РАЗНООБРАЗИЕ ГЕНОВАРИАНТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У ВОЕННОСЛУЖАЩИХ


https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-3-46-53

Полный текст:


Аннотация

Цель: проанализировать распределение генотипов и субгенотипов вируса гепатита В среди военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В.
Материалы и методы. В работе были использованы образцы плазмы крови и биопсийного материала тканей печени от 90 действующих или отставных военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В с различной активностью фиброза, проходящих обследование в клинике инфекционных болезней военно-медицинской академии имени С.М. Кирова (Санкт-Петербург, Россия).
Для выявления ВГВ выделяли нуклеиновые кислоты (НК) с использованием коммерческого набора «АмплиПрайм Рибо-преп» (ФБУН ЦНИИЭ, Москва). Для амплификации и секвенирующей реакции использовали перекрывающиеся пары специфических праймеров, совместно фланкирующие фрагмент протяженностью 1475 пар оснований (п.о.), включающий рекомендованную для генотипирования ВГВ регион Pre-S1/Pre-S2/S протяженностью 1169 п.о.
Результаты. Во всех 90 образцах биологического материала выявлена ДНК ВГВ следующих генотипов: D2 – 45,6% (n=41), D1 – 32,2% (n=29), D3 – 13,3% (n=12), А2 – 6,7% (n=6), D4 и А1 по 1,1% соответственно. Распределение субгенотипов ВГВ, обнаруженных в материале пациентов из Северо-Кавказского федерального округа (D1 – 63,6%, D2, D3, D4, A2 – по 9,1%), достоверно отличалось от распределения субгенотипов изолятов, полученных от пациентов из Центрального и СевероЗападного федеральных округов (D1 – 20,9%, D2 – 58%,  3 – 16,3%, A2 – 4,8%) (
χ2=11,9 при p=0,0076, df=3). Выявлены нехарактерные для РФ субгенотипы D4 и А1, представляющие собой единичные завозные случаи. Обсуждается тенденция к смещению распределения геновариантов за счет завозов ВГВ соответствующих субгенотипов из других стран, в том числе стран Средней Азии.
Заключение. Систематическое изучение филогении изолятов ВГВ позволяет получить новую информацию об особенностях распространения субгенотипов ВГВ среди отдельных групп населения, в том числе военнослужащих.


Об авторах

Ю. В. Останкова
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

Останкова Юлия Владимировна – научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

тел.: 8(812)233-20-92, +7-921-353-81-73

Санкт-Петербург



А. В. Семенов
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова; Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова
Россия

Семенов Александр Владимирович – заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, заместитель директора по инновационной работе Санкт-Петербургского научно- исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера;

доцент кафедры иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова;

доцент кафедры клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, д.б.н.

тел.: 8(812) 233-34-83

Санкт-Петербург



Е. Б. Зуева
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

Зуева Елена Борисовна – старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной вирусологии, к.б.н.

тел.: 8(812) 233-20-92

Санкт-Петербург



И. А. Габдрахманов
Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова
Россия

Габдрахманов Ильнур Адисович – начальник научно-исследовательской лаборатории НИЦ, к.м.н.

тел.: +7-921-885-37-57

Санкт-Петербург



К. В. Козлов
Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова
Россия

Козлов Константин Владимирович – доцент кафедры инфекционных болезней с курсом медицинской паразитологии и тропических заболеваний, д.м.н.

тел.: 8(812)271-87-26

Санкт-Петербург



К. В. Жданов
Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова
Россия

Жданов Константин Валерьевич – начальник кафедры инфекционных болезней с курсом медицинской паразитологии и тропических заболеваний, д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН

тел.: 8(812)271-87-26

Санкт-Петербург



А. А. Тотолян
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова
Россия

Тотолян Арег Артемович – заведующий лабораторией молекулярной иммунологии, директор Санкт-Петербургского научно- исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени
Пастера;

заведующий кафедрой иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова, д.м.н., профессор, академик РАН

тел.: 8(812) 232-00-66

Санкт-Петербург



Список литературы

1. Schweitzer A., Horn J., Mikolajczyk R.T., Krause G., Ott J.J. Estimations of worldwide prevalence of chronic hepatitis B virus infection: a systematic review of data published between 1965 and 2013. Lancet. 2015. 386(10003). P:1546-1555. doi: 10.1016/S0140-6736(15)61412-X.

