References

jofin

Журнал инфектологии

Journal Infectology

2072-6732

IPO “АIDSSPbR"

10.22625/2072-6732-2019-11-3-46-53

jofin-931

Research Article

Оригинальные исследования

Original Research

РАЗНООБРАЗИЕ ГЕНОВАРИАНТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У ВОЕННОСЛУЖАЩИХ

Variety of the hepatitis B virus genovariants in the military

Останкова

Ю. В.

Ostankova

Yu. V.

Останкова Юлия Владимировна – научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

тел.: 8(812)233-20-92, +7-921-353-81-73

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

shenna1@yandex.ru

Семенов

А. В.

Semenov

A. V.

Семенов Александр Владимирович – заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции, заместитель директора по инновационной работе Санкт-Петербургского научно- исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера;

доцент кафедры иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова;

доцент кафедры клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, д.б.н.

тел.: 8(812) 233-34-83

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

alexvsemenov@yahoo.com

Зуева

Е. Б.

Zueva

E. B.

Зуева Елена Борисовна – старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной вирусологии, к.б.н.

тел.: 8(812) 233-20-92

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

ezueva75@mail.ru

Габдрахманов

И. А.

Gabdrakhmanov

I. A.

Габдрахманов Ильнур Адисович – начальник научно-исследовательской лаборатории НИЦ, к.м.н.

тел.: +7-921-885-37-57

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

ilnur87rahmanov@yandex.ru

Козлов

К. В.

Kozlov

K. V.

Козлов Константин Владимирович – доцент кафедры инфекционных болезней с курсом медицинской паразитологии и тропических заболеваний, д.м.н.

тел.: 8(812)271-87-26

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

kosttiak@mail.ru

Жданов

К. В.

Zhdanov

K. V.

Жданов Константин Валерьевич – начальник кафедры инфекционных болезней с курсом медицинской паразитологии и тропических заболеваний, д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН

тел.: 8(812)271-87-26

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

zhdanovkv@rambler.ru

Тотолян

А. А.

Totolian

A. A.

Тотолян Арег Артемович – заведующий лабораторией молекулярной иммунологии, директор Санкт-Петербургского научно- исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имениПастера;

заведующий кафедрой иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова, д.м.н., профессор, академик РАН

тел.: 8(812) 232-00-66

Санкт-Петербург

totolian@pasteurorg.ru

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени ПастераРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute named after PasteurRussian Federation

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова; Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. МечниковаРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute named after Pasteur; First Saint-Petersburg State Medical University named after academician I.P. Pavlov; North-Western State Medical University named after I.I. MechnikovRussian Federation

Военно-медицинская академия имени С.М. КироваРоссияMilitary Medical Аcademy named after S.M. KirovRussian Federation

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. ПавловаРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute named after Pasteur; First Saint-Petersburg State Medical University named after academician I.P. PavlovRussian Federation

2019

08102019

1134653

2019

Останкова Ю.В., Семенов А.В., Зуева Е.Б., Габдрахманов И.А., Козлов К.В., Жданов К.В., Тотолян А.А.

Ostankova Y.V., Semenov A.V., Zueva E.B., Gabdrakhmanov I.A., Kozlov K.V., Zhdanov K.V., Totolian A.A.

Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.

