jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2019-11-4-113-121jofin-970Research ArticleЭпидемиологияEpidemiologyБокапарвовирусная инфекция у детей в Республике Беларусь: молекулярно-эпидемиологические аспектыBocaparvovirus infection in childrenin the republic of Belarus: molecular and epidemiological aspectsСивецН. В.SivetsN. V.

Сивец Наталья Валерьевна - научный сотрудник лаборатории гриппа и гриппоподобных заболеваний.

Минск

Minsk

sivets_n@mail.ruШмелеваН. П.ShmelevaN. P.

Шмелева Наталья Петровна - заведующая лабораторией гриппа и гриппоподобных заболеваний.

Минск

Minsk

shmelevanataliya@mail.ruЛапоТ. П.LapoT. P.

Лапо Татьяна Петровна - младший научный сотрудник лаборатории гриппа и гриппоподобных заболеваний.

Минск

Minsk

tatyanalapo@gmail.comРеспубликанский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологииБеларусьThe Republican Research and Practical Center for Epidemiology and MicrobiologyBelarus201908122019114113121Copyright © Сивец Н.В., Шмелева Н.П., Лапо Т.П., 20192019Сивец Н.В., Шмелева Н.П., Лапо Т.П.Sivets N.V., Shmeleva N.P., Lapo T.P.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/970Цель

Цель: изучить молекулярно-эпидемиологические аспекты, бокапарвовирусной инфекции у госпитализированных детей в Республике Беларусь.

Материалы и методы

Материалы и методы: исследования проводились в рамках дозорного надзора за гриппом и другими возбудителями острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ) в период 2010—2018 гг. Исследовали назофарингеальных мазки (3907), сыворотки крови (149) госпитализированных детей от 0 до 18 лет с симптомами ОРВИ, а также лимфоэпителиальную ткань аденоидов методом. ПЦР в реальном, времени (RotorGenu6000, Corbettresearch, Австралия) на наличие ДНК/РНК респираторных вирусов: гриппа, респираторно-синцитиального вируса, вируса парагриппа, риновируса, аденовируса, бокапарвовируса и коронавируса. Полногеномное секвенирование ДНК бокапарвовируса проводили с использованием, коммерческого набора «GenomeLabDTCSQuickStartKit» (BeckmanCoulter, США). Электрофорез и анализ продуктов реакции выполняли на автоматическом капиллярном ДНК-анализаторе BeckmanCoulter «CEQ 8000» (BeckmanCoulter, США).

Результаты

Результаты: генетический материал респираторных вирусов выявлен, в 2781 случае (71,2%). Бокапарвови-рус был выявлен, у 337 (12,1%,) пациентов. При анализе внутригодовой динамики бокапарвовирусной инфекции отмечен подъем, заболеваемости в осенний период. Наиболее восприимчивыми к данной инфекции являются дети в возрасте от 2 до 4 лет. Длительность виремии у данных пациентов варьировала от. 6 до 15 дней. Согласно данным, филогенетического анализа, белорусские вирусы HBoV1BLR/Mogilev/241/14, HBoV1BLR/Minsk/10/14, HBoV1BLR/Minsk/11/14 HBoV1BLR/Gomel/285/15 объединялись в отдельную группу и показали генетическое родство с референс-вирусом ST2. Анализ первичной структуры, белорусских бокапарвовирусов показал наличие ряда аминокислотных замен.

Заключение

Заключение: бокапарвовирус стал четвертым вирусом по частоте встречаемости, наряду с другими респираторными вирусами. Бокапарвовирусная инфекция может, иметь тяжелое течение. Все аминокислотные замены располагались в функционально-значимых регионах генома вируса.

Objective

Objective: To study molecular and epidemiological aspects bocaparvovirus infection at the hospitalized, children in Republic of Belarus.

Materials and methods

Materials and methods: the studies were as part of a sentinel surveillance of influenza and. other agents of acute respiratory viral infections (ARVI) in the period. 2010 — 2018. Investigated, nasopharyngeal swabs (3907), serum. (149) hospitalized. children from 0 to 18 years with symptoms of ARVI, as well as lymphoepithelial tissue of adenoids by real-time PCR (Rotor Gene 6000, Corbett research, Australia) for the presence of respiratory DNA/RNA viruses: influenza, respiratory syncytial virus, parainfluenza virus, rhinovirus, adenovirus, metapneumovirus, bocaparvovirus, and. coronavi-ruses. The full genomic DNA sequencing of the bocaparvovirus was performed, using the commercial kit «Genome Lab DTCS Quick Start Kit» (Beckman Coulter, USA). Electrophoresis and. analysis of the reaction products were performed, on a Beckman Coulter CEQ 8000 automated, capillary DNA analyzer (Beckman Coulter, USA).

Results

Results: the genetic material of respiratory viruses was detected, in 2781 cases (71,2%). Bocaparvovirus was detected in 337 (12,1%,) patients. Bocaparvovirus infection showed, an increase in the incidence rate in the autumn period. The most susceptible to this infection are children aged. 2 years to 4 years. The duration of viremia in these patients ranged, from 6 to 15 days. Phylogenetic analysis, the Belarusian, viruses HBoV1BLR/Mogilev/241/14, HBoV1BLR/Minsk/10/14, HBoV1BLR/Minsk/11/14, HBoV1BLR/Gomel/285/15 were combined into a separate group and showed genetic similarity with the ST2 virus. Analysis of the primary structure of the Belarusian bocaparvoviruses showed the presence of amino acid substitutions.

