jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2018-10-4-124-133jofin-813Research ArticleЭпидемиологияEpidemiologyЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ И ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛЯЦИИ НЕПОЛИОМИЕЛИТНЫХ ЭНТЕРОВИРУСОВ НА НЕКОТОРЫХ ТЕРРИТОРИЯХ РОССИИ В 2017 ГОДУEnterovirus infection morbidity and peculiarities of nonpolio enteroviruses circulation on some territories of Russia in 2017РоманенковаН. И.RomanenkovaN. I.

ведущий научный сотрудник, к.м.н.;

тел.: 8(812)233-21-56

romanenkova@pasteurorg.ruГолицынаЛ. Н.GolitsynaL. N.

ведущий научный сотрудник, к.б.н.;

тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruБичуринаМ. А.BichurinaM. A.

заведующая лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций,д.м.н.;

тел.: 8(812)233-21-56

romanenkova@pasteurorg.ruРозаеваН. Р.RozaevaN. R.

старший научный сотрудник, к.м.н.;

тел.: 8(812)233-21-56

rozaeva-n@mail.ruКанаеваО. И.KanaevaO. I.

научный сотрудник;

тел.: 8(812)233-21-56

ol.kanaeva@yandex.ruЗверевВ. В.ZverevV. V.

старший научный сотрудник, к.б.н.;

тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruСозоновД. В.SozonovD. V.

младший научный сотрудник;

тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruЧеркасскаяИ. В.CherkasskayaI. V.

главный специалист-эксперт отдела эпидемиологического надзора;

тел.: 8(845)220-29-29

Cherkasskaja_IV@64.rospotrebnadzor.ruКирилловаЛ. П.KirillovaL. P.

начальник вирусологического отделения микробиологической лаборатории;

тел.: 8(845)222-84-14

fbuz@gigiena-saratov.ruЕрмаковаМ. В.ErmakovaM. V.epid@murmanpotrebnadzor.ruКамынинаЛ. С.KamyninaL. S.

заведующая вирусологической лабораторией;

тел.: 8(815)244-38-67

virus@fguzmo.ruПетуховаМ. Б.PetukhovaM. B.

специалист отдела эпидемиологического надзора;

тел.: 8(821)221-96-90

tu@gsenkomi.ruГрицайА. Б.GritsayA. B.

заведующая вирусологической лабораторией;

тел.: 8(821)221-30-94

grizay68@mail.ruНовиковаН. А.NovikovaN. A.

заведующая лабораторией молекулярной эпидемиологии вирусных инфекций, д.б.н.;

тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruСанкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-ПетербургРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur, Saint-PetersburgRussian FederationНижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной, Нижний НовгородРоссияNizhny Novgorod Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after academician I.N. Blokhina, Nizhny NovgorodRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Саратовской области, СаратовРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Saratov Region, SaratovRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Саратовской области, СаратовРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Saratov Region, SaratovRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Мурманской области, МурманскРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Murmansk Region, MurmanskRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Мурманской области, МурманскРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Murmansk Region, MurmanskRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Республике Коми, СыктывкарРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Republic Komi, SyktyvkarRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Республике Коми, СыктывкарРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Republic Komi, SyktyvkarRussian Federation201830122018104124133Copyright © Романенкова Н.И., Голицына Л.Н., Бичурина М.А., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Зверев В.В., Созонов Д.В., Черкасская И.В., Кириллова Л.П., Ермакова М.В., Камынина Л.С., Петухова М.Б., Грицай А.Б., Новикова Н.А., 20182018Романенкова Н.И., Голицына Л.Н., Бичурина М.А., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Зверев В.В., Созонов Д.В., Черкасская И.В., Кириллова Л.П., Ермакова М.В., Камынина Л.С., Петухова М.Б., Грицай А.Б., Новикова Н.А.Romanenkova N.I., Golitsyna L.N., Bichurina M.A., Rozaeva N.R., Kanaeva O.I., Zverev V.V., Sozonov D.V., Cherkasskaya I.V., Kirillova L.P., Ermakova M.V., Kamynina L.S., Petukhova M.B., Gritsay A.B., Novikova N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/813