https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/931

Цель: проанализировать распределение генотипов и субгенотипов вируса гепатита В среди военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В. Материалы и методы. В работе были использованы образцы плазмы крови и биопсийного материала тканей печени от 90 действующих или отставных военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В с различной активностью фиброза, проходящих обследование в клинике инфекционных болезней военно-медицинской академии имени С.М. Кирова (Санкт-Петербург, Россия). Для выявления ВГВ выделяли нуклеиновые кислоты (НК) с использованием коммерческого набора «АмплиПрайм Рибо-преп» (ФБУН ЦНИИЭ, Москва). Для амплификации и секвенирующей реакции использовали перекрывающиеся пары специфических праймеров, совместно фланкирующие фрагмент протяженностью 1475 пар оснований (п.о.), включающий рекомендованную для генотипирования ВГВ регион Pre-S1/Pre-S2/S протяженностью 1169 п.о. Результаты. Во всех 90 образцах биологического материала выявлена ДНК ВГВ следующих генотипов: D2 – 45,6% (n=41), D1 – 32,2% (n=29), D3 – 13,3% (n=12), А2 – 6,7% (n=6), D4 и А1 по 1,1% соответственно. Распределение субгенотипов ВГВ, обнаруженных в материале пациентов из Северо-Кавказского федерального округа (D1 – 63,6%, D2, D3, D4, A2 – по 9,1%), достоверно отличалось от распределения субгенотипов изолятов, полученных от пациентов из Центрального и СевероЗападного федеральных округов (D1 – 20,9%, D2 – 58%, 3 – 16,3%, A2 – 4,8%) (χ2=11,9 при p=0,0076, df=3). Выявлены нехарактерные для РФ субгенотипы D4 и А1, представляющие собой единичные завозные случаи. Обсуждается тенденция к смещению распределения геновариантов за счет завозов ВГВ соответствующих субгенотипов из других стран, в том числе стран Средней Азии. Заключение. Систематическое изучение филогении изолятов ВГВ позволяет получить новую информацию об особенностях распространения субгенотипов ВГВ среди отдельных групп населения, в том числе военнослужащих.

Aim. To estimate the distribution of genotypes and subgenotypes of the hepatitis B virus among military personnel with chronic viral hepatitis B. Materials and methods. The work used samples of blood plasma and biopsy material obtained from 90 active or retired military personnel with chronic viral hepatitis B with various degrees of fibrosis undergoing treatment in St. Petersburg. Primary detection of HBV was carried out by isolating nucleic acids (NK) from the blood plasma using the «AmplePrime Ribo-prep» commercial kit (FBIS CRIE, Moscow). Specific primers were used for the amplification and sequencing reaction. Overlapping primer pairs were used, jointly flanking 1475 base pairs (bp) fragment, including the recommended for HBV genotyping the 1169 bp Pre-S1/Pre-S2/S. Results. Among 90 samples from patients with chronic viral hepatitis B from different regions of the Russian Federation, HBV subgenotypes are represented in the following ratios: D2 = 45.6% (n=41), D1 = 32.2% (n=29), D3 = 13.3% (n=12), A2 = 6.7% (n=6), D4 and A1 by 1.1%, respectively. The distribution of HBV subgenotypes from the North Caucasian federal district (D1 – 63.6%, D2, D3, D4, A2 – by 9.1%) was significantly different from the distribution among patients from the Central and North-Western federal districts (D1-20, 9%, D2 – 58%, D3 – 16.3%, A2 – 4.8%) (χ2=11,9 при p=0,0076, df=3). Uncharacteristic for the Russian Federation subgenotypes D4 and A1, representing single imported cases. The tendency to shift the distribution of genovariants due to imports of the corresponding HBV subgenotypes from other countries, including the Central Asian countries, is discussed. Conclusion. A systematic study of the HBV isolates phylogeny provides new information about the HBV subgenotypes distribution among certain population groups, including military personnel.

хронический вирусный гепатит Вгенотип ВГВмолекулярная эпидемиологиявоеннослужащие

Chronic hepatitis BHBV genotypemolecular epidemiologymilitary

References1

Schweitzer A., Horn J., Mikolajczyk R.T., Krause G., Ott J.J. Estimations of worldwide prevalence of chronic hepatitis B virus infection: a systematic review of data published between 1965 and 2013. Lancet. 2015. 386(10003). P:1546-1555. doi: 10.1016/S0140-6736(15)61412-X.

Perz J.F., Armstrong G.L., Farrington L.A., Hutin Y.J., Bell B.P. The contributions of hepatitis B virus and hepatitis C virus infections to cirrhosis and primary liver cancer worldwide. J. Hepatol. 2006. 45. P:529–538. doi: 10.1016/j.jhep.2006.05.013.

Alavian S.M. Military personals should be vaccinated against hepatitis B infection. J. Arch Mil Med. 2013. v.2(1):e16450.

Губерницкая, С.В. Сексуальное поведение и распространенность возбудителей урогенитальных инфекций у военнослужащих / С.В. Губерницкая, О.С. Сахаров, И.Г. Мосягин // Экология человека. – 2011. – №11 – С. 25–28.

Gubernitskaya, S.V. Sexual behavior and prevalence of urogenital pathogens infections in military personnel / S.V. Gubernitskaya, О.S. Saharov, I.G. Mosyagin // Ekologiya cheloveka. – 2011. – №11 – С. 25-28 (in Russian).

Kramvis A, Arakawa K, Yu MC, Nogueira R, Stram DO, Kew MC. Relationship of serological subtype, basic core promoter and precore mutations to genotypes/subgenotypes of hepatitis B virus. J Med Virol. 2008;80:27–46.

Lin C.-L. Kao J.-H. Hepatitis B Virus Genotypes and Variants. Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2015. v. 5, № 5. P.a021436–a021436.

Norder H., Couroucé A.-M., Coursaget P., Echevarria J. M., Lee S.-D., Mushahwar I. K., Robertson B. H., Locarnini S., Magnius L. O. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes. Intervirology. 2004. V. 47, № 6. P.289–309.

Tatematsu K., Tanaka Y., Kurbanov F., Sugauchi F., Mano S., Maeshiro T., Nakayoshi T., Wakuta M., Miyakawa Y., Mizokami M. A genetic variant of hepatitis B virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new genotype J. J. Virol. 2009. 83(20). P. 10538-10547.

Brichler S., Lagathu G., Chekaraou M.A., Le Gal F., Edouard A., Dény P., Césaire R., Gordien E. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique. J. Gen. Virol. 2013. vol. 94 (Pt 10). P. 2318-2329.

Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution. 2016, vol. 33, №7. P. 1870-1874.

Kuo A., Gish R. Chronic hepatitis B infection. Clin. Liver Dis. 2012. V. 16, № 2. P.347–369.

Елпаева, Е.А. Генотипическая характеристика вируса гепатита В у хронически инфицированных больных / Е. А. Елпаева [и др.] // Дальневосточный Журнал Инфекционной Патологии. – 2009. – № 15 – С. 56–59.

Elpayeva, E.A. Genotipicheskaya kharakteristika virusa gepatita V u khronicheski infitsirovannykh bolnykh / E. A. Elpayeva, E. A. Poretskova, A. Yu. Kovelenov, I. S. Alikyan, R. B. Galbraykh, M. P. Grudinin, E. V. Esaulenko // Dalnevostochnyy Zhurnal Infektsionnoy Patologii. – 2009. – № 15 – С. 56–59 (in Russian).

Баяндин, Р.Б. Генотипическое разнообразие изолятов и факторы риска инфекции вирусом гепатита В у отдельных групп населения Новосибирской области / Р.Б. Баяндин [и др.] // Инфекционные болезни. – 2004. – Т. 2, № 3. – С. 39–44.

Bayandin, R.B. Genotipicheskoye raznoobraziye izolyatov i faktory riska infektsii virusom gepatita V u otdelnykh grupp naseleniya Novosibirskoy oblasti / R.B. Bayandin, A.V. Shustov, G.V. Kochneva, G.F. Sivolobova, A.A. Grazhdantseva, L.A. Akinfeyeva, I.G. Rakova, M.V. Aleshina, V.N. Bukin, V.G. Orlovskiy, V.S. Bespalov, S.V. Netesov // Infektsionnyye bolezni. – 2004. – Т. 2. – № 3. – С. 39-44 (in Russian).