Conclusion

Conclusion: Bocaparvovirus became the fourth, virus in frequency of occurrence along with other respiratory viruses. Bocaparvovirus infection may have a severe course. All amino acid, substitutions were located, in functionally significant regions of the virus genome.

бокапарвовирус человекаполимеразная цепная реакциячастота выявлениявозрастная структурасезонностьсеквенированиефилогенетический анализhuman bocaparvoviruspolymerase chain reactiondetection rateage structureseasonalitysequencingphylogenetic analysisReferencesAllander T, Tammi MT, Eriksson M, Bjerkner A, Tiveljung-Lindell A, Andersson B. Cloning of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples. P Natl Acad Sci 2005 Jun; 102:12891 - 6.Allander T, Tammi MT, Eriksson M, Bjerkner A, Tiveljung-Lindell A, Andersson B. Cloning of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples. P Natl Acad Sci 2005 Jun; 102:12891 - 6.Guido M, Tumolo MR, Verri T, Romano A, Serio F, De Giorgi M, De Donno A, Bagordo F, Zizza A. Human bocavirus: Current knowledge and future challenges. World J Gastroenterol 2016 Oct; 22(39):8684-8697.Guido M, Tumolo MR, Verri T, Romano A, Serio F, De Giorgi M, De Donno A, Bagordo F, Zizza A. Human bocavirus: Current knowledge and future challenges. World J Gastroenterol 2016 Oct; 22(39):8684-8697.Kapoor A, Mehta N, Esper F, et al. Identification and characterization of a new bocavirus species in gorillas. PLoS ONE 2010 July; 5(7): E11948.Kapoor A, Mehta N, Esper F, et al. Identification and characterization of a new bocavirus species in gorillas. PLoS ONE 2010 July; 5(7): E11948.Cheung AK, Wu G, Wang D, Bayles DO, Lager KM, Vincent AL. Identification and molecular cloning of a novel porcine parvovirus. Arch Virol. 2010 March; 155(5):801-806.Cheung AK, Wu G, Wang D, Bayles DO, Lager KM, Vincent AL. Identification and molecular cloning of a novel porcine parvovirus. Arch Virol. 2010 March; 155(5):801-806.Arthur JL, Higgins GD, Davidson GP, Givney RC, Ratcliff RM. A novel bocavirus associated with acute gastroenteritis in Australian children. PLoS Pathog 2009 Apr; 5(4):1-11.Arthur JL, Higgins GD, Davidson GP, Givney RC, Ratcliff RM. A novel bocavirus associated with acute gastroenteritis in Australian children. PLoS Pathog 2009 Apr; 5(4):1-11.Qiu J, Soderlund - Venermo M, Young NS. Human parvoviruses. Clin Microbiol 2016 Nov; 30:43-113.Qiu J, Soderlund — Venermo M, Young NS. Human parvoviruses. Clin Microbiol 2016 Nov; 30:43—113.Kapoor A, Hornig M, Asokan A et al. Bocavirus episome in infected human tissue contains non - identical termini. PLoS ONE 2011 Jun; 6: e21362.Kapoor A, Hornig M, Asokan A et al. Bocavirus episome in infected human tissue contains non - identical termini. PLoS ONE 2011 Jun; 6: e21362.Windisch W, Pieper M, et al. Latent infection of human Bocavirus accompanied by flare of chronic cough, fatigue and episodes of viral replication in an immunocompetent adult patient. JMM 2016 Aug; 3(4): e005052.Windisch W, Pieper M, et al. Latent infection of human Bocavirus accompanied by flare of chronic cough, fatigue and episodes of viral replication in an immunocompetent adult patient. JMM 2016 Aug; 3(4): e005052.Шмелева, Н.П. Этиология ОРИ у детей на современном этапе / Н.П. Шмелева, Н.В. Сивец, Е.Н. Сергеенко // Мед. журн. - 2011. - № 4. - С. 129-131.Shmeleva N.P. Medicinskij zhurna. 2011.4: 129 — 131 (in Russian).Сивец, Н.В. Ассоциация респираторной патологии с бокавирусом человека / Н.В. Сивец, Н.П. Шмелева, Н.В. Грибкова // Современные проблемы инфекционной патологии человека // Сб науч. тр. Респ. науч.-практ. центр эпидемиологии и микробиологии / редкол. Г.М. Игнатьев (гл. ред.) [и др.]. — Минск, 2011. — С. 34 — 37.Sivec N.V. Associacija respiratornoj patologii s bokavi-rusom cheloveka / Sivec N.V., Shmeleva N.P., Gribkova N.V. [ Association children's respiratory pathology with human bocavirus] in Sbornik nauchnyh trudov Sovremennye problemy infekcionnoj patologii cheloveka [Modern problems of human infectious pathology]. Minsk; 2011. P 34-37. (in Russian).Rowe WP, Huebner RJ, Gilmore LK, Parrott RH, Ward TG. Isolation of a cytopathogenic agent from human adenoids undergoing spontaneous degeneration in tissue culture. Proc Soc Exp Biol Med 1954 Jan 84: 570-573.Rowe WP, Huebner RJ, Gilmore LK, Parrott RH, Ward TG. Isolation of a cytopathogenic agent from human adenoids undergoing spontaneous degeneration in tissue culture. Proc Soc Exp Biol Med 1954 Jan 84: 570-573.Szalaty H, Dubowska-Inglot A. Isolation and typing of adenoviruses from adenoids. Arch Immunol Ther Exp (Warsz) 1959. 7: 615-623.Szalaty H, Dubowska-Inglot A. Isolation and typing of adenoviruses from adenoids. Arch Immunol Ther Exp (Warsz) 1959. 7: 615-623.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.