Чувствительность к антибиотикам сальмонелл-доминирующих сероваров, выделенных в Северо-Западном федеральном округе РФ в 2004–2018 гг. из различных источников

Цель: сравнительный анализ устойчивости к антимикробным препаратам штаммов Salmonella сероваров S. Enteritidis, S. Infantis, S. Typhimurium, выделенных от людей, продуктивных животных, продукции животноводства.

Материалы и методы. Исследовано 898 штаммов Salmonella, выделенных от людей (673), продуктивных животных (132), продуктов питания животного происхождения (93). Чувствительность к антибиотикам определяли согласно рекомендациям EUCAST. Поиск генов, кодирующих продукцию бета-лактамаз, проводили методом ПЦР. Характер мутаций в QRDR-регионе гена gyrA установили путем амплификации и прямого секвенирования внутреннего фрагмента гена.

Результаты. Устойчивость к антибиотикам выявлена у 69,9% штаммов, выделенных от людей, 78,5% – из пищевых продуктов, и 88,6% ‒ от сельскохозяйственных животных. 68,7% штаммов S. Enteritidis, выделенных от людей, 61,4% ‒ из продуктов питания и 21,1%, выделенных от животных было резистентно к хинолонам. Доля штаммов S.Typhimurium с MDR-фенотипом составляла от 21,6% до 88,2% в зависимости от источника выделения. Из штаммов S. Infantis устойчивыми к АМП были 89,3% штаммов, выделенных от людей, 94,5% – от животных и 97,8% – из пищевых продуктов, множественной устойчивостью обладали 67,9% штаммов, выделенных от людей, 80,0% – из пищевых продуктов и 89,0% – от животных. Выявлена продукция бета-лактамаз генетических групп ТЕМ-1, СТХ-М1, СТХ-М2, CMY-2. Устойчивость к хинолонам обусловлена хромосомным механизмом: выявлены однонуклеотидные замены в гене gyrA: Asp87Tyr, Ser83Phe, Asp87Asn, Ser83Tyr, Asp87Gly.

Заключение. Чувствительность к антибиотикам у штаммов доминирующих сероваров имела специфические особенности. Штаммы, выделенные от животных, имели выраженные отличия от штаммов, выделенных от людей и из продуктов питания. Устойчивость к хинолонам и бета-лактамам у Salmonella, вне зависимости от источника выделения и серовара, была обусловлена универсальными для энтеробактерий молекулярными механизмами.

1. The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks 1n 2015/EFSA Journal. – 2016. – Vol.14(2). – P.4634 doi: 10.2903/j.efsa.2016.

2. EFSA (Euripean Food Safety Authority) and ECDC (European Centre of Disease Prevention and Control) The European Union summary report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2015//EFSA Journal. – 2017. – Vol.15. – №2. – P.4964 DOI: 10.2903/j.efsa.2017.4694.

3. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018 году: Государственный доклад [Электронный ресурс]. – М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. – 2019. – 254с. – Режим доступа: https://rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/798/gosudarstvennyy-doklad-o-sostoyaniisanitarno_epidemiologicheskogo-blagopoluchiya-naseleniyav-rossiyskoy-federatsii-v-2018-godu.pdf

4. Куземцева, С.В. Микробиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за сальмонеллезами / С.В. Куземцев, О.А. Михайлова // Национальные приоритеты России. – 2017.– Т. 26, № 4.– С. 92–96.

5. Рожнова, С.Ш. Перспективы организации расширенной системы надзора за сальмонеллезами в России / С.Ш. Рожнова, Н.К. Акулова, О.А. Христюхина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2015. – Т. 85, № 6. – С. 28–34.

