jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2009-1-4-66-71jofin-276Research ArticleОригинальные исследованияOriginal ResearchГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ПЕНИЦИЛЛИНУСТОЙЧИВЫХ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAEGenetic diversity of penicillin-resistant Streptococcus pneumoniaeСавиноваТ. А.SavinovaT. A.ФилимоноваО. Ю.FilimonovaO. Y.ГрудининаС. А.GrudininaS. A.СидоренкоС. В.SidorenkoS. V.

89633160808

sidorserg@yandex.ruФедеральное государственное учреждение «Научный центр экспертизы средств медицинского применения», МоскваРоссияResearch Center of Medical Agents Evaluation, MoscowRussian FederationКафедра микробиологии Российской медицинской академии последипломного образования, МоскваРоссияRussian Medical Academy of Post-Graduate Education, MoscowRussian FederationГосударственный научный центр по антибиотикам, МоскваРоссияFederal Antibiotic Research Center, MoscowRussian FederationНаучно-исследовательский институт детских инфекций, Санкт-ПетербургРоссияResearch Institute of Children’s Infections, Saint-PetersburgRussian Federation200923092014146671Copyright © Савинова Т.А., Филимонова О.Ю., Грудинина С.А., Сидоренко С.В., 20142014Савинова Т.А., Филимонова О.Ю., Грудинина С.А., Сидоренко С.В.Savinova T.A., Filimonova O.Y., Grudinina S.A., Sidorenko S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/276

Методом мультилокусного сиквенстипирования (MLST) были изучены 55 штаммов Streptococcus pneumoniae со сниженной чувствительностью к пенициллину, полученных от пациентов с инфекциями дыхательных путей в 2003–2007 гг., в различных регионах России. Десять штаммов были идентифицированы методом MLST как Streptococcus «viridians» group. Среди оставшихся 45 штаммов 33,3% (n=15) относились к глобально распространенному клональному комплексу 81 (CC81) и проявляли ассоциированную устойчивость к макролидам, тетрациклину, а также хлорамфениколу, три штамма были дополнительно устойчивы к левофлоксацину. К клональному комплексу 271 относились 5 (11,1%) штаммов, к 315 – 4 (8,9%), к 414 – 3 (6,7%), к клональным комплексам 156, 280, 1012 – по 2 (4,4%). штаммы клональных комплексов 271 и 315 характеризовались высокой частотой ассоциированной устойчивости к макролидам. Двенадцать клональных комплексов были представлены единственными изолятами. Таким образом, более 50% пневмококков, проявляющих сниженную чувствительность к пенициллину, относились к трем глобально распространенным клональным комплексам. Наиболее вероятным представляется импорт этих клонов из других регионов мира и их распространениена территории России.

Fifty five Streptococcus pneumoniae isolates with reduced susceptibility to penicillin, obtained from patients with respiratory tract infections during 2003 –2007, were analyzed by MLST. Ten isolates were identified by MLST as Streptococcus «viridians» group. Among the remaining isolates 33,3% (n=15) belonged to global clonal complex CC81 and demonstrated reduced susceptibility to macrolides, tetracyclynes and chloramphenicol, three isolates were additionally resistant to levofloxacin. Clonal complex CC271 was represented by 5 isolated (11,1%), CC315 – by 4 (8,9%), CC315 – by 3 (6,7%), CC156, CC280 and CC1012 were represented by 2 (4,4%) isolates each. Isolates of clonal complexes 271 and 315 demonstrated high level of associated resistance to macrolides. Twelve clonal complexes were represented by single isolates. More than 50% of isolates with reduced susceptibility to penicillin belonged to three global clonal complexes. Probably these clonal complexes were imported to Russia from other geographical regions.

