jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2014-6-3-84-91jofin-344Research ArticleЭпидемиологияEpidemiologyРОЛЬ ЭНТЕРОВИРУСА ECHO 30 В ЭТИОЛОГИИ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ НА СЕВЕРО -ЗАПАДЕ РОССИИ В 2013 гRole of Enterovirus ECHO 30 as the etiological agent of enterovirus infection in the North-West of Russia in 2013БичуринаМ. А.BichurinaM. A.

заведующая лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, д.м.н.; тел.: 8(812)233-21-56

poliospb@NR3854.spb.eduРоманенковаН. И.RomanenkovaN. I.

ведущий научный сотрудник Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, к.м.н.; тел.: 8(812)233-21-56

poliospb@NR3854.spb.eduГолицынаЛ. Н.GolitsynaL. N.

ведущий научный сотрудник Нижегородского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной, к.б.н.; тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruРозаеваН. Р.RozaevaN. R.

старший научный сотрудник Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, к.м.н.; тел.: 8(812)233-21-56

poliospb@NR3854.spb.eduКанаеваО. И.KanaevaO. I.

младший научный сотрудник Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; тел.: 8(812)233-21-56

ol.kanaeva@yandex.ruФоминаС. Г.FominaS. G.

научный сотрудник Нижегородского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной, к.б.н.; тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruКрайноваТ. И.KrainovaT. I.

главный специалист-эксперт отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по Санкт-Петербургу; тел.: 8(812)575-81-06

epidnadzor@78.rospotrebnadzor.ruШишкоЛ. А.ShishkoL. A.

заведующая вирусологической лабораторией Центра гигиены и эпидемиологии в Архангельской области; тел.: 8(8182)65-27-68

virlab@arhgsen.atnet.ruГордиенкоТ. А.GordienkoT. A.

начальник отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по Архангельской области; тел.: 8(8182)20-06-56

epid@29rpn.atnet.ruПьяныхВ. А.PianykhV. A.

заместитель руководителя Управления Роспотребнадзора по Новгородской области; тел.: (8162)77-10-22

info@53.rospotrebnadzor.ruИвановаТ. Г.IvanovaT. G.

врач-вирусолог Центра гигиены и эпидемиологии в Новгородской области, тел.: 8(8162)77-58-01

post@novgsen.natm.ruСмелковС. Н.SmelkovS. N.

начальник отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по Вологодской области; тел.: 8(8172)75-15-58

epidrpn35@mail.ruЛесниковаМ. В.LesnikovaM. V.

заведующая вирусологической лабораторией Центра гигиены и эпидемиологии в Вологодской области, тел.: 8(8172)75-50-31

gsen@vologda.ruНовиковаН. А.NovikovaN. A.

заведующая лабораторией молекулярной эпидемиологии вирусных инфекций Нижегородского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной, д.б.н.; тел.: 8(831)469-79-11

mevirfc@rambler.ruСанкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, РоссияРоссияSaint-Petersburg Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after Pasteur, Saint-Petersburg, RussiaRussian FederationНижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной, Нижний Новгород, РоссияРоссияNizhny Novgorod Science Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after academician I.N. Blokhina, Nizhny Novgorod, RussiaRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Санкт-Петербургу, Санкт-Петербург, РоссияРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Saint-Petersburg, Saint-Petersburg, RussiaRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Архангельской области, Архангельск, РоссияРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Arkhangelsk Region, Arkhangelsk, RussiaRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Архангельской области, Архангельск, РоссияРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Arkhangelsk Region, Arkhangelsk, RussiaRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Новгородской области, Великий Новгород, РоссияРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Novgorod Region, Veliky Novgorod, RussiaRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Новгородской области, Великий Новгород, РоссияРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Novgorod Region, Veliky Novgorod, RussiaRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Вологодской области, Вологда, РоссияРоссияDepartment of the Federal Service of Surveillance for Protection of Consumers’ Rights and Human Welfare for Vologda Region, Vologda, RussiaRussian FederationЦентр гигиены и эпидемиологии в Вологодской области, Вологда, РоссияРоссияCentre of Hygiene and Epidemiology in Vologda Region, Vologda, RussiaRussian Federation201421102014638491Copyright © Бичурина М.А., Романенкова Н.И., Голицына Л.Н., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Фомина С.Г., Крайнова Т.И., Шишко Л.А., Гордиенко Т.А., Пьяных В.А., Иванова Т.Г., Смелков С.Н., Лесникова М.В., Новикова Н.А., 20142014Бичурина М.А., Романенкова Н.И., Голицына Л.Н., Розаева Н.Р., Канаева О.И., Фомина С.Г., Крайнова Т.И., Шишко Л.А., Гордиенко Т.А., Пьяных В.А., Иванова Т.Г., Смелков С.Н., Лесникова М.В., Новикова Н.А.Bichurina M.A., Romanenkova N.I., Golitsyna L.N., Rozaeva N.R., Kanaeva O.I., Fomina S.G., Krainova T.I., Shishko L.A., Gordienko T.A., Pianykh V.A., Ivanova T.G., Smelkov S.N., Lesnikova M.V., Novikova N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/344