2. Perz J.F., Armstrong G.L., Farrington L.A., Hutin Y.J., Bell B.P. The contributions of hepatitis B virus and hepatitis C virus infections to cirrhosis and primary liver cancer worldwide. J. Hepatol. 2006. 45. P:529–538. doi: 10.1016/j.jhep.2006.05.013.

3. Alavian S.M. Military personals should be vaccinated against hepatitis B infection. J. Arch Mil Med. 2013. v.2(1):e16450.

4. Губерницкая, С.В. Сексуальное поведение и распространенность возбудителей урогенитальных инфекций у военнослужащих / С.В. Губерницкая, О.С. Сахаров, И.Г. Мосягин // Экология человека. – 2011. – №11 – С. 25–28.

5. Kramvis A, Arakawa K, Yu MC, Nogueira R, Stram DO, Kew MC. Relationship of serological subtype, basic core promoter and precore mutations to genotypes/subgenotypes of hepatitis B virus. J Med Virol. 2008;80:27–46.

6. Lin C.-L. Kao J.-H. Hepatitis B Virus Genotypes and Variants. Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2015. v. 5, № 5. P.a021436–a021436.

7. Norder H., Couroucé A.-M., Coursaget P., Echevarria J. M., Lee S.-D., Mushahwar I. K., Robertson B. H., Locarnini S., Magnius L. O. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes. Intervirology. 2004. V. 47, № 6. P.289–309.

8. Tatematsu K., Tanaka Y., Kurbanov F., Sugauchi F., Mano S., Maeshiro T., Nakayoshi T., Wakuta M., Miyakawa Y., Mizokami M. A genetic variant of hepatitis B virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new genotype J. J. Virol. 2009. 83(20). P. 10538-10547.

9. Brichler S., Lagathu G., Chekaraou M.A., Le Gal F., Edouard A., Dény P., Césaire R., Gordien E. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique. J. Gen. Virol. 2013. vol. 94 (Pt 10). P. 2318-2329.

10. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution. 2016, vol. 33, №7. P. 1870-1874.

11. Kuo A., Gish R. Chronic hepatitis B infection. Clin. Liver Dis. 2012. V. 16, № 2. P.347–369.

12. Елпаева, Е.А. Генотипическая характеристика вируса гепатита В у хронически инфицированных больных / Е. А. Елпаева [и др.] // Дальневосточный Журнал Инфекционной Патологии. – 2009. – № 15 – С. 56–59.

13. Баяндин, Р.Б. Генотипическое разнообразие изолятов и факторы риска инфекции вирусом гепатита В у отдельных групп населения Новосибирской области / Р.Б. Баяндин [и др.] // Инфекционные болезни. – 2004. – Т. 2, № 3. – С. 39–44.

14. Abe K., Hayakawa E., Sminov A.V., Rossina A.L., Ding X., Huy T.T., Sata T., Uchaikin V.F. Molecular epidemiology of hepatitis B, C, D and E viruses among children in Moscow, Russia. Journal of Clinical Virology. 2004. v.30, №1. P. 57-61.

15. Flodgren E., Bengtsson S., Knutsson M., Strebkova E.A., Kidd A.H., Alexeyev O.A., Kidd-Ljunggren K. Recent high incidence of fulminant hepatitis in Samara, Russia: molecular analysis of prevailing hepatitis B and D virus strains. J. Clin. Microbiol. 2000. 38(9). P.3311-2316.

16. Кочнева, Г.В. Этиология острых гепатитов и генотипическое разнообразие вирусов гепатитов А, В, С и Е в трех регионах Сибири / Г.В. Кочнева [и др.] // Инфекционные болезни. – 2005. – Т. 3, № 1. – С. 26–31.

17. Чуланов, В.П. Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В. Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук. – Москва. – 2013. – 47 с.

