jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2015-7-3-44-50jofin-420Research ArticleОригинальные исследованияOriginal ResearchГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВАРИАНТЫ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У ПАЦИЕНТОВ С ХРОНИЧЕСКИМ ГЕПАТИТОМ ВGenetic variants of hepatitis B virus in patients with chronic hepatitis BЕлпаеваЕ. А.ElpaevaE. A.

научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии и генной инженерии Научно-исследовательского институт гриппа; тел.: +7-921-584-76-90, 8(812)499-15-20

elpaeva@influenza.spb.ruНикитинаО. Е.NikitinaO. E.

старший научный сотрудник отделения экспериментальных научных исследований Научно-исследовательского института гриппа, к.м.н.; тел.: 8(812)499-15-48

nikitina@influenza.spb.ruПисареваМ. М.PisarevaM. M.

ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии и генной инженерии Научно-исследовательского института гриппа, к.б.н.; тел.: 8(812)499-15-20

pisareva@influenza.spb.ruШиловаИ. В.ShilovaI. V.

научный сотрудник отдела вирусных гепатитов и заболеваний печени Научно-исследовательского института детских инфекций, к.м.н., тел.: 8(812)234-34-16,

babuin2004@list.ruГрешняковаВ. А.GreshnjakovaV. A.

младший научный сотрудник отдела вирусных гепатитов и заболеваний печени Научно-исследовательского института детских инфекций, тел.: 8(812)234-34-16

veramamayva@gmail.comГрудининМ. П.GrudininM. P.

заведующий лабораторией молекулярной вирусологии и генной инженерии, заместитель директора по науке и развитию Научно-исследовательского института гриппа, к.б.н.; тел.: 8(812)499-15-20

grudinin@influenza.spb.ruКиселевО. И.KiselevO. I.

директор Научно-исследовательского института гриппа, д.б.н., профессор, академик РАН; тел.: (812)4991500

office@influenza.spb.ruНаучно-исследовательский институт гриппа, Санкт-Петербург, РоссияРоссияScience Research Institute of Influenza, Saint-Petersburg, RussiaRussian FederationНаучно-исследовательский институт детских инфекций, Санкт-Петербург, РоссияРоссияScience Research Institute of Children’s Infections, Saint-Petersburg, RussiaRussian Federation201501112015734450Copyright © Елпаева Е.А., Никитина О.Е., Писарева М.М., Шилова И.В., Грешнякова В.А., Грудинин М.П., Киселев О.И., 20152015Елпаева Е.А., Никитина О.Е., Писарева М.М., Шилова И.В., Грешнякова В.А., Грудинин М.П., Киселев О.И.Elpaeva E.A., Nikitina O.E., Pisareva M.M., Shilova I.V., Greshnjakova V.A., Grudinin M.P., Kiselev O.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/420Введение

Введение. Биологические свойства вируса, такие как чувствительность к противовирусным препаратам, клиническое течение хронического гепатита В (ХГВ), вероятность развития цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы определяются генотипом и мутациями в геноме вируса гепатита В (ВГВ).

Цель

Цель. Изучение генетических вариантов ВГВ у пациентов с ХГВ, находящихся на лечении в клиниках Санкт- Петербурга.

Материалы и методы

Материалы и методы. Обследовано 1414 пациентов с ХГВ на наличие ВГВ в крови и/или ткани печени методом полимеразной цепной реакции. Генотип определен у 298 пациентов, секвенирование фрагмента гена полимеразы – у 80 пациентов.

Результаты

Результаты. Вирусная ДНК выявлена у 323 (55,8%) больных ХГВ. Генотип D обнаружен у 238 (80,1%), генотип А – у 49 (16,5%), генотип С– у 2 (0,7%) и микст D+А – у 8 (2,7%) пациентов. У 4 пациентов были выявлены замены в YMDD-мотиве полимеразы (M204I/V), а также найдены другие первичные и вторичные мутации устойчивости к аналогам нуклеотидов (ламивудину, телбивудину, энтекавиру). Показано, что мутации в области обратной транскиптазы (rt) полимеразного гена влияют и на поверхностный белок. У трех пациентов замена rtA181T привела к образованию стоп-кодона в S-гене и преждевременной терминации синтеза поверхностного белка (sW172*). Отсутствие HBeAg и увеличение степени фиброза у 7 пациентов может быть следствием выявленных мутаций в CORE гене (G1896A, A1762T, G1764A).

Заключение

Заключение. Исследование географического распределения генотипов вируса гепатита В и выявление аминокислотных замен, приводящих к снижению концентрации серологических маркеров и появлению мутаций устойчивости к противовирусным препаратам, имеет важное практическое значение для прогнозирования тяжести течения заболевания и эффективности противовирусной терапии.

Introduction

Introduction. Biological properties of virus, such as susceptibility to antivirals, the clinical course of chronic hepatitis B (CHB), the probability of developing cirrhosis and hepatocellular carcinoma are determined by genotype and mutations in the genome of the hepatitis B virus (HBV).