В 2013 г. после относительно спокойной ситуации в течение двух предыдущих лет заболеваемость энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Северо-Западного федерального округа резко возросла. Были зарегистрированы групповые заболевания энтеровирусным менингитом в Новгородской, Вологодской областях и в Санкт-Петербурге. Проведена расшифровка этиологии заболеваний энтеровирусной инфекцией с использованием вирусологического и молекулярно- генетического методов исследования. В качестве основного этиологического агента был идентифицирован энтеровирус ЕСНО 30. Установлено, что изолированные на Северо-Западе России вирусы ЕСНО 30 относились к генотипу Н и сформировали две филогенетические группы. Филогенетический анализ показал, что энтеровирусы ЕСНО 30 обоих субтипов были наиболее близко родственны штаммам, выделенным в разных провинциях Китая в 2010–2013 гг. Вероятно, энтеровирусы ЕСНО 30 генотипа Н, которые широко циркулировали в России в 2013 г. и ранее практически не выявлялись в стране, были импортированы на территорию России из Юго-Восточной Азии. Энтеровирусы ЕСНО 30, изолированные в 2008–2009 гг. в Архангельской и Новгородской областях, относились к другому генотипу Ес2, энтеровирусы этого генотипа циркулировали в тот период в странах Европы.

In 2013 after two previous years when the situation had been calm the incidence rates of enterovirus infection significantly increased on certain territories of the North-West of Russia. In Novgorod and Vologda regions and in Saint-Petersburg enterovirus meningitis group cases were registered. The etiology of enterovirus infection was studied by virological and molecular methods. Enterovirus ECHO30 was identified as the principal etiological agent of the cases. Molecular study revealed that enteroviruses ECHO30 isolated in the North-West of Russia belonged to the genotype H and formed two subtypes inside this genotype. Phylogenetic analysis has shown that enteroviruses ECHO30 of both subtypes were closely related to the strains detected in different provinces of China in 2010-2013. Probably enteroviruses ECHO30 of the genotype H which largely circulated in Russia in 2013 and practically had not been detected in the country earlier had been imported on the territory of Russia from South-East Asia. Enteroviruses ECHO30 isolated in  Arkhangelsk and Novgorod regions in 2008-2009 belonged to another genotype Ec2. Enteroviruses of this genotype had circulated at that time in the European countries.