18. Лобзин, Ю.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика гепатита В в Республике Саха (Якутия) / Ю.В. Лобзин, С.С. Слепцова, М.Н. Алексеева, А.Г. Рахманова // Инфекционные болезни. – 2004. – Т. 2, № 2. – C. 13–16.

19. Кузин, С.Н. Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия) / С.Н. Кузин [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика, – 2008. – Т. 42, № 5. – С. 10–15.

20. Tallo T., Tefanova V., Priimagi L., Schmidt J., Katargina O., Michailov M., Mukomolov S., Magnius L., Norder H. D2: major subgenotype of hepatitis B virus in Russia and the Baltic region. Journal of General Virology. 2008. V. 89. P. 1829-1839.

21. Заботина, Е.Е. Эпидемиологические и молекулярно-генетические аспекты гепатитов В и С (по материалам Владимирской области) : Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Е.Е. Заботина. – М., 2011. – 133 с.

22. Bokharaei-Salim F., Keyvani H., Monavari S.H., Esghaei M., Fakhim S., Pirkooh A. Ataei, Behnava B. Distribution of hepatitis B virus genotypes in azerbaijani patients with chronic hepatitis B infection. Hepat. Mon. 2014. vol.14(12). P.e25105.

23. Азимова, С. Особености клинического течения хронического вирусного гепатита HBV в зависимости от его генотипов / С. Азимова [и др.] // Доклады Академии Наук Республики Таджикистан. – 2011. – Т. 54, № 5. – С. 414–418.

24. Maddalena D. C., Giambelli C., Tanzi E., Colzani D., Schiavini M., Milazzo L., Bernini F., Ebranati E., Cargnel A., Bruno R., Galli M., Zehender G. High level of genetic heterogeneity in S and P genes of genotype D hepatitis B virus. Virology. 2007. 365. P.113-124.

25. Семенов, А.В. К вопросу о молекулярной эпидемиологии гепатита B в Республике Саха (Якутия) / А.В. Семенов [и др.] // Журнал инфектологии. – 2016. – Т. 8, № 1. – C. 57–65.

26. Andernach I.E., Nolte C., Pape J.W., Muller C.P. Slave Trade and Hepatitis B Virus Genotypes and Subgenotypes in Haiti and Africa. Emerg Infect Dis. 2009. vol.15. P. 1222–1228.

27. Гасич, Е.Л. Генотипы вируса гепатита В, циркулирующие в республике Беларусь / Е.Л. Гасич [и др.] // Здравоохранение (Минск). – 2012. – № 11. – С. 48–55.

28. Banerjee P., Mondal R. K., Nandi M., Ghosh S., Khatun M., Chakraborty N., Bhattacharya S., RoyChoudhury A., Banerjee S., Santra A., Sil S., Chowdhury A., Bhaumik P., Datta S. A. Rare HBV Subgenotype D4 with Unique Genomic Signatures Identified in North-Eastern India – An Emerging Clinical Challenge? PLoS One. 2014. vol.9(10). P. e109425.

29. Kramvis A., Paraskevis D. Subgenotype A1 of HBV-tracing human migrations in and out of Africa. Antivir Ther. 2013. vol.18(3 Pt B). P.513-521.

30. Hundie G.B., Raj V.S., Michael D.G., Pas S.D., Osterhaus A.D., Koopmans M.P., Smits S.L., Haagmans B.L. Molecular epidemiology and genetic diversity of hepatitis B virus in Ethiopia. J. Med Virol. 2016. vol.88(6). P.1035-1043.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Останкова Ю.В., Семенов А.В., Зуева Е.Б., Габдрахманов И.А., Козлов К.В., Жданов К.В., Тотолян А.А. РАЗНООБРАЗИЕ ГЕНОВАРИАНТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У ВОЕННОСЛУЖАЩИХ. Журнал инфектологии. 2019;11(3):46-53. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-3-46-53

For citation: Ostankova Y.V., Semenov A.V., Zueva E.B., Gabdrakhmanov I.A., Kozlov K.V., Zhdanov K.V., Totolian A.A. Variety of the hepatitis B virus genovariants in the military. Journal Infectology. 2019;11(3):46-53. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-3-46-53

Просмотров: 60

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-6732 (Print)
ISSN 2499-9865 (Online)