Streptococcus pneumoniaeмульти- локусное сиквенс-типированиеStreptococcus pneumoniaemultilocus sequence typingReferencesAustrian R. Pneumococcus and the Brooklyn connection / R. Austrian // Am. J. Med. - 1999. – V.107, № 1A. – P. 2S– 6S.Austrian R. Pneumococcus and the Brooklyn connection / R. Austrian // Am. J. Med. - 1999. – V.107, № 1A. – P. 2S– 6S.Metlay J.P. Impact of penicillin susceptibility on medical outcomes for adult patients with bacteremic pneumococcal pneumonia / J.P Metlay., J. Hofmann, M.S. Cetron, M.J. Fine, M.M. Farley, C. Whitney, R.F. Breiman// Clin. Infect. Dis. – 2000. – Vol.30, № 3. – P.520–528.Metlay J.P. Impact of penicillin susceptibility on medical outcomes for adult patients with bacteremic pneumococcal pneumonia / J.P Metlay., J. Hofmann, M.S. Cetron, M.J. Fine, M.M. Farley, C. Whitney, R.F. Breiman// Clin. Infect. Dis. – 2000. – Vol.30, № 3. – P.520–528.Hansman D. A resistant pneumococcus / D. Hansman, M.M. Bullen // Lancet. – 1967. – Vol. 290, № 7509. – P. 264– 265.Hansman D. A resistant pneumococcus / D. Hansman, M.M. Bullen // Lancet. – 1967. – Vol. 290, № 7509. – P. 264– 265.Low D.E. Changing trends in antimicrobial-resistant pneumococci: it's not all bad news / D.E. Low // Clin. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 41, Suppl 4. – P. S228–233.Low D.E. Changing trends in antimicrobial-resistant pneumococci: it's not all bad news / D.E. Low // Clin. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 41, Suppl 4. – P. S228–233.Richter S.S. Changing epidemiology of antimicrobialresistant Streptococcus pneumoniae in the United States 2004–2005 / S.S. Richter, K.P. Heilmann, C.L. Dohrn, F. Riahi, S.E. Beekmann, G.V. Doern // Clin. Infect. Dis. – 2009. – Vol. 48. № 3. – P. e23–e33.Richter S.S. Changing epidemiology of antimicrobialresistant Streptococcus pneumoniae in the United States 2004–2005 / S.S. Richter, K.P. Heilmann, C.L. Dohrn, F. Riahi, S.E. Beekmann, G.V. Doern // Clin. Infect. Dis. – 2009. – Vol. 48. № 3. – P. e23–e33.Sabuncu E. Significant Reduction of Antibiotic Use in the Community after a Nationwide Campaign in France, 2002– 2007 / E. Sabuncu, J. David, C. Bernede-Bauduin, S. Pepin, M. Leroy, P-Y. Boelle, L. Watier, D. Guillemot // PLoS. Med. – 2009. – Vol. 6. – № 6. – P. 184Sabuncu E. Significant Reduction of Antibiotic Use in the Community after a Nationwide Campaign in France, 2002– 2007 / E. Sabuncu, J. David, C. Bernede-Bauduin, S. Pepin, M. Leroy, P-Y. Boelle, L. Watier, D. Guillemot // PLoS. Med. – 2009. – Vol. 6. – № 6. – P. 184Грудинина С.А. Динамика распространения антибиотикорезистентности среди Streptococcus pneumoniae в Москве в период с 1998 по 2003 гг. / С.А. Грудинина, С.В. Сидоренко, В.В. Федорчук, Л.К. Катосова, Н.А. Фатова, Л.В. Еремина, Н.М. Фурлетова, Н.С. Ютаонова // Антибиотики и химиотерапия. – 2004. – Т. 49. – № 4. – С. 25–34.Грудинина С.А. Динамика распространения антибиотикорезистентности среди Streptococcus pneumoniae в Москве в период с 1998 по 2003 гг. / С.А. Грудинина, С.В. Сидоренко, В.В. Федорчук, Л.К. Катосова, Н.А. Фатова, Л.В. Еремина, Н.М. Фурлетова, Н.