The aim of the study was evaluating of HBV genetic variants in patients with CHB from St. Petersburg hospitals.

Material and methods

Material and methods. A total of 1414 CHB patients with positive polymerase chain reaction HBV genome in blood and/or liver tissue were observed. Genotype was determined in 298 patients, sequencing of the polymerase gene fragment was performed in 80 patients.

Results

Results. Viral DNA was detected in 323 (55.8%) patients with CHB. Genotype D was determined in 238 (80,1%), genotype A – in 49 (16,5%), C genotype – in 2 (0,7%) and mixed A+D – in 8 (2,7%) patients. Substitutions in YMDD-motif of the polymerase protein (M204I/V) as well as other primary and secondary resistance mutations to nucleotide analogues (lamivudine, telbivudine, entecavir) were found in four patients. Mutations in the reverse transcriptase (rt) region of polymerase gene were shown to affect the structure of surface protein. The substitution rtA181T in three patients resulted in formation of stop codon (sW172*) and premature termination of surface protein synthesis. The absence of HBeAg and the degree of fibrosis increase in 7 patients may be the result of mutations identified in core gene (G1896A, A1762T, G1764A).

Conclusion

Conclusion. Study of the geographical distribution of HBV genotypes and identification of amino acid substitutions leading to decrease in serum markers concentration and emergence of resistance antivirals mutations is of great practical importance for predicting severity of the disease and effectiveness of antiviral therapy.