Abe K., Hayakawa E., Sminov A.V., Rossina A.L., Ding X., Huy T.T., Sata T., Uchaikin V.F. Molecular epidemiology of hepatitis B, C, D and E viruses among children in Moscow, Russia. Journal of Clinical Virology. 2004. v.30, №1. P. 57-61.

Flodgren E., Bengtsson S., Knutsson M., Strebkova E.A., Kidd A.H., Alexeyev O.A., Kidd-Ljunggren K. Recent high incidence of fulminant hepatitis in Samara, Russia: molecular analysis of prevailing hepatitis B and D virus strains. J. Clin. Microbiol. 2000. 38(9). P.3311-2316.

Кочнева, Г.В. Этиология острых гепатитов и генотипическое разнообразие вирусов гепатитов А, В, С и Е в трех регионах Сибири / Г.В. Кочнева [и др.] // Инфекционные болезни. – 2005. – Т. 3, № 1. – С. 26–31.

Kochneva, G.V. Etiologiya ostrykh gepatitov i genotipicheskoye raznoobraziye virusov gepatitov A. V. S i E v trekh regionakh Sibiri / G.V. Kochneva, A.A. Grazhdantseva, G.F. Sivolobova, A.V. Shustov, I.V. Gavrilova, E.V. Chub, R.B. Bayandin, V.A. Ternovoy, E.V. Chausov, L.A. Akinfeyeva, V.M. Granitov, E.G. Sakharova, L.I. Gubanova, V.G. Orlovskiy, S.V. Netesov // Infektsionnyye bolezni. – 2005. – т. 3, № 1. – С. 26-31 (in Russian).

Чуланов, В.П. Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В. Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук. – Москва. – 2013. – 47 с.

Chulanov, V.P. Epidemiologicheskoye i klinicheskoye znacheniye geneticheskoy geterogennosti virusov gepatita A i B. Avtoreferat dissertatsii na soiskaniye uchenoy stepeni doktora meditsinskikh nauk. – Moskva. – 2013. – 47 с (in Russian).

Лобзин, Ю.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика гепатита В в Республике Саха (Якутия) / Ю.В. Лобзин, С.С. Слепцова, М.Н. Алексеева, А.Г. Рахманова // Инфекционные болезни. – 2004. – Т. 2, № 2. – C. 13–16.

Lobzin, Yu.V. Kliniko-epidemiologicheskaya kharakteristika gepatita V v Respublike Sakha (Yakutiya) / Yu.V. Lobzin, S.S. Sleptsova, M.N. Alekseyeva, A.G. Rakhmanova // Infektsionnyye bolezni. – 2004. – Т. 2. – № 2. – C. 13-16 (in Russian).

Кузин, С.Н. Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия) / С.Н. Кузин [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика, – 2008. – Т. 42, № 5. – С. 10–15.

Kuzin, S.N. Geneticheskoye raznoobraziye virusa gepatita V na territorii Respubliki Sakha (Yakutiya) / S.N. Kuzin, N.N. Zabelin, E.I. Samokhvalov, S.I. Semenov, N.N. Pavlov, M.V. Terekhova, I.K. Zveryayeva, L.E. Kuzina, A.A. Kozhevnikov // Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. – 2008. – Т. 42. – № 5. – С. 10-15 (in Russian).

Tallo T., Tefanova V., Priimagi L., Schmidt J., Katargina O., Michailov M., Mukomolov S., Magnius L., Norder H. D2: major subgenotype of hepatitis B virus in Russia and the Baltic region. Journal of General Virology. 2008. V. 89. P. 1829-1839.

Заботина, Е.Е. Эпидемиологические и молекулярно-генетические аспекты гепатитов В и С (по материалам Владимирской области) : Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Е.Е. Заботина. – М., 2011. – 133 с.

Zabotina, E.E. Epidemiologicheskiye i molekulyarnogeneticheskiye aspekty gepatitov B i C (po materialam Vladimirskoy oblasti). Dissertatsiya na soiskaniye uchenoy stepeni kandidata meditsinskikh nauk. – Moskva. – 2011. – 133 с (in Russian).

