СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ И ТЕХНОЛОГИИ В ИНФЕКЦИОННОЙ ЭПИДЕМИОЛОГИИ (НА ПРИМЕРЕ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗЫВАЕМЫХ ПАТОГЕННЫМИ СТРЕПТОКОККАМИ)


https://doi.org/10.22625/2072-6732-2012-4-3-88-100

Полный текст:


Аннотация

Данный обзор составлен на основании опыта многолетних исследований отдела молекулярной микробиологии НИИЭМ РАМН по молекулярной идентификации и характеристике патогенных стрептококков, Streptococcus pyogenes и Streptococcus agalactiae. В нем изложены современные подходы и технологии оценки бактериального звена в эпидемиологии широко распространенных стрептококковых заболеваний. Основное внимание уделено генетическому разнообразию возбудителей на генном и геномном уровнях, их генотипированию и роли мигрирующих генетических элементов (умеренные фаги, транспозоны, встраивающиеся последовательности, острова патогенности, плазмиды) в дифференцировке стрептококков и в анализе распространенности признаков болезнетворности. Прослежена взаимосвязь между генотипом возбудителя и вызываемой им патологией. Выдвинуты предложения по учету форм стрептококковых инфекций и регламентированию диагностических средств и подходов.


Об авторе

А. А. Тотолян
Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН, Санкт-Петербург
Россия

заведующий лабораторией генетики микробов отдела молекулярной микробиологии НИИ экспериментальной медицины СЗО РАМН, д.м.н., профессор, академик РАМН; тел.: (812) 234-94-77; (812)234-05-42



Список литературы

1. Саморегуляция паразитарных систем (молекулярно-генетические механизмы) : монография / В.Д. Беляков [и др.]. – Л. : Изд-во Медицина, 1987. – 240 с.

2. Инфекционные болезни и эпидемиология : учебник / В.И. Покровский [и др.]. – М. : Изд-во ГЭТАР-Медиа, 2007. – 816 с.

3. Тотолян, А.А. Стрептококки группы В в патологии человека / А.А. Тотолян, А.Н. Суворов, А.В. Дмитриев. – СПб.: Изд-во Человек, 2010. 212 с.

4. a. Suvorov, A.N. Physical and genetic chromosomal map of an M type 1 strain of Streptococcus pyogenes / A.N. Suvorov, J.J. Ferretti // J. Bacteriol. – 1996. – № 178. – Р. 5546– 5549.

5. Тотолян, А.А. Стрептококки / А.А. Тотолян [и др.] //Клиническая лабораторная диагностика: национальное руководство в 2 т. под ред. В.В. Долгова, В.В. Меньшикова. –М. : ГЭОТАР-Медиа, 2012. – т. II., гл. 21. – С. 417–435.

6. a. Dmitriev, A.V. Physical and genetic chromosomal maps of Streptococcus agalactiae, serotypes II and III; rRNA operon organization / A.V. Dmitriev, A.N. Suvorov, A.A. Totolian // FEMS Microbiol. Lett. – 1998. – № 167. – Р. 33–39.

7. Филатов, Н.Н. Научно-организационные и методические основы эпидемиологического надзора за стрептококковой инфекцией группы А в условиях крупного города /Н.Н. Филатов, Н.И. Брико, И.Л. Шаханина // Ж. микробиол. – 1998. – № 1. – С. 40–43.

8. Thern, A. Interactions between Streptococcus pyogenes and the human immune system : Doctoral dissertation / A. Thern. – Lund, Sweden. : Lund University, 1998. – 56 p.

9. Schmitt, R. Studies of the pathogenesis of IgA nephropathy and Henoch-Schonlein purpura with special reference to Streptococcus pyogenes infections and complement : Doctoral dissertation / R. Schmitt. – Lund, Sweden. : Lund University, 2012. – 89 p.

10. Зациорская, С.Л. Особенности течения беременности и родов, исход для плода и новорожденного у носительниц стрептококка группы В / С.Л. Зациорская, Н.Г. Кошелева // Акуш. и гинек. – 1994. – № 6. – С. 31–33.

11. Саввина, В.А. Эпидемиология и профилактика заболеваний, вызываемых стрептококками группы В у новорожденных : автореф. дис. … канд. мед. наук / В.А. Саввина. – СПб. : СПБГМА им. И.И. Мечникова, 1999. – 19 с.

12. Facklam, R. emm typing and validation of provisional M types for group A streptococci / R. Facklam [et al.] // Emerg. Infect. Dis. – 1999. – № 5. – Р. 247–253.