6. Борьба с устойчивостью к антибиотикам с точки зрения безопасности пищевых продуктов в Европе. Всемирная организация здравоохранения. Европейское региональное бюро. Режим доступа: http://www.euro.who.int/ __data/assets/pdf_file/0011/144695/e94889R.pdf

7. FDA NARMS Retail Meat Interim Report for Salmonella. Режим доступа: www.fda.gov/downloads/AnimalVeterinary/SafetyHealth/AntimicrobialResistance/NationalAntimicrobialResistanceMonitoringSystem/UCM498134.pdf

8. Baker, S. Genomic insights into the emergence and spread of antimicrobial-resistant bacterial pathogens / S. Baker, N. Thomson, F-X. Weill, K.E. Holt // Science. – 2018. – Vol. 360 (6390). – Р.733-738.

9. Williams-Nguyen, J. Antibiotics and Antibiotic Resistancein Agroecosystems: State of the Science/J.Williams-Nguyen, J.B. Sallach, S.Bartelt-Hunt, A.B.Boxall, L.M.Durso, J.E. McLain, R.S.Singer, D.D.Snow, J.L.Zilles // J Environ Qual. – 2016. – Vol. 45(2). – P. 394-406.

10. CDC. National Salmonella Surveillance Annual Report, 2016 [Электронный ресурс] // Atlanta, Georgia: US Department of Health and Human Services. – CDC. – 2018. – Режим доступа: https://www.cdc.gov/nationalsurveillance/pdfs/2016-Salmonella-report-508.pdf

11. The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 2017 // EFSA Journal. – 2018. – Vol. 16(12). – Article 5500.

12. Fonteneau, L. Multinational outbreak of travel-related Salmonella Chester infections in Europe, summers 2014 and 2015 / L. Fonteneau, Da Silva N. Jourdan, L. Fabre, P. Ashton, M. Torpdahl, L. M ller, B. Bouchrif, A. El Boulani, E. Valkanou, W. Mattheus, I. Friesema, S. Herrera Leon, C. Varela Mart nez, J. Mossong, E. Severi, K. Grant, F-X. Weill, C.M. Gossner, S. Bertrand, T. Dallman, S. Le Hello // Euro Surveill. – 2017. – Vol. 22(7). – Article 30463.

13. EFSA (European Food Safety Authority) and ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control), 2015. EU Summary Report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2013// EFSA Journal. – 2015. – Vol.3. – №2. – P.4036 doi:10.2903/j.efsa.2015.4036.

14. Antigenic formulae of the Salmonella serovars [Электронный ресурс]. – 9th edition. – 2007. – 167 p. – Режим доступа: https://www.pasteur.fr/sites/default /files/veng_0.pdf

15. Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» (версии 2014, 2015, 2018 г.) [Электронный ресурс]. – Режим доступа: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/ files/docs/clrec-dsma2018.pdf

16. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters [Электронный ресурс] // European Society of Clinical Microbiology and Infectious. – 2020. – Pежим доступа: http://www.eucast.org/clinical_breakpoints/Publications/antimicrobial-resistance-Salmonella-Campylobacter-harmonised-monitoring.pdf

17. Мудрак, Д.Е. Молекулярно-генетические особенности устойчивости к бета-лактамным антибиотикам грамотрицательных микроорганизмов – возбудителей нозокомиальных инфекций: дис. канд. биол. наук: 03.02.03/ Д.Е. Мудрак. М., 2010. 140 с.

18. Dallenne, C. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important beta-lactamases in Enterobacteriaceae / C. Dallenne, A. Da Costa, D. Decr , C. Favier, G. Arlet // J Antimicrob Chemother. – 2010. – Vol. 65(3). – P. 490-495.

19. Wang, M. New plasmid-mediated quinolone resistance gene, qnrC, found in a clinical isolate of Proteus mirabilis / M. Wang, Q. Guo, X. Xu, X. Wang, X. Ye, S. Wu, D.C. Hooper, M. Wang // Antimicrob Agents Chemother. – 2009. – Vol. 53(5). – P. 1892–1897.

20. Nakaya, H. Life-threatening infantile diarrhea from fluoroquinolone-resistant Salmonella enterica Typhimurium with mutations in both gyrA and parC /H. Nakaya, A. Yasuhara, K. Yoshimura, Y. Oshihoi, H. Izumiya, H. Watanabe // Emerg Infect Dis. – 2003. – Vol. 9(2). – P.255-257