Генетическая характеристика ротавирусов группы А, циркулирующих в Оренбургском регионе в разные эпидемические сезоны
https://doi.org/10.22625/2072-6732-2021-13-3-82-91
Аннотация
Цель: проанализировать генетическую структуру ротавирусов группы А, циркулирующих на территории Оренбургского региона в разные эпидемические сезоны.
Материалы и методы: генетическая структура ротавирусов по аллелям G/P определена в 341 образце фекалий пациентов с клиникой гастроэнтерита в возрасте до 5 лет в различные эпидемические сезоны. Использовались методы ИФА, ПЦР. Типирование ротавирусов проводилось на базе лаборатории молекулярной диагностики и эпидемиологии кишечных инфекций отдела молекулярной диагностики Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии.
Результаты: определена общая генетическая структура ротавирусов группы А, циркулирующих в Оренбургской области в период 2014—2020 гг., выраженная частотами аллелей G/Р. Генетический потенциал ротавирусов группы А за весь период исследования был представлен 12 вариантами генотипов по G/P аллелям, ведущее значение в эпидемическом процессе имели генотипы с наиболее высокой частотой встречаемости: G4[P]8, G9[P]8, G2[P]4, Mixt. Частота регистрации сочетанных форм различных генотипов ротавирусов (Mixt-формы) составила 5,9%.
Заключение: установлены основные и доминирующие генотипы, их региональное многообразие и межсезонные колебания. Спектр циркулирующих генотипов ротавирусов отличался в различные эпидемические сезоны, показана их эпидемическая значимость.
Об авторе
Н. Б. Денисюк
Оренбургский государственный медицинский университет
Россия
Конфликт интересов:
Россия
Денисюк Нина Борисовна — доцент кафедры эпидемиологии и инфекционных болезней ОрГМУ, доктор медицинских наук.
Оренбург.
Тел.: 8(3532)77-61-03, +7-922-621-12-60
Конфликт интересов:
Нет
Список литературы
1. Mandal, S. Is Rotavirus Gastroenteritis a Global Emerging / Mandal, S., Mandal, MD. //Re-Emerg Probl. Transl. Med. -2014; 4(143): 2161-1025.
2. WHO. Weekly epidemiological record. January, 2018.
3. WHO. Global Invasive Bacterial Vaccine-Preventable Disease and Rotavirus and Pediatric Diarrhea Surveillance Networks Bulletin Weekly epidemiological record. October, 2020.
4. Walker, C.L. Global burden of childhood pneumonia and diarrhea. / Walker, C.L., Rudan, I., Liu, L., Nair, H., Theodoratou, E., Bhutta, Z A., O'Brien, K.L., Campbell, H., Black, R.E.// Lancet. -2015.-381.-P.1405-1416.
5. Брико, Н.И. Глобализация и распространение инфекционных заболеваний / Н.И. Брико, В.И. Покровский, Н.А. Малышев // Прикладная микробиология. - 2015. - Т. 2, № 1 (4). - С. 20-28.
6. Полибин, Р.В. Сравнительный анализ смертности от инфекционных болезней в Российской Федерации и некоторых странах Европы / Р.В. Полибин [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2017. - Т. 16, № 3 (94). - С.4-10.
7. Плоскирева, А.А. Ротавирусная инфекция у детей: эпидемиологические и клинические аспекты на современном этапе / А.А. Плоскирева // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2017. - № 6. - С. 5-10.
8. Литвинчук, О.А. Клинико-эпидемиологические особенности и вопросы терапии острых вирусных кишечных инфекций у детей, связанных с оказанием медицинской помощи : автореф. дисс. ... канд. мед. наук / О.А. Литвинчук. -М., 2015. -24 с.
9. Кудрявцев, В.В. Современные проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции и пути оптимизации эпидемиологического надзора : автореф. дисс. . канд. мед. наук / В.В. Кудрявцев. - М., 2015. - 24 с.
10. Подколзин, А.Т. Сезонные и территориальные особенности распределения заболеваемости ротавирусной инфекцией в РФ / А.Т. Подколзин, Д.Е. Курочкина, Г.А. Шипулин // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2015. -Т.20, № 2. - С. 52-54.
11. Покровский, В.И. Внутрибольничные инфекции: новые горизонты профилактики / В.И. Покровский, В.Г. Акимкин, Н.И. Брико // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2015. - № 1. - С. 4-9.
12. Durmaz, R. Prevalence of Rotavirus Genotypes in Children Younger than 5 Years of Age before the Introduction of a Universal Rotavirus Vaccination Program: Report of Rotavirus Surveillance in Turkey / Durmaz, R., Kalaycioglu, A.T., Acar, S., et al/ // Journal.pone PLOS ONE / December.-2014; 1:19.
13. Gruber, J.F. Heterogeneity of Rotavirus Vaccine Efficacy Among Infants in Developing Countries/Gruber, JF., Hille, DA., Liu, GF., et al.//The Pediatric Infectious Disease Journal. January, 2017.-36(1).-72-78.
14. Dahl, RM. Effect of Rotavirus Vaccination on Acute Diarrheal Hospitalizations Among Low and Very Low Birth Weight US Infants, 2001-2015 / Dahl, RM., Curns, AT., Tate, JE., Parashar, UD. //The Pediatric Infectious Disease Journal. February, 2018 - Volume Publish Ahead of Print.
15. Сашина, Т.А. Филогенетический анализ Российских вариантов ротавируса генотипа G9 / Т.А.Сашина [и др.] // Инфекционные болезни. - 2016. - Т. 14, № S1. - С. 254.
16. Сергеева, А.В. Этиологическая расшифровка вирусных ОКИ в условиях неинфекционного многопрофильного детского стационара / А.В. Сергеева [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2015. - Т.60, № 9. - С. 69-70.
17. Мартынова, Г.П. Анализ генетического разнообразия ротавирусов, циркулирующих на территории г. Ачинска Красноярского края / Г.П. Мартынова, А.Г. Южакова // Материалы IX Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням с международным участием. - М., 2017. - С.169.
18. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Оренбургской области в 2019 году: Государственный доклад. - Оренбург: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Оренбургской области, 2020. - 237 с.
19. Харит, С.М. Оценка бремени ротавирусных гастроэнтеритов как обоснование необходимо плановой вакцинации / С.М. Харит [и др.] // Медицинский совет. - 2017. -№ 4. - С.73-78.
20. Намазова-Баранова, Л.С. Вакцинация против ротавирусной инфекции: 10 летний мировой опыт успешного применения / Л.С. Намазова-Баранова [и др.] // Вопросы современной педиатрии. - 2017. - Т.16., № 4. - С. 273285.
21. Семериков, В.В. Обоснование необходимости массовой вакцинопрофилактики ротавирусной инфекции на отдельной территории / В.В. Семериков, Н.Б. Вольдшмидт, Л.Г.Кудрявцева // Материалы IX Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням с международным участием. - М., 2017. - С.253.
22. Новикова, Н.А. Проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Нижнем Новгороде в предвакцинальный период (2005-2016гг) / Н.А. Новикова [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2017. - № 5. - С. 46-53.
23. Южакова, А.Г. Вакцинопрофилактика ротавирусной инфекции: социальная значимость и эффективность / А.Г.Южакова, Г.П. Мартынова // Журнал инфектологии. - 2017. - Т.9, № 2. -С. 65-71.
24. Черепанова, Е.А. Состояние вакцинопрофилактики кишечных инфекций в Российской Федерации / Е.А. Черепанова, Е.Г. Симонова // Сборник Материалов IX Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням с международным участием. - М., 2017. - С. 308-309.
25. Seheri, L.M. Rotavirus strain diversity in Eastern and Southern African countries before and after vaccine introduction /Seheri, M., Magagula, NB., Peenze, I., Rakau, K., et al. //Vaccine.-2017.-Dec.1.-Epab.2017.
26. Подколзин, А.Т. Эпидемиологическая и клиническая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии в Российской Федерации : автореф. дисс. ... докт. мед. наук / А.Т. Подколзин. - М., 2015. - 44 с.
27. Черепанова, Е.А. Особенности эпидемиологии ротавирусной инфекции в Российской Федерации в 2000-2010 годах / Е.А. Черепанова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - № 2 (63). - С. 38-41.
28. Жираковская, Е.В. Генетическое разнообразие изолятов ротавирусов группы А, выявленных в Западной Сибири в 2007-2011 гг. / Е.В. Жираковская [и др.] //Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2012. -№ 4. - С. 33-41.
29. Епифанова, Н.В. Острые кишечные инфекции вирусной этиологии по данным многолетних наблюдений на территории Нижнего Новгорода / Н.В. Епифанова [и др. // Медицинский алфавит. - 2016. -Т.1, № 6. - С. 30-34.
30. Веселова, О.А. Циркуляция различных G типов ротавирусов грА на территории Российской Федерации 20122013 гг. / О.А. Веселова, А.Т. Подколзин, Г.А. Шипулин // Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции c международным участием «Молекулярная диагностика». - М., 2014. - С. 374-375.
31. Зайцева, Е.В. Результаты мониторинга антигенных типов ротавирусов гр. А на территории Российской Федерации в период 2011-2015 гг. / Е.В. Зайцева [и др.] / Клиническая лабораторная диагностика. - 2016. - Т.61, №7. - С. 445-448.
32. Podkolzin, A.T. Rotavirus grA Surveillance and genotype distribution in Russian Federation in season 2011-2012. Central research Institute of Epidemiology, Enteric Pathogens Monitoring Group (EPMG), Moscow, Russian Federation. 2012. Available on: www.epid-oki.ru.
33. Епифанова, Н.В. Спектр генотипов ротавирусов, циркулировавших на территории Нижнего Новгорода в 2005-2012 годах. Доминирование генотипа g4p[8]/ Н.В. Епифанова [и др.] // Медицинский альманах. - 2014. - № 2 (32). - С. 52-57.
34. Брико, Н.И. Иммунопрофилактика инфекционных болезней в России: состояние и перспективы совершенствования/ Н.И. Брико, И.В. Фельдблюм // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2017. - Т. 16, № 2 (93). -С. 4-9.
35. Бабик, Р.К. Оптимизация диагностики вирусных и бактериальных кишечных инфекций у детей и взрослых / Р.К. Бабик, О.И. Сагалова // Инфекционные болезни. -2015. -Т. 13, № 2. - С. 46-54.
36. Подколзин, А.Т. Интерпретация результатов детекции возбудителей вирусных диарей в режиме Real-Time / А.Т. Подколзин [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2015. - Т. 60, № 6. - С. 52-57.
Рецензия
Для цитирования:
Денисюк Н.Б. Генетическая характеристика ротавирусов группы А, циркулирующих в Оренбургском регионе в разные эпидемические сезоны. Журнал инфектологии. 2021;13(3):82-91. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2021-13-3-82-91
For citation:
Denisyuk N.B. Genetic characteristics of group A rotaviruses circulating in the Orenburg region during various epidemic seasons. Journal Infectology. 2021;13(3):82-91. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2021-13-3-82-91
Просмотров:
521
.png)
.png)
Послать статью по эл. почте 