С. Ютаонова // Антибиотики и химиотерапия. – 2004. – Т. 49. – № 4. – С. 25–34.Enright M.C. A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae: identification of clones associated with serious invasive disease / M.C. Enright, B.G. Spratt // Microbiology. – 1998. – Vol. 144. – № 11. – P. 3049–3060.Enright M.C. A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae: identification of clones associated with serious invasive disease / M.C. Enright, B.G. Spratt // Microbiology. – 1998. – Vol. 144. – № 11. – P. 3049–3060.Hanage W.P. Using multilocus sequence data to define the pneumococcus / W.P. Hanage, T. Kaijalainen, E. Herva, A. Saukkoriipi, R. Syrjanen, B.G. Spratt // J. Bacteriol. – 2005. – Vol. 187. – № 17. – P. 6223–6230.Hanage W.P. Using multilocus sequence data to define the pneumococcus / W.P. Hanage, T. Kaijalainen, E. Herva, A. Saukkoriipi, R. Syrjanen, B.G. Spratt // J. Bacteriol. – 2005. – Vol. 187. – № 17. – P. 6223–6230.Munoz R. Intercontinental spread of a multiresistant clone of serotype 23F Streptococcus pneumoniae / R. Munoz, T.J. Coffey, M. Daniels, C.G. Dowson, G. Laible, J. Casal, R. Hakenbeck, M. Jacobs, J.M. Musser, B.G. Spratt et al //J. Infect. Dis. – 1991. – Vol. 164. – № 2. – P.302–306.Munoz R. Intercontinental spread of a multiresistant clone of serotype 23F Streptococcus pneumoniae / R. Munoz, T.J. Coffey, M. Daniels, C.G. Dowson, G. Laible, J. Casal, R. Hakenbeck, M. Jacobs, J.M. Musser, B.G. Spratt et al //J. Infect. Dis. – 1991. – Vol. 164. – № 2. – P.302–306.Corso A. Molecular characterization of penicillinresistant Streptococcus pneumoniae isolates causing respiratory disease in the United States / A. Corso, E.P. Severina, V.F. Petruk, Y.R. Mauriz, A. Tomasz // Microb. Drug. Resist. – 1998. – Vol. 4. – № 4. – P. 325–337.Corso A. Molecular characterization of penicillinresistant Streptococcus pneumoniae isolates causing respiratory disease in the United States / A. Corso, E.P. Severina, V.F. Petruk, Y.R. Mauriz, A. Tomasz // Microb. Drug. Resist. – 1998. – Vol. 4. – № 4. – P. 325–337.Pletz M.W. Levofloxacin-resistant invasive Strepto coccus pneumoniae in the United States: evidence for clonal spread and the impact of conjugate pneumococcal vaccine / M.W. Pletz, L. McGee, J. Jorgensen, B. Beall, R.R. Facklam, C.G. Whitney, K.P. Klugman // Antimicrob. Agents Chemother. – 2004. – Vol. 48. – № 9. – P. 3491–3497.Pletz M.W. Levofloxacin-resistant invasive Strepto coccus pneumoniae in the United States: evidence for clonal spread and the impact of conjugate pneumococcal vaccine / M.W. Pletz, L. McGee, J. Jorgensen, B. Beall, R.R. Facklam, C.G. Whitney, K.P. Klugman // Antimicrob. Agents Chemother. – 2004. – Vol. 48. – № 9. – P. 3491–3497.Reinert R.R. Molecular epidemiology of macrolideresistant Streptococcus pneumoniae isolates in Europe /R.R. Reinert, A. Ringelstein, M. van der Linden, M.Y. Cil, A. Al- Lahham, F.J. Schmitz // J. Clin. Microbiol. – 2005 – Vol. 43. – № 3. – P.1294–1300.Reinert R.R. Molecular epidemiology of macrolideresistant Streptococcus pneumoniae isolates in Europe /R.R. Reinert, A. Ringelstein, M. van der Linden, M.Y. Cil, A. Al- Lahham, F.J. Schmitz // J. Clin. Microbiol. – 2005 – Vol. 43. – № 3. – P.1294–1300.Klugman K.P. Efficacy of pneumococcal conjugate vaccines and their effect on carriage and antimicrobial resistance / K.P. Klugman // Lancet Infect. Dis. – 2001. – Vol. 1. – № 2. – P.85–91.Klugman K.P. Efficacy of pneumococcal conjugate vaccines and their effect on carriage and antimicrobial resistance / K.P. Klugman // Lancet Infect. Dis. – 2001. – Vol. 1. – № 2. – P.85–91.Coffey T.J. Serotype 19A variants of the Spanish serotype 23F multiresistant clone of Streptococcus pneumoniae /T.J. Coffey, M.C. Enright, M. Daniels, P. Wilkinson, S. Berron, A. