Цель

jofin

Журнал инфектологии

Journal Infectology

2072-6732

IPO “АIDSSPbR"

jofin-463

Research Article

Оригинальные исследования

Original Research

К ВОПРОСУ О МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭПИДЕМИОЛОГИИ ГЕПАТИТА B В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)

For the question about Molecular Epidemiology of Hepatitis B Virus Infection in the Republic Sakha (Yakutia)

Семенов

А. В.

Semenov

A. V.

заведующий лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, доцент кафедры иммунологии Первого Санкт-Петербургского государственного медицинского университета имени академика И.П. Павлова; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, к.б.н.; тел.: 8(812)233-20-92

alexvsemenov@yahoo.com

Останкова

Ю. В.

Ostankova

Yu. V.

научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; тел.: 8(812)233-20-92

shenna1@yandex.ru

Герасимова

В. В.

Gerasimova

V. V.

врач-вирусолог высшей квалификационной категории, научный сотрудник учебно-научной лаборатории «Геномная медицина» клиники медицинского института Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова; тел.: +7(4112)36-05-04

virlab@mail.ru

Бичурина

М. А.

Bichurina

M. A.

заведующая лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, д.м.н.; тел.: 8(812)233-21-56

poliospb@nr3854.spb.edu

Мукомолов

С. Л.

Mukomolov

S. L.

kafedrabk@mail.ru

Козлов

А. В.

Kozlov

A. V.

заведующий кафедрой клинической лабораторной диагностики Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, д.м.н., профессор; тел.: 8(812)275-19-01

totolian@pasteurorg.ru

Тотолян

А. А.

Totolian

A. A.

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова, Санкт-Петербург, Россия Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург, РоссияРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur, Saint Petersburg, Russia First Saint-Petersburg State Medical University named after acad. I.P. Pavlov, Saint Petersburg, Russia North-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov, Saint Petersburg, RussiaRussian Federation

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, РоссияРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur, Saint Petersburg, RussiaRussian Federation

Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, Якутск, РоссияРоссияNorth-Eastern Federal University named after M.K. Ammosov, Yakutsk, RussiaRussian Federation

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова, Санкт-Петербург, РоссияРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur, Saint Petersburg, Russia First Saint-Petersburg State Medical University named after acad. I.P. Pavlov, Saint Petersburg, RussiaRussian Federation

Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург, РоссияРоссияNorth-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov, Saint Petersburg, RussiaRussian Federation

2016

15042016

815765

2016

Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Мукомолов С.Л., Козлов А.В., Тотолян А.А.

Semenov A.V., Ostankova Y.V., Gerasimova V.V., Bichurina M.A., Mukomolov S.L., Kozlov A.V., Totolian A.A.

Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.

https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/463

Цель

Цель: оценить распространенность генетических вариантов и особенности молекулярной эпидемиологии вируса гепатита В (ВГВ) у жителей Якутии с диагнозом «Хронический вирусный гепатит В (ХВГВ)».

Материалы и методы

Материалы и методы: обследовано 35 пациентов с хроническим вирусным гепатитом В из городских и сельских районов республики Саха, при этом большую часть группы составили представители автохтонного населения. В настоящем исследовании мы применили генотипирование на основе прямого секвенирования Pre-S1/ Pre-S2/S области ДНК ВГВ.

Результаты

Результаты: на основании филогенетического анализа изолятов показано, что среди обследованных больных ХВГВ выявлен только генотип D, являющийся наиболее распространенным генотипом ВГВ в РФ. При этом показано преобладание ВГВ субтипа D2 (85,8%) по сравнению с ВГВ субтипа D3 (14,2%).

Заключение

Заключение: выявленные нами четко кластеризующиеся группы изолятов ВГВ и тесные связи внутри групп говорят о существовании как минимум четырех постоянных источников инфицирования, действующих на протяжении нескольких лет и десятилетий. Систематическое применение комплекса молекулярных, вирусологических, эпидемиологических методов и молекулярной филогенетики дает дополнительную клиническую информацию, способствует углублению понимания особенностей эпидемического процесса по ВГВ, а также совершенствованию системы эпидемиологического надзора.

Objective

Objective: To estimate the prevalence of genetic variants and features of the molecular epidemiology of HBV in Yakutia residents suffering from HBV.

Materials and methods

Materials and methods: The study involved 35 patients with chronic hepatitis B from urban and rural areas of Yakutia while most of the group were representatives of the autochthonous population. In the present study we used genotyping by direct sequencing of the Pre-S1 / Pre-S2 / S region of HBV DNA.

Results

Results: Based on the phylogenetic analysis of the isolates showed that among patients examined HBV identified only D genotype, which is the most common genotype of HBV in the Russian Federation. It is shown prevalence of HBV subtype D2 (85,8%) compared to the HBV subtype D3 (14,2%).

Conclusion

Conclusion: We identified clearly clustered group of HBV isolates and close ties within the group, which suggests the existence of at least four permanent sources of infection, acting for a few years and decades. The systematic application of complex molecular, virological, epidemiological methods and molecular phylogenetics could contribute to the current understanding of the epidemiology of HBV and improve the quality of the traditional methods of supervision in Russia.

гепатит Bгенотипированиесеквенированиегенотипсубтипмолекулярная эпидемиологияфилогенияРеспублика Саха (Якутия).

hepatitis Bgenotypingsequencinggenotypesubtypemolecular epidemiologyphylogenyRepublic SakhaYakutia.

References1

Нечаев, В.В. Хронические вирусные гепатиты: прошлое, настоящее, будущее / В.В. Нечаев, С.Л. Мукомолов, В.Ю. Назаров, Л.Н. Пожидаева, В.В. Чахарьян // Эпидемиология и инфекционные болезни. – 2013. – № 3. – C. 4-10.

Nechaev, V.V. Hronicheskie virusnye gepatity: proshloe, nastoyashchee, budushchee / V.V. Nechaev, S.L. Mukomolov, V.YU. Nazarov, L.N. Pozhidaeva, V.V. CHahar’yan // Ehpidemiologiya i infekcionnye bolezni. – 2013. – № 3. – C. 4-10. (In Russia)

World Health Organization. Hepatitis B factsheet N°204 Updated July 2015. [Internet] Geneva: WHO, 2015. Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs204/en/

Hepatitis B general fact sheet. Centre for Disease Control and Prevention. 2010; Publication №. 21-1073.

Yuen, M.F. Hepatitis B virus genotypes: natural history and implications for treatment / M.F. Yuen, C.L. Lai // Expert Rev. Gastroenterol. Hepatol. – 2007. – vol. 1. – P. 321–328.

Мукомолов, С.Л. Применение иммуноглобулина против гепатита в для профилактики этой инфекции / С.Л. Мукомолов, М.И. Михайлов // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2014. – № 1. – С. 47-54.

Mukomolov, S.L. Primenenie immunoglobulina protiv gepatita v dlya profilaktiki ehtoj infekcii / S.L. Mukomolov, M.I. Mihajlov // Ehpidemiologiya i infekcionnye bolezni. Aktual’nye voprosy. – 2014. – № 1. – S. 47-54. (In Russia)

Елпаева, Е.А. Генотипическая характеристика вируса гепатита В у хронически инфицированных больных / Елпаева Е.А., Порецкова Е.А., Писарева М.А., Ковеленов А.Ю., Аликян И.С., Гальбрайх Р.Б., Грудинин М.П., Эсауленко Е.В. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2009. – № 15. – С. 55-58.

