009. Vol. 11, N 7. P. 1736-1751. doi:10.1111/j.1462-2920.2009.01900.x
7. Ardissone A.N., de la Cruz D.M., Davis-Richardson A.G., et al. Meconium Microbiome Analysis Identifies Bacteria Correlated with Premature Birth // PLoS One. 2014. Vol. 9, N 3. e90784. doi:10.1371/journal.pone.0090784
8. Sampson T.R., Debelius J.W., Thron T., et al. Gut Microbiota Regulate Motor Deficits and Neuroinflammation in a Model of Parkinson’s Disease // Cell. 2016. Vol. 167, N 6. P. 1469-1480. e12. doi:10.1016/j.cell.2016.11.018
9. Kang D., Adams J., Gregory A., et al. Microbiota Transfer Therapy alters gut ecosystem and improves gastrointestinal and autism symptoms: an open-label study // Microbiome. 2017. Vol. 5, N 1. doi:10.1186/s40168-016-0225-7
10. Antipov D., Hartwick N., Shen M., et al. PlasmidSPAdes: assembling plasmids from whole genome sequencing data // Bioinformatics. 2016. Vol. 32, N 3. P. 3380-3387. doi:10.1093/bioinformatics/btw493
11. Урсова, Н.И. Актуальные и нерешенные проблемы пробиотикотерапии / Н.И. Урсова // Лечащий врач. – 2013. – Т. 8. – C. 60–65.
12. Николаева, И.В. Формирование кишечной микробиоты ребенка и факторы, влияющие на этот процесс / И.В. Николаева, А.Д. Царегородцев, Г.С. Шайхиева // Российский вестник перинатологии и педиатрии. – 2018. – Т. 63, № 3. – C. 13–18.
13. Landman C., Quévrain E. Gut microbiota: Description, role and pathophysiologic implications // Rev Med Interne. 2016. Vol. 37, N 6. P. 418–423. doi:10.1016/j.revmed.2015.12.012
14. Равин, Н.В. Метагеномика: геномный анализ микроорганизмов без их культивирования / Н.В. Равин // IX Российский симпозиум «Белки и пептиды». Сочи –Дагомыс. – 2019. Спецвыпуск. – Аcta naturae. – 2019. – Т. 2. – С. 5
15. Dominguez-Bello M, Costello E, Contreras M et al. Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns //Proceedings of the National Academy of Sciences. 2010. Vol. 107, N 26. P. 11971-11975. doi:10.1073/pnas.1002601107
16. Satokari R., Grönroos T., Laitinen K., et al. Bifidobacterium and Lactobacillus DNA in the human placenta // Lett Appl Microbiol. 2009. Vol. 48, N 1. P. 8-12. doi: 10.1111/j.1472-765X.2008.02475.x
17. DiGiulio D.B., Romero R, Amogan H.P., et al. Microbial Prevalence, Diversity and Abundance in Amniotic Fluid During Preterm Labor: A Molecular and Culture-Based Investigation //PLoS One. 2008. Vol. 3, N 8. e3056. doi:10.1371/journal.pone.0003056
18. Oh K.J., Lee S.E., Jung H., et al. Detection of ureaplasmas by the polymerase chain reaction in the amniotic fluid of patients with cervical insufficiency // J Perinat Med. 2010. Vol. 38, N 3. P.261-268. doi:10.1515/jpm.2010.040
19. Eckburg P.B. Diversity of the Human Intestinal Microbial Flora // Science. 2005. Vol. 308, N 5728. P. 1635-1638. doi:10.1126/science.1110591
20. Moles L., Gómez M., Heilig H., et al. Bacterial Diversity in Meconium of Preterm Neonates and Evolution of Their Fecal Microbiota during the First Month of Life // PLoS One. 2013. Vol. 8, N 6. e66986. doi:10.1371/journal.pone.0066986
21. Jiménez E., Fernández L., Marín M.L., et al. Isolation of Commensal Bacteria from Umbilical Cord Blood of Healthy Neonates Born by Cesarean Section // Curr Microbiol. 2005. Vol. 51, N 4. P. 270-274. doi:10.1007/s00284-005-0020-3
22. Jiménez E., Marín M.L., Martín R., et al. Is meconium from healthy newborns actually sterile? // Res Microbiol. 2008. Vol. 159, N 3. P. 187-193. doi:10.1016/j.resmic.2007.12.007
23. Антонова, Л.К. Современный взгляд на формирования микробиоты пищеварительного тракта у детей первого года жизни / Л.К. Антонова [и др.] // Современные проблемы науки и образования. – 2018. – № 6. – C. 87.
