jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2017-9-3-98-108jofin-639Research ArticleЭпидемиологияEpidemiologyНЕПОЛИОМИЕЛИТНЫЕ ЭНТЕРОВИРУС Ы, ОБУСЛОВИВШИЕ ПОДЪЕМ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ НА РЯДЕ ТЕРРИТОРИЙ РОССИИ В 2016 Г.NONPOLIO ENTEROVIRUSES WHICH CAUSED THE RISE OF ENTEROVIRUS INFECTION ON SOME TERRITORIES OF RUSSIA IN 2016РоманенковаН. И.RomanenkovaN. I.

Санкт-Петербург 

Романенкова Наталья Ивановна – ведущий научный сотрудник, кандидат медицинских наук

poliospb@NR3854.spb.eduБичуринаМ. А.BichurinaM. A.

Санкт-Петербург 

Бичурина Маина Александровна – заведующая лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций, доктор медицинских наук

poliospb@NR3854.spb.eduГолицынаЛ. Н.GolitsynaL. N.

Нижний Новгород 

Голицына Людмила Николаевна – ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук

mevirfc@rambler.ruРозаеваН. Р.RozaevaN. R.

Санкт-Петербург 

Розаева Надежда Рашитовна – старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук

poliospb@NR3854.spb.eduКанаеваО. И.KanaevaO. I.

Санкт-Петербург 

Канаева Ольга Ильинична – научный сотрудник 

ol.kanaeva@yandex.ruЧеркасскаяИ. В.CherkasskayaI. V.

Саратов 

Черкасская Ирина Валерьевна – главный специалист-эксперт отдела эпидемиологического надзора 

Cherkasskaja_IV@64.rospotrebnadzor.ruКирилловаЛ. П.KirillovaL. P.

Саратов 

Кириллова Лидия Петровна – начальник вирусологического отделения микробиологической лаборатории

fbuz@gigiena-saratov.ruБатаеваА. Ю.BataevaA. Yu.

Кострома 

Батаева Анна Юрьевна – заместитель руководителя Управления 

central@44.rospotrebnadzor.ruБарышниковаА. С.BaryshnikovaA. S.

Кострома 

Барышникова Анастасия Сергеевна – врач-вирусолог отделения вирусологических исследований микробиологической лаборатории 

central@fguz44.ruНовиковаН. А.NovikovaN. A.

Нижний Новгород 

Новикова Надежда Алексеевна – заведующая лабораторией молекулярной эпидемиологии вирусных инфекций, доктор биологических наук

mevirfc@rambler.ruСанкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени ПастераРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after PasteurRussian FederationНижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. БлохинойРоссияNizhny Novgorod Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after academician I.N. BlokhinaRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Саратовской областиРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Saratov RegionRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Саратовской областиРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Saratov RegionRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Костромской областиРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Kostroma RegionRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Костромской областиРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Kostroma RegionRussian Federation2017131020179398108Copyright © Романенкова Н.И., Бичурина М.А., Голицына Л.Н., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Черкасская И.В., Кириллова Л.П., Батаева А.Ю., Барышникова А.С., Новикова Н.А., 20172017Романенкова Н.И., Бичурина М.А., Голицына Л.Н., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Черкасская И.В., Кириллова Л.П., Батаева А.Ю., Барышникова А.С., Новикова Н.А.Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Golitsyna L.N., Rozaeva N.R., Kanaeva O.I., Cherkasskaya I.V., Kirillova L.P., Bataeva A.Y., Baryshnikova A.S., Novikova N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/639Цель

Цель: характеристика особенностей заболеваемости и этиологического фактора энтеровирусной инфекции (ЭВИ) на ряде территорий России в 2016 г.

Материалы и методы

Материалы и методы: исследовано 2138 проб фекалий от больных ЭВИ. Выделение и идентификацию энтеровирусов проводили вирусологическим методом и путём частичного секвенирования области генома VP1. Филогенетические деревья были построены методом Bayesian Monte Carlo Markov Chain.

Результаты

Результаты: Эпидемические подъемы заболеваемости ЭВИ в 2016 г. были отмечены на ряде территорий России. В Саратовской области средний многолетний показатель заболеваемости ЭВИ был превышен в два раза. Показатель заболеваемости энтеровирусным менингитом – 3,21 на 100 000 населения (77% от всех случаев ЭВИ) – был выше, чем на других территориях. В Костромской области показатель заболеваемости ЭВИ в 2016 г. был превышен в 11 раз по сравнению с предыдущим годом. На обеих территориях рост заболеваемости был связан с активным включением в циркуляцию энтеровируса ECHO30. Вирусы ЕСНО30 из Саратовской области принадлежали генотипу h и относились к двум филогенетическим группам, в одну из которых вошли также штаммы, изолированные от больных ЭВИ в Костромской области. В Мурманской и Ленинградской областях в 2016 г. заболевания протекали в основном в видевирусной экзантемы полости рта и конечностей, были зарегистрированы групповые очаги в детских дошкольных учреждениях. Этиологическим фактором оказались вирусы Коксаки A6, которые относились к разным генетическим вариантам.

Заключение

Заключение: эпидемические подъемы заболеваемости энтеровирусной инфекцией с преобладанием различных клинических форм заболевания были обусловлены разными этиологическими факторами. На территориях, где превалировала клиника энтеровирусного менингита, в качестве этиологического агента были детектированы энтеровирусы ЕСНО 30, которые принадлежали к разным вариантам генотипа h. У больных с клиникой вирусной экзантемы полости рта и конечностей на территориях, где эта клиническая форма была ведущей, основным этиологическим фактором были вирусы Коксаки A6 разных генетических вариантов.

Aim

Aim: Characteristics of the peculiarities and the etiological factor of enterovirus infection on some territories of Russia in 2016.

Materials and methods

Materials and methods: We investigated 2138 samples from the patients with enterovirus infection. The isolation and identification of enteroviruses were conducted by the virological method and by partial sequencing of the genome region VP1. Phylogenic trees were constructed according to the method of Bayesian Monte Carlo Markov Chain.

Results

Results: Epidemic peaks of enterovirus infection were fixed on some territories of Russia. In Saratov region the morbidity index of enterovirus infection in 2016 was twice as high as the median morbidity index over previous years. The morbidity level of enterovirus meningitis – 3, 21 for 100000 of the population (77% from all the cases of enterovirus infection) was higher than on the other territories. In Kostroma region the morbidity index of enterovirus infection in 2016 was 11 times higher than the index of the previous year. On both territories the rise of morbidity depends on the active circulation of enterovirus ЕСНО30. Enteroviruses ECHO30 from Saratov region belonged to two phylogenic groups of genotype h. To one of them belonged viruses ECHO30 from Kostroma region. In Murmansk and Leningrad regions in 2016 most cases of enterovirus infection were represented by hand, foot and mouth disease (HFMD). The grouped foci of infection were registered in some preschool institutions. The etiological factor of this clinical form was Coxsackieviruses A6 belonging to different genetic variants.

Conclusion

Conclusion: Epidemic peaks of enterovirus infection with the prevalence of different clinical forms of the disease were provoked by different etiological factors. On territories where enterovirus meningitis prevailed strains of enterovirus ECHO30 belonging to different variants of genotype h were detected. In patients with clinical picture of HFMD from territories where this form was leading the etiological factor of infection was Coxsackievirus A6 of different genetic variants.

энтеровирусная инфекцияэнтеровирусыциркуляциядетекцияидентификацияфилогенетический анализenterovirus infectionenterovirusescirculationdetectionidentificationphylogenic analysisReferencesОнищенко, Г.Г. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты / Г.Г. Онищенко [и др.] // Журн. микробиол. – 2009. – № 2. – С. 24–30.Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I., et al. Jurnal microbiologii. 2009; 2: 24-30 (in Russian).Бичурина, М.А. Сезонный подъем заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Новгородской области / М.А. Бичурина [и др.] // Инфекция и Иммунитет. – 2012. – Т. 2, № 4. – С. 747–752.Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A et al. Infectsya i immunitet. 2012; 2(4): 747-752 (in Russian).Шишко, Л.А. Этиология сезонных подъёмов заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Архангельской области / Л.А. Шишко [и др.] // Инфекция и Иммунитет. – 2013. – Т. 3, № 2. – С. 65–72.Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. et al. Infectsya i immunitet. 2013; 3(2): 65-72 (in Russian).Бичурина, М.А. Роль энтеровируса ECHO30 в этиологии энтеровирусной инфекции на Северо-западе России в 2013 году / М.А. Бичурина [и др.] // Журнал инфектологии. – 2014. – Т. 6, № 3. – С. 84–91.Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Golitsyna L.N. et al. Jurnal infectologii. 2014. 6(3): 84-91 (in Russian).Бичурина, М.А. Групповые заболевания энтеровирусной инфекцией, обусловленные вирусами Коксаки А16, на Северо-западе России / М.А. Бичурина [и др.] // Журн. микробиол. – 2014. – № 2. – С. 51–58.Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Novikova N.A. et al. Jurnal microbiologii. 2014; 2: 51-58 (in Russian).Ray CG. Sherris Medical Microbiology. 4th ed. NY (USA): The McGraw-Hill Companies; c2004. Chapter 12, Enteroviruses; p. 531-41.Ray CG. Sherris Medical Microbiology. 4th ed. NY (USA): The McGraw-Hill Companies; c2004. Chapter 12, Enteroviruses; p. 531-41.Лукашев, А.Н. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 – возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. / А.Н. Лукашев [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2008. – Т. 53, № 1. – С. 16–21.Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii. 2008; 53(1): 16-21 (in Russian).Романенкова, Н.И. Надзор за полиомиелитом и энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Российской Федерации / Н.И. Романенкова, М.А. Бичурина, Н.Р. Розаева // Журн. микробиол. – 2011. – № 6. – С. 32–36.Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii. 2011; 6: 32-36 (in Russian).Khetsuriani N, Lamonte-Fowlkes A, Oberste S, et al. Enterovirus surveillance – United States, 1970 – 2005. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (8):1–20.Khetsuriani N, Lamonte-Fowlkes A, Oberste S, et al. Enterovirus surveillance – United States, 1970 – 2005. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006; 55 (8):1–20.Zang Y, Wang D, Yan D, et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1coxsaсkievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China. J. Clin. Microbiol. 2010 Feb; 48 (2): 619-22.Zang Y, Wang D, Yan D, et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1coxsaсkievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China. J. Clin. Microbiol. 2010 Feb; 48 (2): 619-22.Osterback R, Vuorinen T, Linna M, et al. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland. Emerg Infect Dis. 2009 Sep; 15(9):1485-88.Osterback R, Vuorinen T, Linna M, et al. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland. Emerg Infect Dis. 2009 Sep; 15(9):1485-88.Bracho MA, Gonza.lez-Candelas F, Valero A, et al. Enterovirus co-infections and onychomadesis after hand, foot, and mouth disease, Spain, 2008. Emerg. Infect. Dis. 2011 Dec; 17 (12): 2223-31.Bracho MA, Gonza.lez-Candelas F, Valero A, et al. Enterovirus co-infections and onychomadesis after hand, foot, and mouth disease, Spain, 2008. Emerg. Infect. Dis. 2011 Dec; 17 (12): 2223-31.He YQ, Chen L, Xu WB, et al. Emergence, Circulation, and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. J. Clin. Microbiol. 2013 Nov; 51 (11): 3560-66.He YQ, Chen L, Xu WB, et al. Emergence, Circulation, and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. J. Clin. Microbiol. 2013 Nov; 51 (11): 3560-66.Bian L, Wang Y, Mao Q, et al. Coxsackitvirus A6: a new emerging pathogen causing hand, foot and mouth disease outbreaks worldwide. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2015 Jun; 13 (9): 1061-71.Bian L, Wang Y, Mao Q, et al. Coxsackitvirus A6: a new emerging pathogen causing hand, foot and mouth disease outbreaks worldwide. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2015 Jun; 13 (9): 1061-71.Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10. Geneva (Switzerland): World Health Organization; 2004. 157 p.Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10. Geneva (Switzerland): World Health Organization; c 2004. 157 p.Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. Clin. Microbiol. 2006 Aug; 44 (8): 2698-704.Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. Clin. Microbiol. 2006 Aug; 44 (8): 2698-704.Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 2011 Oct; 28 (10): 2731-39.Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 2011 Oct; 28 (10): 2731-39.Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012) Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012 Feb; 29 (8): 1969-73.Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012) Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012 Feb; 29 (8): 1969-73.Новикова, Н.А. Молекулярный мониторинг неполиомиелитных энтеровирусов на территории России в 2008–2011г. / Н.А. Новикова [и др.] // Журн. микробиол. – 2013. – № 1. – С. 75–78.Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. Zhurnal mikrobiologii. 2013; 1: 75–78 (in Russian).Голицына, Л.Н. Неполиомиелитные вирусы в Российской Федерации в 2016 году. Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. Информационный бюллетень / Л.Н. Голицына [и др.]. – Нижний Новгород, 2017. – http://www.nniiem.ru/file/news/2017/byulleten-evi-n4-2017-sayt.pdf.Golitsyna L.N., Zverev V.V., Epifanova N.V. et al. Zabolevaemost, etiologicheskaya structura i voprosy proilaktiki enterovirusnoy (nepolio) infektsii. Information bulletin (Internet). Nizhny Novgorod; 2017. [cited 2017 Jun 6]; 4: 25-31. Available from: http://www.nniiem.ru/file/news/2017/byulleten-evi-n42017-sayt.pdf (in Russian).Bailly JL, Mirand A, Henquell C, et al. Phylogeography of circulating populations of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene. Infect. Genet. Evol. 2009 Jul; 9 (4): 699-708.Bailly JL, Mirand A, Henquell C, et al. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene. Infect. Genet. Evol. 2009 Jul; 9 (4): 699-708.Голицына, Л.Н. Молекулярная характеристика эпидемического варианта вируса ЕСНО30-2013 / Л.Н. Голицына [и др.] // Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием "Молекулярная диагностика-2014". – М., 2014. – Т. 1. – С. 416–417.Golitsyna L.N., Novikova N.A., Fomina S.G., et al. Sbornik trudov VIII Vserossiyskoy nauchno-prakticheskoy konferentsii “Molekulyarnaya diagnostika” [The 8th Russia-wide scientific conference with international participation “Molecular Diagnostics 2014”]. Vol.1. Moscow; 2014. P. 416-17 (in Russian).Yang XH, Yan YS, Weng YW Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011. J. Med. Virol. 2013 Apr; 85 (4): 696-702.Yang XH, Yan YS, Weng YW Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011. J. Med. Virol. 2013 Apr; 85 (4): 696-702.Сапега, Е.Ю. Эпидемиологическая ситуация по энтеровирусной инфекции в Дальневосточном федеральном округе в 2016 году. Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. Информационный бюллетень / Е.Ю. Сапега, Л.В. Бутакова, О.Е. Троценко. – Нижний Новгород, 2017. – http://www.nniiem.ru/file/news/2017/byulleten-evi-n42017-sayt.pdf.Sapega E.Y., Trotsenko O.E., Butakova L.V. Zabolevaemost, etiologicheskaya structura i voprosy proilaktiki enterovirusnoy (nepolio) infektsii. Information bulletin (Internet). Nizhny Novgorod; 2017. [cited 2017 Jun 6]; 4: 25-31. Available from: http://www.nniiem.ru/file/news/2017/byulleten-evi-n42017-sayt.pdf (in Russian).Голицына, Л.Н. Вирус Коксаки А6 в Российской Федерации в 2014 году / Л.Н. Голицына [и др.] // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2015. – № 28. – С. 12–20.Golitsyna L.N., Zverev V.V., Parfenova O.V., et al. Dalnevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii. 2015; 28: 12-20 (in Russian).Puenpa J, Vonqpunsawad S, Osterback R, et al. Molecular epidemiology and evolution of human coxsackievirus A6. J. Gen. Virol. 2016 Dec; 97 (12): 3225-31.Puenpa J, Vonqpunsawad S, Osterback R, et al. Molecular epidemiology and evolution of human coxsackievirus A6. J. Gen. Virol. 2016 Dec; 97 (12): 3225-31.Новик, Е.С. Значимость водного фактора в возникновении вспышек энтеровирусной инфекции на территории Хабаровского края / Е.С. Новик [и др.] // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2009. – № 14. – С. 6–13.Novik E.S., Reznik V.I., Karavyanskaya T.N. et al. Dalnevostochnyi zhurnal infektsionnoi patologii. 2009; 14: 6-13 (in Russian).Hovi T, Stenvik M, Partanen H, Kangas A. Poliovirus surveillance by examining sewage specimens. Quantitative recovery of virus after introduction into sewage at remote upstream location. J. Epidemiol. Infect. 2001 Aug; 127 (1): 101-6.Hovi T, Stenvik M, Partanen H, Kangas A. Poliovirus surveillance by examining sewage specimens. Quantitative recovery of virus after introduction into sewage at remote upstream location. J. Epidemiol. Infect. 2001 Aug; 127 (1): 101–6.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.