Цель: характеристика заболеваемости энтеровирусной инфекцией и изучение особенностей циркуляции неполиомиелитных энтеровирусов на ряде территорий России в 2017 г. Материалы и методы: исследовано более 5000 проб фекалий от больных энтеровирусной инфекцией. Выделение и идентификацию энтеровирусов проводили вирусологическим методом и путём частичного секвенирования области генома VP1. Филогенетические деревья были построены методом Bayesian Monte Carlo Markov Chain. Результаты: течение эпидемического процесса и клинические проявления энтеровирусной инфекции на разных территориях отличались. Особенности циркуляции энтеровирусов разных типов на территориях также были разными. В Саратовской области 65% заболеваний были представлены энтеровирусным менингитом. В Мурманской области и в Республике Коми преобладали экзантемные формы энтеровирусной инфекции, составившие 95% и 60% соответственно. В Саратовской области этиологическим фактором энтеровирусного менингита оказался энтеровирус ЕСНО 18. В Мурманской области и в Республике Коми заболевания были обусловлены в основном Coxsackievirus А6. Штаммы энтеровируса ЕСНО 18 распределились по трем кластерам. Штаммы, обусловившие заболевания энтеровирусным менингитом в Саратовской области, вошли в кластер 3, они сформировались отдельно от штаммов этого типа вируса и отличались от штаммов ЕСНО18, которые циркулировали на северо-западе России. Штаммы вируса Coxsackievirus А6, идентифицированные на северо-западе России, относились к трем субгенотипам пандемического генотипа вируса Coxsackievirus А6 – 5, 6 и 8. Большинство штаммов относились к субгенотипам 6 и 8, которые в 2017 г. доминировали в структуре Coxsackieviruses А6 на северо-западе России и в Российской Федерации в целом. Заключение: эпидемические подъемы заболеваемости энтеровирусной инфекцией, представленной различными клиническими формами, были обусловлены разными типами энтеровирусов. Этиологическим агентом энтеровирусного менингита были энтеровирусы ЕСНО 18. Основным этиологическим фактором экзантемных форм заболевания были Coxsackieviruses A6 разных субгенотипов.

Aim: Characteristics of enterovirus infection morbidity and study of peculiarities of enterovirus circulation on some territories of Russia in 2017. Materials and methods: We investigated more than 5000 samples from the patients with enterovirus infection. The isolation and identification of enteroviruses were conducted by virological method and by partial sequencing of the genome region VP1. Phylogenic trees were constructed according to the method of Bayesian Monte Carlo Markov Chain. Results: Epidemic process and clinical picture of enterovirus infection were not the same on different territories. Peculiarities of the circulation of different types of enteroviruses on the territories were also different. In Saratov region 65% of cases were represented by enterovirus meningitis. In Murmansk region and in the Komi Republic enterovirus infection with exanthema prevailed, 95% and 60% correspondingly. In Saratov region enterovirus ECHO18 was the etiological agent of enterovirus meningitis. In Murmansk region and in the Komi Republic the cases were connected mainly with Coxsackieviruses A6. The strains of enterovirus ECHO18 were distributed to three clusters. The strains which provoked enterovirus meningitis in Saratov region belonged to cluster 3, they were formed separately from other strains of this enterovirus type and differed from the stains of ECHO18 which circulated in the North-West of Russia. The strains of Coxsackieviruses A6 identified in the North-West of Russia belonged to three sub-genotypes 5, 6, 8 of pandemic genotype of CoxsackievirusesA6. The majority of the strains belonged to sub-genotypes 6 and 8 which in 2017 dominated in the structure of Coxsackieviruses A6 in the North-West of Russia and in Russia. Conclusion: Epidemic peaks of enterovirus infection represented by different clinical forms of the disease were provoked by different types of enteroviruses. Enterovirus ECHO18 was the etiological agent of enterovirus meningitis. The main etiological factors of enterovirus infection with exanthema were Coxsackieviruses A6 of different sub-genotypes.