Elpaeva, E.A. Genotipicheskaya harakteristika virusa gepatita V u hronicheski inficirovannyh bol’nyh / Elpaeva E.A., Poreckova E.A., Pisareva M.A., Kovelenov A.YU., Alikyan I.S., Gal’brajh R.B., Grudinin M.P., Esaulenko E.V. // Dal’nevostochnyj zhurnal infekcionnoj patologii. – 2009. – № 15. – S. 55-58. (In Russia)

Khan, A. Epidemiological and clinical evaluation of hepatitis B, hepatitis C, and delta hepatitis viruses in Tajikistan / A. Khan, F. Kurbanov, Y. Tanaka, A. Elkady, M. Sugiyama, A. Dustov, M. Mizokami // J. Med. Virol. – 2008. – vol. 80 (2). – P. 268-276.

Kato, H. Hepatitis B virus genotypes in Uzbekistan and validity of two different systems for genotyping / H. Kato, R. Ruzibakiev, N. Yuldasheva, T. Hegay, F. Kurbanov, B. Achundjanov, L. Tuichiev, S. Usuda, R. Ueda, M. Mizokami // J. Med. Virol. – 2002. – vol. 67 (4). – P. 477-483.

Елпаева, Е. А. Роль мутантных форм вируса гепатита В в прогрессирующем течении хронического гепатита В / Е. А. Елпаева, М. М. Писарева, О. Е. Никитина, С. Н. Кижло, М. П. Грудинин, О. П. Дуданова // Ученые записки Петрозаводского Государственного университета. Cерия: естественные и технические науки. – 2014. – т. 6. – C. 41-46.

Elpaeva, E. A. Rol’ mutantnyh form virusa gepatita V v progressiruyushchem techenii hronicheskogo gepatita V / E. A. Elpaeva, M. M. Pisareva, O. E. Nikitina, S. N. Kizhlo, M. P. Grudinin, O. P. Dudanova // Uchenye zapiski Petrozavodskogo Gosudarstvennogo universiteta. Ceriya: estestvennye i tekhnicheskie nauki. – 2014. – t. 6. – C. 41-46. (In Russia)

Писарева, М. М. Молекулярно-биологические особенности вируса гепатита B дикой и мутантной форм в трех регионах Российской Федерации: автореф. дис. … канд. биол. наук / М. М. Писарева. – СПб., 2007. – 110 с.

PisarevaPisareva, M. M. Molekulyarno-biologicheskie osobennosti virusa gepatita B dikoj i mutantnoj form v trekh regionah Rossijskoj Federacii: avtoref. dis. … kand. biol. nauk / M. M. Pisareva. – SPb., 2007. – 110 s. (In Russia)

Guirgis, B.S.S., Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical implications / B.S.S. Guirgis, R.O. Abbas, H.M.E. Azzazy // Int. J. Infect. Dis. – 2010. – vol. 14. – P. 941-953.

Семенов, А.В., Молекулярно-эпидемиологические особенности изолятов вируса гепатита С из разных регионов Республики Саха (Якутия) / Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л., Тотолян Арег А. // Инфекция и иммунитет. – 2015. – Т. 5. № 4. – С. 359-372.

Semenov, A.V., Molekulyarno-ehpidemiologicheskie osobennosti izolyatov virusa gepatita S iz raznyh regionov Respubliki Saha (YAkutiya) / Semenov A.V., Ostankova YU.V., Gerasimova V.V., Bichurina M.A., Kozlov A.V., Mukomolov S.L., Totolyan Areg A. // Infekciya i immunitet. – 2015. – T. 5. № 4. – S. 359-372. (In Russia)

Brichler, S. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique / S. Brichler, G. Lagathu, M.A. Chekaraou, F. Le Gal, A. Edouard, P. Dény, R. Césaire, E. Gordien // J. Gen. Virol. – 2013. – vol. 94 (Pt 10). – P. 2318-2329.

Higgins, D.G. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment / D.G. Higgins, A.J. Bleasby, R. Fuchs // Comput. Appl. Biosci. – 1992. – vol. 8. – P. 189–191.

Tamura, K. Nei: MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D.

Tamura, K. Nei: MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher // Mol. Biol. Evol. – 2011. – vol. 28. – P. 2731–2739.

Peterson, N. Peterson, G. Stecher // Mol. Biol. Evol. – 2011. – vol. 28. – P. 2731–2739.

Deterding, K. Pevalence of HBV genotypes in Central and Eastern Europe / K. Deterding, I. Constantinescu, F.D. Nedelcu, J. Gervain, V. Nemecek, O. Srtunecky, A. Vince, I. Grgurevic, K.P. Bielawski, M. Zalewska // J. Med. Virol. – 2008. – vol. 80. – P. 1707–1711.

Deterding, K. Prevalence of HBV genotypes in Central and Eastern Europe / K. Deterding, I. Constantinescu, F.D. Nedelcu, J. Gervain, V. Nemecek, O. Srtunecky, A. Vince, I. Grgurevic, K.P. Bielawski, M. Zalewska // J. Med. Virol. – 2008. – vol. 80. – P. 1707–1711.

Dzierzanowska-Fangrat, K. Hepatitis B virus genotypes in children with chronic hepatitis B in Poland / K. Dzierzanowska- Fangrat, M. Woynarowski, I. Szczygielska, P. Jozwiak, J. Cielecka-Kuszyk, D. Dzierzanowska, K. Madalinski // Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. – 2006. – vol. 18. – P. 655–658.

Indeeva, L.D. EHpidemiologicheskaya i kliniko-morfologicheskaya harakteristika gepatitov B i C i geterogennost’ ih vozbuditelej v Respublike Saha (YAkutiya): avtoref. dis. ... kand. med. Nauk / L.D. Indeeva. – M., 2010. – 25 s. (In Russia)

Индеева, Л.Д. Эпидемиологическая и клинико-морфологическая характеристика гепатитов B и C и гетерогенность их возбудителей в Республике Саха (Якутия): автореф. дис. ... канд. мед. Наук / Л.Д. Индеева. – М., 2010. – 25 с.

Kuzin, S.N. Geneticheskoe raznoobrazie virusa gepatita V na territorii Respubliki Saha (YAkutiya) / S.N. Kuzin, N.N. Zabelin, E.I. Samohvalov // EHpidemiologiya i vakcinoprofilaktika. – 2008. – t. 5. – S. 1–5. (In Russia)

Кузин, С.Н. Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия) / С.Н. Кузин, Н.Н. Забелин, Е.И. Самохвалов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2008. – т. 5. – С. 1–5.

Morozov, V. M. Molekulyarno-geneticheskaya harakteristika variantov virusa gepatita V, cirkuliruyushchih v Sankt-Peterburge i YAkutii: avtoref. dis. … kand. biol. nauk / V. M. Morozov. – SPb., 2003. – 127 s. (In Russia)

Морозов, В. М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса гепатита В, циркулирующих в Санкт-Петербурге и Якутии: автореф. дис. … канд. биол. наук / В. М. Морозов. – СПб., 2003. – 127 с.

Zotova, A.V. Rasprostranennost’ virusnyh gepatitov V i S sredi olenevodov-kochevnikov v Respublike Saha (YAkutiya) / A.V. Zotova, O.E. Popova, K.K. Kyuregyan // Materialy VII Rossijskoj nauchno-prakticheskoj konferencii s mezhdunarodnym uchastiem «Virusnye gepatity – ehpidemiologiya, diagnostika, lechenie i profilaktika». – 2007. – S. 28–29. (In Russia)

Зотова, А.В. Распространенность вирусных гепатитов В и С среди оленеводов-кочевников в Республике Саха (Якутия) / А.В. Зотова, О.Е. Попова, К.К. Кюрегян // Материалы VII Российской научно-практической конференции с международным участием “Вирусные гепатиты – эпидемиология, диагностика, лечение и профилактика”. – 2007. – С. 28–29.

