К ВОПРОСУ О МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭПИДЕМИОЛОГИИ ГЕПАТИТА B В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)
Аннотация
Цель: оценить распространенность генетических вариантов и особенности молекулярной эпидемиологии вируса гепатита В (ВГВ) у жителей Якутии с диагнозом «Хронический вирусный гепатит В (ХВГВ)».
Материалы и методы: обследовано 35 пациентов с хроническим вирусным гепатитом В из городских и сельских районов республики Саха, при этом большую часть группы составили представители автохтонного населения. В настоящем исследовании мы применили генотипирование на основе прямого секвенирования Pre-S1/ Pre-S2/S области ДНК ВГВ.
Результаты: на основании филогенетического анализа изолятов показано, что среди обследованных больных ХВГВ выявлен только генотип D, являющийся наиболее распространенным генотипом ВГВ в РФ. При этом показано преобладание ВГВ субтипа D2 (85,8%) по сравнению с ВГВ субтипа D3 (14,2%).
Заключение: выявленные нами четко кластеризующиеся группы изолятов ВГВ и тесные связи внутри групп говорят о существовании как минимум четырех постоянных источников инфицирования, действующих на протяжении нескольких лет и десятилетий. Систематическое применение комплекса молекулярных, вирусологических, эпидемиологических методов и молекулярной филогенетики дает дополнительную клиническую информацию, способствует углублению понимания особенностей эпидемического процесса по ВГВ, а также совершенствованию системы эпидемиологического надзора.
Ключевые слова
Об авторах
А. В. СеменовРоссия
заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, доцент кафедры иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, к.б.н.; тел.: 8(812)233-20-92
Ю. В. Останкова
Россия
научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; тел.: 8(812)233-20-92
В. В. Герасимова
Россия
врач-вирусолог высшей квалификационной категории, научный сотрудник учебно-научной лаборатории «Геномная медицина» клиники медицинского института Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова; тел.: +7(4112)36-05-04
М. А. Бичурина
Россия
заведующая лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, д.м.н.; тел.: 8(812)233-21-56
С. Л. Мукомолов
Россия
А. В. Козлов
Россия
заведующий кафедрой клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, д.м.н., профессор; тел.: 8(812)275-19-01
А. А. Тотолян
Россия
Конфликт интересов: заведующий лабораторией молекулярной иммунологии Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, заведующий кафедрой иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова, д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН; тел.: 8(812)232-00-66
Список литературы
1. Нечаев, В.В. Хронические вирусные гепатиты: прошлое, настоящее, будущее / В.В. Нечаев, С.Л. Мукомолов, В.Ю. Назаров, Л.Н. Пожидаева, В.В. Чахарьян // Эпидемиология и инфекционные болезни. – 2013. – № 3. – C. 4-10.
2. World Health Organization. Hepatitis B factsheet N°204 Updated July 2015. [Internet] Geneva: WHO, 2015. Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs204/en/
3. Hepatitis B general fact sheet. Centre for Disease Control and Prevention. 2010; Publication №. 21-1073.
4. Yuen, M.F. Hepatitis B virus genotypes: natural history and implications for treatment / M.F. Yuen, C.L. Lai // Expert Rev. Gastroenterol. Hepatol. – 2007. – vol. 1. – P. 321–328.
5. Мукомолов, С.Л. Применение иммуноглобулина против гепатита в для профилактики этой инфекции / С.Л. Мукомолов, М.И. Михайлов // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2014. – № 1. – С. 47-54.
6. Елпаева, Е.А. Генотипическая характеристика вируса гепатита В у хронически инфицированных больных / Елпаева Е.А., Порецкова Е.А., Писарева М.А., Ковеленов А.Ю., Аликян И.С., Гальбрайх Р.Б., Грудинин М.П., Эсауленко Е.В. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2009. – № 15. – С. 55-58.
7. Khan, A. Epidemiological and clinical evaluation of hepatitis B, hepatitis C, and delta hepatitis viruses in Tajikistan / A. Khan, F. Kurbanov, Y. Tanaka, A. Elkady, M. Sugiyama, A. Dustov, M. Mizokami // J. Med. Virol. – 2008. – vol. 80 (2). – P. 268-276.
8. Kato, H. Hepatitis B virus genotypes in Uzbekistan and validity of two different systems for genotyping / H. Kato, R. Ruzibakiev, N. Yuldasheva, T. Hegay, F. Kurbanov, B. Achundjanov, L. Tuichiev, S. Usuda, R. Ueda, M. Mizokami // J. Med. Virol. – 2002. – vol. 67 (4). – P. 477-483.
9. Елпаева, Е. А. Роль мутантных форм вируса гепатита В в прогрессирующем течении хронического гепатита В / Е. А. Елпаева, М. М. Писарева, О. Е. Никитина, С. Н. Кижло, М. П. Грудинин, О. П. Дуданова // Ученые записки Петрозаводского Государственного университета. Cерия: естественные и технические науки. – 2014. – т. 6. – C. 41-46.
10. Писарева, М. М. Молекулярно-биологические особенности вируса гепатита B дикой и мутантной форм в трех регионах Российской Федерации: автореф. дис. … канд. биол. наук / М. М. Писарева. – СПб., 2007. – 110 с.
11. Guirgis, B.S.S., Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical implications / B.S.S. Guirgis, R.O. Abbas, H.M.E. Azzazy // Int. J. Infect. Dis. – 2010. – vol. 14. – P. 941-953.
12. Семенов, А.В., Молекулярно-эпидемиологические особенности изолятов вируса гепатита С из разных регионов Республики Саха (Якутия) / Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л., Тотолян Арег А. // Инфекция и иммунитет. – 2015. – Т. 5. № 4. – С. 359-372.
13. Brichler, S. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique / S. Brichler, G. Lagathu, M.A. Chekaraou, F. Le Gal, A. Edouard, P. Dény, R. Césaire, E. Gordien // J. Gen. Virol. – 2013. – vol. 94 (Pt 10). – P. 2318-2329.
14. Higgins, D.G. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment / D.G. Higgins, A.J. Bleasby, R. Fuchs // Comput. Appl. Biosci. – 1992. – vol. 8. – P. 189–191.
15. Tamura, K. Nei: MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D.
16. Peterson, N. Peterson, G. Stecher // Mol. Biol. Evol. – 2011. – vol. 28. – P. 2731–2739.
17. Deterding, K. Prevalence of HBV genotypes in Central and Eastern Europe / K. Deterding, I. Constantinescu, F.D. Nedelcu, J. Gervain, V. Nemecek, O. Srtunecky, A. Vince, I. Grgurevic, K.P. Bielawski, M. Zalewska // J. Med. Virol. – 2008. – vol. 80. – P. 1707–1711.
18. Dzierzanowska-Fangrat, K. Hepatitis B virus genotypes in children with chronic hepatitis B in Poland / K. Dzierzanowska- Fangrat, M. Woynarowski, I. Szczygielska, P. Jozwiak, J. Cielecka-Kuszyk, D. Dzierzanowska, K. Madalinski // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. – 2006. – vol. 18. – P. 655–658.
19. Индеева, Л.Д. Эпидемиологическая и клинико-морфологическая характеристика гепатитов B и C и гетерогенность их возбудителей в Республике Саха (Якутия): автореф. дис. ... канд. мед. Наук / Л.Д. Индеева. – М., 2010. – 25 с.
20. Кузин, С.Н. Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия) / С.Н. Кузин, Н.Н. Забелин, Е.И. Самохвалов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2008. – т. 5. – С. 1–5.
21. Морозов, В. М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса гепатита В, циркулирующих в Санкт-Петербурге и Якутии: автореф. дис. … канд. биол. наук / В. М. Морозов. – СПб., 2003. – 127 с.