энтеровирусная инфекцияэнтеровирусыциркуляциядетекцияидентификацияфилогенетический анализenterovirus infectionenterovirusescirculationdetectionidentificationphylogenetic analysisReferencesОнищенко, Г.Г. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 году: молекулярноэпидемиологические аспекты / Г.Г. Онищенко [и др.] // Журн. микробиол. – 2009. – № 2. – С. 24–30.Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I., et al. Jurnal microbiologii. 2009; 2: 24-30 (in Russian).Бичурина, М.А. Групповые заболевания энтеровирусной инфекцией, обусловленные вирусами Коксаки А16, на Северо-западе России / М.А. Бичурина [и др.] // Журн. микробиол. – 2014. – № 2. – С. 51–58.Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Novikova N.A. et al. Jurnal microbiologii. 2014; 2: 51-58 (in Russian).Ray CG. Sherris Medical Microbiology. 4th ed. NY (USA): The McGraw-Hill Companies; c2004. Chapter 12, Enteroviruses; p. 531-41.Ray CG. Sherris Medical Microbiology. 4th ed. NY (USA): The McGraw-Hill Companies; c2004. Chapter 12, Enteroviruses; p. 531-41.Лукашев, А.Н. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 – возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. / А.Н. Лукашев [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2008. – Т. 53, № 1. – С. 16–21.Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii. 2008; 53(1): 16-21 (in Russian).Khetsuriani N, Lamonte-Fowlkes A, Oberste S, et al. Enterovirus surveillance – United States, 1970 – 2005. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (8):1–20.Khetsuriani N, Lamonte-Fowlkes A, Oberste S, et al. Enterovirus surveillance – United States, 1970 – 2005. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (8):1–20.Zang Y, Wang D, Yan D, et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1coxsaсkievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China. J. Clin. Microbiol. 2010 Feb; 48 (2): 619-22.Zang Y, Wang D, Yan D, et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1coxsaсkievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China. J. Clin. Microbiol. 2010 Feb; 48 (2): 619-22.Бичурина, М.А. Сезонный подъем заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Новгородской области / М.А. Бичурина [и др.] // Журнал Инфекция и Иммунитет. – 2012. – Т. 2, № 4. – С. 747–752.Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A et al. Infectsya i immunitet. 2012; 2(4): 747-752 (in Russian).Шишко, Л.А. Этиология сезонных подъёмов заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Архангельской области / Л.А. Шишко [и др.] // Журнал Инфекция и Иммунитет. – 2013. – Т. 3, № 2. – С. 65–72.Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. et al. Infectsya i immunitet. 2013; 3(2): 65-72 (in Russian).Бичурина, М.А. Роль энтеровируса ECHO30 в этиологии энтеровирусной инфекции на Северо-западе России в 2013 году / М.А. Бичурина [и др.] // Журнал инфектологии. – 2014. – Т. 6, № 3. – С. 84–91.Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Golitsyna L.N. et al. Jurnal infectologii. 2014. 6(3): 84-91 (in Russian).Österback R, Vuorinen T, Linna M, et al. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland. Emerg Infect Dis. 2009 Sep; 15(9):1485-88.Österback R, Vuorinen T, Linna M, et al. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland. Emerg Infect Dis. 2009 Sep; 15(9):1485-88.Bracho MA, Gonza´lez-Candelas F, Valero A, et al. Enterovirus co-infections and onychomadesis after hand, foot, and mouth disease, Spain, 2008. Emerg. Infect. Dis. 2011 Dec; 17 (12): 2223-31.Bracho MA, Gonza´lez-Candelas F, Valero A, et al. Enterovirus co-infections and onychomadesis after hand, foot, and mouth disease, Spain, 2008. Emerg. Infect. Dis. 2011 Dec; 17 (12): 2223-31.He YQ, Chen L, Xu WB, et al. Emergence, Circulation, and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. J. Clin. Microbiol. 