Влияние вирусной нагрузки на состав кишечной микробиоты при хронической HCV-инфекции: метагеномный анализ с учетом пола и возраста пациентов

Цель: выявить специфические особенности состава кишечной микробиоты, ассоциированные с высокой и низкой вирусной нагрузкой у пациентов с хронической HCV-инфекцией, с учетом пола и возраста.

Материалы и методы: проведено одноцентровое поперечное клиническое исследование, в которое включено 124 пациента с хроническим гепатитом С. В рамках исследования определен состав микробного разнообразия кишечника методом метагеномного секвенирования 16S рРНК. Высокопроизводительное секвенирование проводилось с помощью генетического анализатора MiSeq (Illumina, США) с использованием протокола, основанного на анализе вариабельных регионов гена 16S рРНК. Данные анализировали с использованием Kraken2. Уровень значимости принят равным 0,05.

Результаты: описаны особенности кишечной микробиоты у пациентов с хроническим гепатитом С в зависимости от уровня вирусной нагрузки. В группе пациентов с низкой вирусной нагрузкой наблюдалось увеличение разнообразия условно-патогенных бактерий, включая представителей оральной микробиоты Prevotella (padj = 0,129) и Gemella (padj = 0,124), маркеров воспаления Burkholderia (padj =0,035), Haemophilus (padj = 0,143) и Paraclostridium (padj = 0,035) и маркеров замедленной моторики желудочно-кишечного тракта (Sarcina (padj = 0,035)). У пациентов с высокой вирусной нагрузкой отмечено относительное увеличение представленности провоспалительных и потенциально патогенных таксонов, таких как Stenotrophomonas (padj = 0,106) и Nitratidesulfovibrio (padj = 0,121).

Заключение: проведенное исследование демонстрирует, что вирусная нагрузка при хронической HCV-инфекции ассоциирована с качественно разными сдвигами в кишечной микробиоте. Полученные данные позволяют предположить, что при высокой вирусной нагрузке изменения кишечной микробиоты преимущественно опосредованы системным воспалением, в то время как при низкой вирусной нагрузке они в большей степени отражают структурные изменения в печени.

1. Sallam M., Khalil R. Contemporary Insights into Hepatitis C Virus: A Comprehensive Review. Microorganisms. 2024;12:1035. doi: 10.3390/microorganisms12061035.

2. Smirne C, Crobu MG, Landi I, Vercellino N, Apostolo D, Pinato DJ, Vincenzi F, Minisini R, Tonello S, D’Onghia D, Ottobrelli A, Martini S, Bracco C, Fenoglio LM, Campanini M, Berton AM, Ciancio A, Pirisi M. Chronic Hepatitis C Infection Treated with Direct-Acting Antiviral Agents and Occurrence/ Recurrence of Hepatocellular Carcinoma: Does It Still Matter? Viruses. 2024 Dec 10;16(12):1899. doi: 10.3390/v16121899. PMID: 39772206; PMCID: PMC11680226.

3. Стома И.О. Микробиом в медицине: руководство для врачей. Москва; 2024. 320 с.

4. Schwenger KJ, Clermont-Dejean N, Allard JP. The role of the gut microbiome in chronic liver disease: the clinical evidence revised. JHEP Rep. 2019 Jul 31;1(3):214-226. doi: 10.1016/j.jhepr.2019.04.004. PMID: 32039372; PMCID: PMC7001555.

5. Rodríguez JM, Murphy K, Stanton C, Ross RP, Kober OI, Juge N, Avershina E, Rudi K, Narbad A, Jenmalm MC, Marchesi JR, Collado MC. The composition of the gut microbiota throughout life, with an emphasis on early life. Microb Ecol Health Dis. 2015 Feb 2;26:26050. doi: 10.3402/mehd.v26.26050. PMID: 25651996; PMCID: PMC4315782.

6. Стома И. О., Цейко З. А., Воропаев Е. В. и др. Изменения кишечной микробиоты на фоне хронической HCV-инфекции в зависимости от генотипа вируса // Проблемы здоровья и экологии. – 2025. – Т. 22, № 2. – С. 147-160. – DOI: 10.51523/2708-6011.2025-22-2-18. – EDN BWDPSM.

7. Könönen E, Fteita D, Gursoy UK, Gursoy M. Prevotella species as oral residents and infectious agents with potential impact on systemic conditions. J Oral Microbiol. 2022 May 26;14(1):2079814. doi: 10.1080/20002297.2022.2079814. PMID: 36393976; PMCID: PMC9662046.

8. Lam-Himlin D, Tsiatis AC, Montgomery E, Pai RK, Brown JA, Razavi M, Lamps L, Eshleman JR, Bhagavan B, Anders RA. Sarcina organisms in the gastrointestinal tract: a clinicopathologic and molecular study. Am J Surg Pathol. 2011 Nov;35(11):1700-5. doi: 10.1097/PAS.0b013e31822911e6. PMID: 21997690; PMCID: PMC3193598.

9. Sfeir MM. Burkholderia cepacia complex infections: More complex than the bacterium name suggest. J Infect. 2018 Sep;77(3):166-170. doi: 10.1016/j.jinf.2018.07.006. Epub 2018 Jul 24. PMID: 30012345.

10. Al Bander Z, Nitert MD, Mousa A, Naderpoor N. The Gut Microbiota and Inflammation: An Overview. Int J Environ Res Public Health. 2020 Oct 19;17(20):7618. doi: 10.3390/ijerph17207618. PMID: 33086688; PMCID: PMC7589951.

11. Gibb J, Wong DW. Antimicrobial Treatment Strategies for Stenotrophomonas maltophilia: A Focus on Novel Therapies. Antibiotics (Basel). 2021 Oct 9;10(10):1226. doi: 10.3390/antibiotics10101226. PMID: 34680807; PMCID: PMC8532924.

12. Dordević D, Jančíková S, Vítězová M, Kushkevych I. Hydrogen sulfide toxicity in the gut environment: Meta-analysis of sulfate-reducing and lactic acid bacteria in inflammatory processes. J Adv Res. 2020 Mar 17;27:55-69. doi: 10.1016/j.jare.2020.03.003. PMID: 33318866; PMCID: PMC7728594.