24. Marcobal A., Sonnenburg J. Human milk oligosaccharide consumption by intestinal microbiota // Clinical Microbiology and Infection. 2012. N 18. P.12-15. doi:10.1111/j.1469-0691.2012.03863.x
25. Underwood M.A., German J.B., Lebrilla C.B., Mills D.A.. Bifidobacterium longum subspecies infantis: champion colonizer of the infant gut // Pediatr Res. 2014. Vol. 77. P 229-235. doi:10.1038/pr.2014.156
26. Mackie R.I., Sghir A., Gaskins H.R. Developmental microbial ecology of the neonatal gastrointestinal tract // Am J Clin Nutr. 1999. Vol. 69, N 5. P. 1035s-1045s. doi:10.1093/ajcn/69.5.1035s
27. Marchesi J.R., Adams D.H., Fava F., et al. The gut microbiota and host health: a new clinical frontier // Gut. 2016. Vol.65, N 2. P. 330-339. doi:10.1136/gutjnl-2015-309990
28. Zhang Y., Zhang H. Microbiota associated with type 2 diabetes and its related complications // Food Science and Human Wellness. 2013. Vol. 2, N 3-4. P. 167-172. doi:10.1016/j.fshw.2013.09.002
29. Yoshida N., Yamashita T., Hirata K. Gut Microbiome and Cardiovascular Diseases // Diseases. 2018. Vol. 6, N 3. P. 56. doi:10.3390/diseases6030056
30. Li Q., Han Y., Dy A.B.C., Hagerman R.J. The Gut Microbiota and Autism Spectrum Disorders // Front Cell Neurosci. 2017. Vol. 11, N 120. doi:10.3389/fncel.2017.00120
31. Shao Y., Forster S.C., Tsaliki E., et al. Stunted microbiota and opportunistic pathogen colonization in caesarean-section birth // Nature. 2019. Vol. 574, N 7776. P. 117-121. doi:10.1038/s41586-019-1560-1
32. Hooper L.V., Littman D.R., Macpherson A.J. Interactions Between the Microbiota and the Immune System // Science. 2012. Vol. 336, N 6086. P. 1268-1273. doi:10.1126/science.1223490
33. Bäckhed F., Roswall J., Peng Y., et al. Dynamics and Stabilization of the Human Gut Microbiome during the First Year of Life // Cell Host Microbe. 2015. Vol. 17, N 5. P. 690-703. doi:10.1016/j.chom.2015.04.004
34. Cong X., Xu W., Romisher R., et al. Gut Microbiome and Infant Health: Brain-Gut-Microbiota Axis and Host Genetic Factors // Yale J Biol Med. 2016. Vol. 89, N 3. P. 299–308.
35. Николаева, И.В. Влияние микрофлоры матери на состав микробиоценоза кишечника ребенка в период грудного вскармливания / И.В. Николаева [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2008. – № 5. – C. 87–92.
36. Yatsunenko T., Rey F.E., Manary M.J., et al. Human gut microbiome viewed across age and geography // Nature. 2012. Vol. 486, N 7402. P. 222-227. doi:10.1038/nature11053
37. Horta B.L., Loret de Mola C., Victora C.G. Long-term consequences of breastfeeding on cholesterol, obesity, systolic blood pressure and type 2 diabetes: a systematic review and meta-analysis // Acta Paediatr. 2015. Vol.104. P. 30-37. doi:10.1111/apa.13133
38. Dorr H., Sittel I. Bacteriological examination of human milk and its relation to mastitis // Zentralbl. Gynakol. 1953. Vol. 75. P.1833–1835.
39. Latuga M.S., Stuebe A., Seed P.C. A Review of the Source and Function of Microbiota in Breast Milk // Semin Reprod Med. 2014. Vol. 32, N 1. P. 068-073. doi:10.1055/s-0033-1361824
40. De Leoz M.L.A., Kalanetra K.M., Bokulich N.A., et al. Human Milk Glycomics and Gut Microbial Genomics in Infant Feces Show a Correlation between Human Milk Oligosaccharides and Gut Microbiota: A Proof-of-Concept Study // J Proteome Res. 2014. Vol. 14, N 1. P. 491-502. doi:10.1021/pr500759e
41. Charbonneau M.R., O’Donnell D., Blanton L.V., et al. Sialylated Milk Oligosaccharides Promote Microbiota-Dependent Growth in Models of Infant Undernutrition // Cell. 2016. Vol. 164, N 5. P. 859-871. doi:10.1016/j.cell.2016.01.024
42. Lif Holgerson P., Harnevik L., Hernell O., et al. Mode of Birth Delivery Affects Oral Microbiota in Infants // J Dent Res. 2011. Vol. 90, N 10. P. 1183-1188. doi:10.1177/0022034511418973
43. Cabrera-Rubio R., Collado M.C., Laitinen K., et al. The human milk microbiome changes over lactation and is shaped by maternal weight and mode of delivery // The American Journal of Clinical Nutrition. 2012. Vol.96, N 3. P.544-551. doi:10.3945/ajcn.112.037382
44. Hunt K.M., Foster J.A., Forney LJ., et al. Characterization of the Diversity and Temporal Stability of Bacterial Communities in Human Milk // PLoS One. 2011. Vol. 6, N 6. e21313. doi:10.1371/journal.pone.0021313
45. Khan M.J., Gerasimidis K., Edwards C.A., Shaikh M.G. Role of Gut Microbiota in the Aetiology of Obesity: Proposed Mechanisms and Review of the Literature // J Obes. 2016. N 2016. P. 1-27. doi:10.1155/2016/7353642
46. FAO/WHO. Evaluation of Health and Nutritional Properties of Probiotics in Food Including Powder Milk with Live Acid Bacteria. Report of a Joint FAO/WHO Expert Consultation; 2001. Córdoba, Argentina.
47. Kadooka Y., Sato M., Imaizumi K., et al. Regulation of abdominal adiposity by probiotics (Lactobacillus gasseri SBT2055) in adults with obese tendencies in a randomized controlled trial // Eur J Clin Nutr. 2010. Vol. 64, N 6. P. 636-643. doi:10.1038/ejcn.2010.19
48. Luoto R., Kalliomäki M., Laitinen K., Isolauri E. The impact of perinatal probiotic intervention on the development of overweight and obesity: follow-up study from birth to 10 years // Int J Obes. 2010. Vol. 34, N 10. P. 1531-1537. doi:10.1038/ijo.2010.50
49. Sun J., Qiao Y., Qi C., et al. High-fat-diet–induced obesity is associated with decreased antiinflammatory Lactobacillus reuteri sensitive to oxidative stress in mouse Peyer’s patches // Nutrition. 2016. Vol. 32, N 2. P. 265-272. doi:10.1016/j.nut.2015.08.020
50. Ley R.E., Bäckhed F., Turnbaugh P., et al. Obesity alters gut microbial ecology // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2005. Vol. 102. N 31. P. 11070-11075. doi:10.1073/pnas.0504978102
51. Qin J., Li R., Raes J., et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing // Nature. 2010. N 464. P.59-65. doi:10.1038/nature08821
52. Казаков, С.В. Анализ геномных и метагеномных данных в образовательных целях / С.В. Казаков, А.А. Шалыто // Компьютерные инструменты в образоавнии. – 2016. – № 3. – C. 5–15.
53. Hu J., Nomura Y., Bashir A., et al. Diversified Microbiota of Meconium Is Affected by Maternal Diabetes Status // PLoS One. 2013. Vol. 8, N 11. e78257. doi:10.1371/journal.pone.0078257
54. Brugman S., Klatter F.A., Visser J.T.J., et al. Antibiotic treatment partially protects against type 1 diabetes in the BioBreeding diabetes-prone rat. Is the gut flora involved in the development of type 1 diabetes? // Diabetologia. 2006. Vol. 49, N 9. P. 2105-2108. doi:10.1007/s00125-006-0334-0
55. Paun A., Yau C., Danska J.S. Immune recognition and response to the intestinal microbiome in type 1 diabetes // J Autoimmun. 2016. Vol. 71. P. 10-18. doi:10.1016/j.jaut.2016.02.004
Рецензия
Для цитирования:
Джапаридзе Л.А., Солдатова О.А. Формирование микробиоты детей: ее роль в общем метаболизме. Журнал инфектологии. 2022;14(1):20-30. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2022-14-1-20-30
For citation:
Dzhaparidzе L.A., Soldatova O.A. Formation of the children microbiota: its role in overall metabolism. Journal Infectology. 2022;14(1):20-30. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2022-14-1-20-30