13. Maiden, M.C. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms / M.C. Maiden [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 1998. – № 95. – Р. 3140–3145.

14. McShen, W.M. Genome sequence of a nephritogenic and highly transformable M49 strain of Streptococcus pyogenes / W.M. McShan [et al.] // J. Bacteriol. – 2008. – № 190. – Р. 7773–7785.

15. Полякова, Е.М. Молекулярно-генетическое сравнение Streptococcus pyogenes типов emm1 и emm12 по набору профаговых генов / Е.М. Полякова [и др.] // Ж. микробиол. – 2009. – № 2. – С. 18–24.

16. Schmidt, H. Pathogenicity islands in bacterial pathogenesis / H. Schmidt, M. Hensel // Clin. Microbiol. Rev. – 2004. – № 17. – Р. 14–56.

17. Schwartz, D.C. Separation of yeast chromosome-sized DNAs by pulsed field gradient gel electrophoresis / D.C. Schwartz, C.R. Cantor // Cell. – 1984. – № 37. – Р. 67–75.

18. Дмитриев, А.В. Геномный полиморфизм стрептококков группы В – возбудителей заболеваний человека и животных : автореф. дисс. … д-ра биол. наук / А.В. Дмитриев. – СПб. : НИИЭМ РАМН, 2004. – 36 с.

19. Ferretti, J.J. Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes / J.J. Ferretti [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2001. – № 98. – Р. 4658–4663.

20. Tettelin, H. Genome analysis of multiple pathogenic isolates of Streptococcus agalactiae for the microbial «pan-genome » / H. Tettelin [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2005. – № 102. – Р. 13950–13955.

21. Johansson, B. Analysis of the molecular interplay between Strepococcus pyogenes and its human host : Doctoral dissertation / B. Johansson. – Lund, Sweden : Lund University, 2006. – 55 p.

22. Dmitriev, A.V. The Rgg regulation of Streptococcus pyogenes influence the utilization of nonglucose carbohydrates, prophage induction, and expression of the NAD-glucohydrolase virulence operon / A.V. Dmitriev [et al.] // J. Bacteriol. – 2006. – V. 188, № 20. – Р. 7230–7241.

23. Дмитриев, А.В. Направленная регуляция патогенных свойств стрептококков / А.В. Дмитриев [и др.] // Мед. акад. журнал. – 2009. – Т. 9, № 4. – С. 50–58.

24. Rozhdestvenskaya, A.S. Inactivation of DNA-response regulator Sak189 abrogates beta-antigen expression and affects virulence of Streptococcus agalactiae / A.S. Rozhdestvenskaya, A.A. Totolian, A.V. Dmitriev // PLoS ONE. – 2010. – V. 5, № 4. – e10212.

25. Рождественская, А.С. Двухкомпонентная регуляторная система Sak188/ Sak189 и её влияние на свойства Streptococcus agalactiae : автореф. … канд. биол. наук / А.С. Рождественская. – СПб. : НИИЭМ РАМН, 2011. – 20 с.

26. Lannergard, J. The hypervariable region of Streptococcus pyogenes M protein escapes antibody attack by antigenic variation and weak immunogenicity / J. Lannergard [et al.] // Cell Host & Microbe. – 2011. – № 10. – Р. 147–157.

27. Полякова, Е.М. Геномный полиморфизм Streptococcus pyogenes разных emm генотипов : автореф. дис. … канд. биол. наук / Е.М. Полякова. – СПб. : НИИЭМ РАМН, 2012. – 18 с.

28. Van der Mee-Marquet, N. Prophagic DNA fragments in Streptococcus agalactiae strains and association with neonatal meningitis / N. van der Mee-Marquet [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2006. – V. 44, № 3. – P. 1049–1058.

29. Suvorov, A.N. Bacteriophage content of M49 strains of Streptococcus pyogenes / A.N. Suvorov [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. – 2009. – V. 294. – P. 9–15.

30. Sun, Y. Comparison of 3-set genotyping system with multilocus sequence typing for Streptococcus agalactiae (group B streptococcus) / Y. Sun, F. Kong, Z. Zhao // J. Clin. Microbiol. – 2005. – V. 43, № 9. – P. 4704–4707.

31. Рождественская, А.С. Использование полиморфизма гена sak0192 S. agalactiae в качестве молекулярно-эпидемиологического маркера / А.С. Рождественская [и др.] // Ж. микробиол. – 2009. – № 5. – С. 38–43.

32. Dmitriev, A. Chromosomal analysis of group B streptococcal clinical strains; bac gene positive strains are genetically homogenous / A. Dmitriev, [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. – 2002. – № 208. – P. 93–98.