2013 Nov; 51 (11): 3560-66.He YQ, Chen L, Xu WB, et al. Emergence, Circulation, and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. J. Clin. Microbiol. 2013 Nov; 51 (11): 3560-66.Bian L, Wang Y, Mao Q, et al. Coxsackitvirus A6: a new emerging pathogen causing hand, foot and mouth disease out breaks worldwide. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2015 Jun; 13 (9): 1061-71.Bian L, Wang Y, Mao Q, et al. Coxsackitvirus A6: a new emerging pathogen causing hand, foot and mouth disease outbreaks worldwide. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2015 Jun; 13 (9): 1061-71.Романенкова, Н.И. Надзор за полиомиелитом и энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Российской Федерации / Н.И. Романенкова, М.А. Бичурина, Н.Р. Розаева // Журн. микробиол. – 2011. – № 6. – С. 32–36.Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii. 2011; 6: 32-36 (in Russian).Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10. Geneva (Switzerland): World Health Organization; 2004. 157 p.Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10. Geneva (Switzerland): World Health Organization; c 2004. 157 p.Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. Clin. Microbiol. 2006 Aug; 44 (8): 2698-704.Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. Clin. Microbiol. 2006 Aug; 44 (8): 2698-704.Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 2011 Oct; 28 (10): 2731-39.Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 2011 Oct; 28 (10): 2731-39.Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012) Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012 Feb; 29 (8): 1969-73.Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012) Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012 Feb; 29 (8): 1969-73.Chen X., Li J., Guo J., Xu W., Sun S., Xie Z. An outbreak of echovirus 18 encephalitis/meningitis in children in Hebei Province, China, 2015. Emerg Microbes Infect. 2017 Jun; 6(6): e54.Chen X., Li J., Guo J., Xu W., Sun S., Xie Z. An outbreak of echovirus 18 encephalitis/meningitis in children in Hebei Province, China, 2015. Emerg Microbes Infect. 2017 Jun;6(6):e54.Zhang H., Zhao Y., Liu H., Sun H., Huang X., Yang Z., Ma S. Molecular characterization of two novel echovirus 18 recombinants associated with hand-foot-mouth disease. Sci Rep. 2017 Aug; 7(1): 8448.Zhang H., Zhao Y., Liu H., Sun H., Huang X., Yang Z., Ma S. Molecular characterization of two novel echovirus 18 recombinants associated with hand-foot-mouth disease. Sci Rep. 2017 Aug;7(1):8448.Романенкова, Н.И. Неполиомиелитные энтеровирусы, обусловившие подъем заболеваемости энтеровирусной инфекцией на ряде территорий России в 2016 году / Н.И. Романенкова [и др.] // Журнал инфектологии. – 2017. – Т. 9, № 3. – С. 98–108.Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Golitsyna L.N. et al. Jurnal infectologii. 2017; 9(3): 98-108 (in Russian).Новикова, Н.А. Молекулярный мониторинг неполиомиелитных энтеровирусов на территории России в 2008- 2011 г. / Н.А. Новикова [и др.] // Журн. микробиол. – 2013. – № 1. – С. 75–78.Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. Zhurnal mikrobiologii. 2013; 1: 75-78 (in Russian).Голицына, Л.Н. Неполиомиелитные вирусы в Российской Федерации в 2017 году / Л.Н. Голицына [и др.] // Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. Информационный бюллетень №5 [Internet]. – Нижний Новгород, 2018, Май [cited 2018 Jun 26];4:2-12. Available from: http:// www.nniiem.ru/file/razrabotki/2018/byulleten-evi-2017-n5-may-18-1.pdfGolitsyna L.N., Zverev V.V., Epifanova N.V. et al. Information bulletin (Internet). Nizhny Novgorod; 2018. [cited 2018 Jun 26];5:2-12. Available from: [http://www.nniiem.ru/file/razrabotki/2018/byulleten-evi-2017-n5-may-18-1.pdf] (in Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.