вирус гепатита Вгенотипымутациихронический гепатит Всеквенированиеhepatitis B virusgenotypesmutationschronic hepatitis BsequencingReferencesGerlich W.H. Medical virology of hepatitis B: how it began and where we are now. Virol J. 2013 Jul 20; 10:239.Gerlich W.H. Medical virology of hepatitis B: how it began and where we are now. Virol J. 2013 Jul 20; 10:239.Zhebrun A.B. Viral hepatitis in the Russian Federation. Analytical review, Issue 8: Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur Rospotrebnadzora. Saint-Petersburg; 2011 (in Russian).Zhebrun A.B. Viral hepatitis in the Russian Federation. Analytical review, Issue 8: Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur Rospotrebnadzora. Saint-Petersburg; 2011 (in Russian).Kao J.H. Molecular epidemiology of hepatitis B virus. Korean J Intern Med. 2011 Sep;26(3):255-61.Kao J.H. Molecular epidemiology of hepatitis B virus. Korean J Intern Med. 2011 Sep;26(3):255-61.Kuo A. Chronic hepatitis B infection. Clin Liver Dis. 2012 May;16(2):347-69.Kuo A. Chronic hepatitis B infection. Clin Liver Dis. 2012 May;16(2):347-69.Shi Y.H. Correlation between hepatitis B virus genotypes and clinical outcomes. Jpn J Infect Dis. 2012;65(6):476-82.Shi Y.H. Correlation between hepatitis B virus genotypes and clinical outcomes. Jpn J Infect Dis. 2012;65(6):476-82.Norder H, Couroucé AM, Coursaget P, Echevarria JM, Lee SD, Mushahwar IK, Robertson BH, Locarnini S, Magnius LO. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes. Intervirology. 2004;47(6):289-309.Norder H, Couroucé AM, Coursaget P, Echevarria JM, Lee SD, Mushahwar IK, Robertson BH, Locarnini S, Magnius LO. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes. Intervirology. 2004;47(6):289-309.Okamoto H, Tsuda F, Sakugawa H, Sastrosoewignjo RI, Imai M, Miyakawa Y, Mayumi M. Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes. J Gen Virol. 1988 Oct;69 ( Pt 10):2575-83.Okamoto H, Tsuda F, Sakugawa H, Sastrosoewignjo RI, Imai M, Miyakawa Y, Mayumi M. Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes. J Gen Virol. 1988 Oct;69 ( Pt 10):2575-83.Dandri M, Locarnini S. New insight in the pathobiology of hepatitis B virus infection Gut. 2012 May;61 Suppl 1:i6-17.Dandri M, Locarnini S. New insight in the pathobiology of hepatitis B virus infection Gut. 2012 May;61 Suppl 1:i6-17.Stuyver LJ, Locarnini SA, Lok A, Richman DD, Carman WF, Dienstag JL, Schinazi RF. Nomenclature for antiviralresistant human hepatitis B virus mutations in the polymerase region Hepatology. 2001 Mar;33(3):751-7.Stuyver LJ, Locarnini SA, Lok A, Richman DD, Carman WF, Dienstag JL, Schinazi RF. Nomenclature for antiviralresistant human hepatitis B virus mutations in the polymerase region Hepatology. 2001 Mar;33(3):751-7.Elpaeva E. A., Poretskova E.A., Kovelenov A.Yu., Alikyan I.S., Gal’braykh R.B., Grudinin M.P., Esaulenko E.V. Dal’nevostochnyy Zhurnal Infektsionnoy Patologii. 2009; 15: 56-59 (in Russian).Elpaeva E. A., Poretskova E.A., Kovelenov A.Yu., Alikyan I.S., Gal’braykh R.B., Grudinin M.P., Esaulenko E.V. Dal’nevostochnyy Zhurnal Infektsionnoy Patologii. 2009; 15: 56-59 (in Russian).Elpaeva E. A., Pisareva M.M., Nikitina O.E., Kizhlo S.N., Grudinin M.P., Dudanova O.P. Uchenye zapiski Petrozavodskogo gosudarstvennogo universiteta. Estestvennye i tekhnicheskie nauki. 2014; 6(143): 41-46 (in Russian).Elpaeva E. A., Pisareva M.M., Nikitina O.E., Kizhlo S.N., Grudinin M.P., Dudanova O.P. Uchenye zapiski Petrozavodskogo gosudarstvennogo universiteta. Estestvennye i tekhnicheskie nauki. 2014; 6(143): 41-46 (in Russian).Fang Z.L., Sabin C.A., Dong B.Q. et al. Hepatitis B virus pre-S deletion mutations are a risk factor for hepatocellular carcinoma: a matched nested case-control study. J Gen Virol. 2008 Nov;89(Pt 11):2882-90.Fang Z.L., Sabin C.A., Dong B.Q. et al. Hepatitis B virus pre-S deletion mutations are a risk factor for hepatocellular carcinoma: a matched nested case-control study. J Gen Virol. 2008 Nov;89(Pt 11):2882-90.Pollicino T, Amaddeo G, Restuccia A, Raffa G, Alibrandi A, Cutroneo G, Favaloro A, Maimone S, Squadrito G, Raimondo G. Impact of Hepatitis B Virus (HBV) PreS/S Genomic Variability on HBV Surface Antigen and HBV DNA Serum Levels. Hepatology. 2012 Aug; 56(2):434-43.Pollicino T, Amaddeo G, Restuccia A, Raffa G, Alibrandi A, Cutroneo G, Favaloro A, Maimone S, Squadrito G, Raimondo G. Impact of Hepatitis B Virus (HBV) PreS/S Genomic Variability on HBV Surface Antigen and HBV DNA Serum Levels. Hepatology. 2012 Aug; 56(2):434-43.Pisareva M.M. Molekulyarno-biologicheskie osobennosti virusa gepatita B dikoy i mutantnoy form v trekh regionakh Rossiyskoy Federatsii [Molecular-biological features of hepatitis B virus wild and mutant forms in three regions of the Russian Federation] [dissertation]. St. Petersburg (Russia): Science Research Institute of Influenza; 2007. 110 p (in Russian).Pisareva M.M. Molekulyarno-biologicheskie osobennosti virusa gepatita B dikoy i mutantnoy form v trekh regionakh Rossiyskoy Federatsii [Molecular-biological features of hepatitis B virus wild and mutant forms in three regions of the Russian Federation] [dissertation]. St. Petersburg (Russia): Science Research Institute of Influenza; 2007. 110 p (in Russian).Morozov V.M. Molekuljarno-geneticheskaja harakteristika variantov virusa gepatita V, cirkulirujushhih v Sankt-Peterburge i Jakutii [Molecular genetic characterization of variants of hepatitis B virus circulating in St. Petersburg and Yakutia] [dissertation]. St. Petersburg (Russia): Science Research Institute of Influenza; 2003. 127 p (in Russian).Morozov V.M. Molekuljarno-geneticheskaja harakteristika variantov virusa gepatita V, cirkulirujushhih v Sankt-Peterburge i Jakutii [Molecular genetic characterization of variants of hepatitis B virus circulating in St. Petersburg and Yakutia] [dissertation]. St. Petersburg (Russia): Science Research Institute of Influenza; 2003. 127 p (in Russian).Gromova N.I. Dokazatel’naja gastrojenterologija. 2013; 2: 26-30.Gromova N.I. Dokazatel’naja gastrojenterologija. 2013; 2: 26-30.Esaulenko E.V., Nikitina O.E., Poreckova E.A., Stukov B.V., Alikjan I.S., Kovelenov A.Ju. Klinicheskie perspektivy gastrojenterologii, gepatologii. 2011; 5: 21-25.Esaulenko E.V., Nikitina O.E., Poreckova E.A., Stukov B.V., Alikjan I.S., Kovelenov A.Ju. Klinicheskie perspektivy gastrojenterologii, gepatologii. 2011; 5: 21-25.Esaulenko E.V., Alikjan I.S.,. Emel’janova O.Ju, Stasishkis T.A., Kovelenov A.Ju. Zhurnal infektologii. 2009; 4: 72-75.Esaulenko E.V., Alikjan I.S.,. Emel’janova O.Ju, Stasishkis T.A., Kovelenov A.Ju. Zhurnal infektologii. 2009; 4: 72-75.Lin C.L., Kao J.H. Hepatitis B virus genotypes and variants. Cold Spring Harb Perspect Med. 2015 May; 5(5): 1-19.Lin C.L., Kao J.H. Hepatitis B virus genotypes and variants. Cold Spring Harb Perspect Med. 2015 May; 5(5): 1-19.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.