22. Зотова, А.В. Распространенность вирусных гепатитов В и С среди оленеводов-кочевников в Республике Саха (Якутия) / А.В. Зотова, О.Е. Попова, К.К. Кюрегян // Материалы VII Российской научно-практической конференции с международным участием “Вирусные гепатиты – эпидемиология, диагностика, лечение и профилактика”. – 2007. – С. 28–29.
23. Мануйлов, В.А. Различная встречаемость субгенотипов вируса гепатита В и субтипов HBsAg у коренного населения Сибири / В.А. Мануйлов, Е.В. Чуб, И.Г. Нетесова // Материалы VII Российской научно-практической конференции с международным участием “Вирусные гепатиты – эпидемиология, диагностика, лечение и профилактика”. – 2007. – C. 45–46.
24. Ramachandran, S. Recent Population Expansions of Hepatitis B Virus in the United States / S. Ramachandran, M.A. Purdy, G. Xia, D.S. Campo, Z.E. Dimitrova, E.H. Teshale, Ch.G. Teo, Y.E. Khudyakov // Virol. – 2014. – vol. 88 (24). – P. 13971–13980.
25. Tallo, T. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova, T. Krispin, L. Priimagi, S. Mukomolov, M. Mikhailov, L. O. Magnius // J. Med. Virol. – 2004. – vol. 74. – P. 221–227.
26. Герасимова, В.В. Молекулярная эпидемиология вируса гепатита В в Якутии / В.В. Герасимова, Н.Р. Максимова, И.А. Левакова, С.Л. Мукомолов // Якутский медицинский журнал. – 2014. – № 3 (47). – С. 54-57.
27. De Maddalena, C. High level of genetic heterogeneity in S and P genes of genotype D hepatitis B virus / C. De Maddalena, C. Giambelli, E. Tanzi, D. Colzani, M. Schiavini, L. Milazzo, F. Bernini, E. Ebranati, A. Cargnel, R. Bruno, M. Galli, G. Zehender // Virology. – 2007. – vol. 365. – P. 113-124.
28. Bissinger, A.L. Epidemiology and Genotyping of Patients with Chronic Hepatitis B: Genotype Shifting Observed in Patients from Central Europe / A.L. Bissinger, C. Fehrle, C.R. Werner, U.M. Lauer, N.P. Malek, C.P. Berg // Pol. J. Microbiol. – 2015. – vol. 64(1). – P. 15-21.
29. Khan, A. Novel point mutations and mutational complexes in the enhancer II, core promoter and precore regions of hepatitis B virus genotype D1 associated with hepatocellular carcinoma in Saudi Arabia / Khan A., Al Balwi M.A., Tanaka Y., Hajeer A., Sanai F.M., Al Abdulkarim I., Al Ayyar L., Badri M., Saudi D., Tamimi W., Mizokami M., Al Knawy B. // Int. J. Cancer. – 2013. – vol. 133 (12). – P. 2864-2871.
30. Banerjee, P. A Rare HBV Subgenotype D4 with Unique Genomic Signatures Identified in North-Eastern India – An Emerging Clinical Challenge? / Banerjee P., Mondal R. K., Nandi M., Ghosh S., Khatun M., Chakraborty N., Bhattacharya S., RoyChoudhury A., Banerjee S., Santra A., Sil S., Chowdhury A., Bhaumik P., Datta S. // PLoS One. – 2014. – vol. 9 (10). e109425.
Рецензия
Для цитирования:
Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Мукомолов С.Л., Козлов А.В., Тотолян А.А. К ВОПРОСУ О МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭПИДЕМИОЛОГИИ ГЕПАТИТА B В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ). Журнал инфектологии. 2016;8(1):57-65.
For citation:
Semenov A.V., Ostankova Yu.V., Gerasimova V.V., Bichurina M.A., Mukomolov S.L., Kozlov A.V., Totolian A.A. For the question about Molecular Epidemiology of Hepatitis B Virus Infection in the Republic Sakha (Yakutia). Journal Infectology. 2016;8(1):57-65. (In Russ.)