Manujlov, V.A. Razlichnaya vstrechaemost’ subgenotipov virusa gepatita V i subtipov HBsAg u korennogo naseleniya Sibiri / V.A. Manujlov, E.V. CHub, I.G. Netesova // Materialy VII Rossijskoj nauchno-prakticheskoj konferencii s mezhdunarodnym uchastiem «Virusnye gepatity – ehpidemiologiya, diagnostika, lechenie i profilaktika». – 2007. – C. 45–46. (In Russia)

Мануйлов, В.А. Различная встречаемость субгенотипов вируса гепатита В и субтипов HBsAg у коренного населения Сибири / В.А. Мануйлов, Е.В. Чуб, И.Г. Нетесова // Материалы VII Российской научно-практической конференции с международным участием “Вирусные гепатиты – эпидемиология, диагностика, лечение и профилактика”. – 2007. – C. 45–46.

Ramachandran, S. Recent Population Expansions of Hepatitis B Virus in the United States / S. Ramachandran, M.A. Purdy, G. Xia, D.S. Campo, Z.E. Dimitrova, E.H. Teshale, Ch.G. Teo, Y.E. Khudyakov // Virol. – 2014. – vol. 88 (24). – P. 13971–13980.

Tallo, T. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova, T. Krispin, L. Priimagi, S. Mukomolov, M. Mikhailov, L. O. Magnius // J. Med. Virol. – 2004. – vol. 74. – P. 221–227.

Gerasimova, V.V. Molekulyarnaya ehpidemiologiya virusa gepatita V v YAkutii / V.V. Gerasimova, N.R. Maksimova, I.A. Levakova, S.L. Mukomolov // YAkutskij medicinskij zhurnal. – 2014. – № 3 (47). – S. 54-57. (In Russia)

Герасимова, В.В. Молекулярная эпидемиология вируса гепатита В в Якутии / В.В. Герасимова, Н.Р. Максимова, И.А. Левакова, С.Л. Мукомолов // Якутский медицинский журнал. – 2014. – № 3 (47). – С. 54-57.

De Maddalena, C. High level of genetic heterogeneity in S and P genes of genotype D hepatitis B virus / C. De Maddalena, C. Giambelli, E. Tanzi, D. Colzani, M. Schiavini, L. Milazzo, F. Bernini, E. Ebranati, A. Cargnel, R. Bruno, M. Galli, G. Zehender // Virology. – 2007. – vol. 365. – P. 113-124.

Bissinger, A.L. Epidemiology and Genotyping of Patients with Chronic Hepatitis B: Genotype Shifting Observed in Patients from Central Europe / A.L. Bissinger, C. Fehrle, C.R. Werner, U.M. Lauer, N.P. Malek, C.P. Berg // Pol. J. Microbiol. – 2015. – vol. 64(1). – P. 15-21.

Khan, A. Novel point mutations and mutational complexes in the enhancer II, core promoter and precore regions of hepatitis B virus genotype D1 associated with hepatocellular carcinoma in Saudi Arabia / Khan A., Al Balwi M.A., Tanaka Y., Hajeer A., Sanai F.M., Al Abdulkarim I., Al Ayyar L., Badri M., Saudi D., Tamimi W., Mizokami M., Al Knawy B. // Int. J. Cancer. – 2013. – vol. 133 (12). – P. 2864-2871.

Banerjee, P. A Rare HBV Subgenotype D4 with Unique Genomic Signatures Identified in North-Eastern India – An Emerging Clinical Challenge? / Banerjee P., Mondal R. K., Nandi M., Ghosh S., Khatun M., Chakraborty N., Bhattacharya S., RoyChoudhury A., Banerjee S., Santra A., Sil S., Chowdhury A., Bhaumik P., Datta S. // PLoS One. – 2014. – vol. 9 (10). e109425.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.