33. Dmitriev, A. cpn60 gene based multiplex-PCR assay for simultaneous identification of streptococcal species / A. Dmitriev, M. Bhide, I. Mikula // Acta Vet. Brno. – 2006. – № 75. – Р. 235–240.

34. Dmitriev, A. Clinical diagnosis of group B streptococci by scpB gene based PCR / A. Dmitriev [et al.] // Indian J. Med. Res. – 2004. – № 119 (suppl.). – Р. 233–236.

35. Дмитриев, А.В. Молекулярная эпидемиология патогенных стрептококков группы В / А.В. Дмитриев, Е.В. Шаклеина // Ж. микробиол. – 2003. – № 4 . – С. 83–92.

36. Дмитриев, А.В. Сравнительный анализ интегрированных ДНК последовательностей у штаммов стрептококка группы В / А.В. Дмитриев [и др.] // Мед. Акад. Журн. – 2003. – Т. 3, № 2. – С. 45–48.

37. Shakleina, E. Presence of insertions sequences (IS elements) in group B streptococci of bovine origin /E. Shakleina [et al.] // Indian J. Med. Res. – 2004. – № 119 (suppl.). – P. 126–132.

38. Dmitriev, A. Structure of scpB-lmb intergenic region as criterion for additional classification of human and bovine group B streptococci / A. Dmitriev [et al.] // Acta Vet. Brno. – 2004. – № 73. – Р. 215–220.

39. Суворов, А.Н. Анализ клинических штаммов стрептококков группы В на наличие генов потенциальных адгезинов, локализованных на остравах патогенности / А.Н. Суворов [и др.] // Ж. акуш. женск. болезней. – 2005. – № 45. – С. 50–56.

40. Kuleshevich, E.V. The analysis of group B streptococcal gene sspB1 localized on pathogenicity island / E.V. Kuleshevich [et al.] // Abstract book of XVIII Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases, Palermo, Italy. – 2011. – P. 170.

41. Dmitriev, A. Adjacent location of the bac gene and twocomponent regulatory system genes within the putative Streptococcus agalactiae pathogenicity island / A. Dmitriev [et al.] // Folia microbial. – 2006. – № 51. – Р. 229–235.

42. Полякова, Е.М. Ранее не обнаруженый транспозон штаммов Streptococcus pyogenes, устойчивых к действию тетрациклина / Е.М. Полякова, А.В. Дмитриев // Вестник СПб МАПО. – 2011. – Т. 3, № 3. – С. 68–73.

43. Голубков, В.И. Выделение и характеристика плазмиды, детерминирующей множественную резистентность к антибиотикам штаммов стрептококка группы А / В.И. Голубков [и др.] // Молекул. биол. – 1977. – Т. 2, № 4. – С. 909–915.

44. Boitsov, A. Restriction endonuclease analysis of group A streptococcal plasmids determining resistance to MLS antibiotics / A. Boitsov [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. – 1979. – № 6. – Р. 5–9.

45. Boitsov, A. Inverted repeates on plasmids determining resistance to MLS antibiotics in group A streptococci / A. Boitsov [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. – 1979. – № 6. – Р. 11–14.

46. Totolian, A. The genetic control of virulence markers in group A streptococci. II. Triggering effect of plasmids / A. Totolian, L. Burova, P. Christensen // Acta pathol. microbial. Scand. SB. – 1983. – № 91. – Р. 61–67.

47. Тоtоlian, А. The genetic control of virulence markers in group A streptococci. III. Plasmid induced switch off effect / A. Totolian [et al.] // Acta pathol. microbial. Scand. SB. – 1984. – № 92. – Р. 65–69.

48. Голубков, В.И. Новый класс криптических плазмид стрептококка группы А и их использование в качестве векторных репликонов / В.И. Голубков, А.А. Тотолян // Молекул. биол. – 1983. – Вып.1. – С. 136–142.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Тотолян А.А. СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ И ТЕХНОЛОГИИ В ИНФЕКЦИОННОЙ ЭПИДЕМИОЛОГИИ (НА ПРИМЕРЕ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗЫВАЕМЫХ ПАТОГЕННЫМИ СТРЕПТОКОККАМИ). Журнал инфектологии. 2012;4(3):88-100. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2012-4-3-88-100

For citation: Totolian A.A. Modern approaches and technologies in infectious epidemiology (as an example, infections caused by pathogenic streptococci). Journal Infectology. 2012;4(3):88-100. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2012-4-3-88-100

Просмотров: 274

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-6732 (Print)
ISSN 2499-9865 (Online)