Bokharaei-Salim F., Keyvani H., Monavari S.H., Esghaei M., Fakhim S., Pirkooh A. Ataei, Behnava B. Distribution of hepatitis B virus genotypes in azerbaijani patients with chronic hepatitis B infection. Hepat. Mon. 2014. vol.14(12). P.e25105.

Азимова, С. Особености клинического течения хронического вирусного гепатита HBV в зависимости от его генотипов / С. Азимова [и др.] // Доклады Академии Наук Республики Таджикистан. – 2011. – Т. 54, № 5. – С. 414–418.

Azimova, S. Osobenosti klinicheskogo techeniya khronicheskogo virusnogo gepatita HBV v zavisimosti ot ego genotipov / S. Azimova, A. Dustov, M. Dzhamilov, B. Kurbonov, S. Umarov // Doklady Akademii Nauk Respubliki Tadzhikistan. – 2011. – т. 54, №5. – С.414-418 (in Russian).

Maddalena D. C., Giambelli C., Tanzi E., Colzani D., Schiavini M., Milazzo L., Bernini F., Ebranati E., Cargnel A., Bruno R., Galli M., Zehender G. High level of genetic heterogeneity in S and P genes of genotype D hepatitis B virus. Virology. 2007. 365. P.113-124.

Семенов, А.В. К вопросу о молекулярной эпидемиологии гепатита B в Республике Саха (Якутия) / А.В. Семенов [и др.] // Журнал инфектологии. – 2016. – Т. 8, № 1. – C. 57–65.

Semenov, A.V. K voprosu o molekulyarnoy epidemiologii gepatita B v Respublike Sakha (Yakutiya) / A.V. Semenov, Yu.V. Ostankova, V.V. Gerasimova, M.A. Bichurina, S.L. Mukomolov, A.V. Kozlov, A.A. Totolyan // Zhurnal infektologii. – 2016. – т.8(1). – C.57-65 (in Russian).

Andernach I.E., Nolte C., Pape J.W., Muller C.P. Slave Trade and Hepatitis B Virus Genotypes and Subgenotypes in Haiti and Africa. Emerg Infect Dis. 2009. vol.15. P. 1222–1228.

Гасич, Е.Л. Генотипы вируса гепатита В, циркулирующие в республике Беларусь / Е.Л. Гасич [и др.] // Здравоохранение (Минск). – 2012. – № 11. – С. 48–55.

Gasich, E.L. Genotipy virusa gepatita B, tsirkuliruyushchiye v respublike Belarus / E.L. Gasich, V.F. Eremin, N.D. Kolomiyets, S.V. Sosinovich, E.G. Fisenko, V.V. Pashkovich, V.L. Zuyeva, T.A. Rogacheva, M.G. Tulinova // Zdravookhraneniye (Minsk). – 2012. – № 11. – С. 48-55 (in Russian).

Banerjee P., Mondal R. K., Nandi M., Ghosh S., Khatun M., Chakraborty N., Bhattacharya S., RoyChoudhury A., Banerjee S., Santra A., Sil S., Chowdhury A., Bhaumik P., Datta S. A. Rare HBV Subgenotype D4 with Unique Genomic Signatures Identified in North-Eastern India – An Emerging Clinical Challenge? PLoS One. 2014. vol.9(10). P. e109425.

Kramvis A., Paraskevis D. Subgenotype A1 of HBV-tracing human migrations in and out of Africa. Antivir Ther. 2013. vol.18(3 Pt B). P.513-521.

Hundie G.B., Raj V.S., Michael D.G., Pas S.D., Osterhaus A.D., Koopmans M.P., Smits S.L., Haagmans B.L. Molecular epidemiology and genetic diversity of hepatitis B virus in Ethiopia. J. Med Virol. 2016. vol.88(6). P.1035-1043.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.