энтеровирусная инфекциявыделение и идентификация энтеровирусовмолекулярное типированиеenterovirus infectionisolation and identification of enterovirusesmolecular typingReferencesAmvrosieva T.V. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 3: 17-21 (in Russian).Amvrosieva T.V. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 3: 17-21 (in Russian).Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A. et al. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2012; 4: 747-752 (in Russian).Bichurina M.A., Pianykh V.A., Novikova N.A. et al. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2012; 4: 747-752 (in Russian).Golitsyna L.N., Novikova N.A., Fomina S.G. et al. Innovatsionnye tekhnologii v protivoepidemicheskoi zashite naseleniya [Innovation technologies in the antiepidemic protection of the population]. N. Novgorod; 2014. p. 88-92 (in Russian).Golitsyna L.N., Novikova N.A., Fomina S.G. et al. Innovatsionnye tekhnologii v protivoepidemicheskoi zashite naseleniya [Innovation technologies in the antiepidemic protection of the population]. N. Novgorod; 2014. p. 88-92 (in Russian).Lukashev A.N., Ivanova O.E., Eremeeva T.P et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2004; 5: 12-16 (in Russian).Lukashev A.N., Ivanova O.E., Eremeeva T.P et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2004; 5: 12-16 (in Russian).Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2008; 1: 16-21 (in Russian).Lukashev A.N., Reznik V.I., Ivanova O.E. et al. Voprosy virusologii – Problems of Virology. 2008; 1: 16-21 (in Russian).Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. . Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2013; 1: 75-78 (in Russian).Novikova N.A., Golitsyna L.N., Fomina S.G., Efimov E.I. . Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2013; 1: 75-78 (in Russian).Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2009; 2: 24-30 (in Russian).Onishchenko G.G., Novikova N.A., Efimov E.I. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2009; 2: 24-30 (in Russian).Reznik V.I., Kozhevnikova N.V., Karavyanskaya T.N. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii –Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2007; 5: 32-37 (in Russian).Reznik V.I., Kozhevnikova N.V., Karavyanskaya T.N. et al. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii –Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2007; 5: 32-37 (in Russian).Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2011; 6: 32- 36 (in Russian).Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Rozaeva N.R. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2011; 6: 32- 36 (in Russian).Seibil V.B., Frolochkina T.I. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 1: 87-92 (in Russian).Seibil V.B., Frolochkina T.I. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii – Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2006; 1: 87-92 (in Russian).Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2013; 1: 65-72 (in Russian).Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A. Infektsiya i immunitet – Infection and Immunity. 2013; 1: 65-72 (in Russian).Lobzin Yu.V., Skripchenko N.V., Murina E.A. Enterovirus infections: Guidelines for Physicians. Saint-Petersburg; 2012 (in Russian).Lobzin Yu.V., Skripchenko N.V., Murina E.A. Enterovirus infections: Guidelines for Physicians. Saint-Petersburg; 2012 (in Russian).Bailly J.L. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene / J.L. Bailly et [al.] // Infect. Genet. Evol.- 2009. – Vol. 9. – P. 699-708.Bailly J.L. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene / J.L. Bailly et [al.] // Infect. Genet. Evol.- 2009. – Vol. 9. – P. 699-708.CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity – United States, 2003 // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2003. – Vol. 52. – P. 761-764.CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity – United States, 2003 // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2003. – Vol. 52. – P. 761-764.Domingo E. Basic concepts in RNA virus evolution / E. Domingo et [al.] // Faseb. J. – 1996. – N 10. – P. 859-864.Domingo E. Basic concepts in RNA virus evolution / E. Domingo et [al.] // Faseb. J. – 1996. – N 10. – P. 859-864.Khetsuriani N. Enterovirus surveillance – United States, 1970-2005 / N. Khetsuriani et [al.] // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2006. – Vol. 55. – N 8. – P. 1-20.Khetsuriani N. Enterovirus surveillance – United States, 1970-2005 / N. Khetsuriani et [al.] // Morbid. Mortal. Wkly Rep. – 2006. – Vol. 55. – N 8. – P. 1-20.Lukashev A.N. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages / A.N. Lukashev et [al.] // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 665-670.Lukashev A.N. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages / A.N. Lukashev et [al.] // J. Clin. Microbiol. – 2008. – Vol. 46. – P. 665-670.Milia M.G. Recent outbreak of aseptic meningitis in Italy due to Echovirus 30 and phylogenetic relationship with other European circulating strains / M.G. Milia et [al.] // J. Clin. Virol. 2013. – Vol. 58. – P. 579-583.Milia M.G. Recent outbreak of aseptic meningitis in Italy due to Echovirus 30 and phylogenetic relationship with other European circulating strains / M.G. Milia et [al.] // J. Clin. Virol. 2013. – Vol. 58. – P. 579-583.Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens / W.A. Nix, M.S. Oberste, M.A. Pallansch // Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – P. 2698-2704.Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens / W.A. Nix, M.S. Oberste, M.A. Pallansch // Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44. – P. 2698-2704.Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10.World Health Organization, Geneva, Switzerland. — 2004. — 157 p.Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10.World Health Organization, Geneva, Switzerland. — 2004. — 157 p.Savolainen-Kopra C., Paananen A., Blomqvist S. A large Finnish echovirus 30 outbreak was preceded by silent circulation of the same genotype / C. Savolainen-Kopra, A. Paananen, S. Blomqvist // Virus Genes. – 2011. – Vol. 42. – P. 28-36.Savolainen-Kopra C., Paananen A., Blomqvist S. A large Finnish echovirus 30 outbreak was preceded by silent circulation of the same genotype / C. Savolainen-Kopra, A. Paananen, S. Blomqvist // Virus Genes. – 2011. – Vol. 42. – P. 28-36.Tamura K. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods / K. Tamura et [al.] // Mol. Biol. and Evol. – 2011. – Vol. 28. – N 10. – P. 2731-2739.Tamura K. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods / K. Tamura et [al.] // Mol. Biol. and Evol. – 2011. – Vol. 28. – N 10. – P. 2731-2739.Tao Z. Molecular epidemiology of human enterovirus associated with aseptic meningitis in Shandong province, Сhina, 2006-2012 / Z. Tao et [al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. – N 2. -e89766.Tao Z. Molecular epidemiology of human enterovirus associated with aseptic meningitis in Shandong province, Сhina, 2006-2012 / Z. Tao et [al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. – N 2. -e89766.Yang X.H., Yan Y.S., Weng Y.W. Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011 /X.H. Yang, Y.S. Yan, Y.W. Weng // J. Med. Virol. – 2013. – Vol. 85. – P. 696-702.Yang X.H., Yan Y.S., Weng Y.W. Molecular epidemiology of Echovirus 30 in Fujian, China between 2001 and 2011 /X.H. Yang, Y.S. Yan, Y.W. Weng // J. Med. Virol. – 2013. – Vol. 85. – P. 696-702.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.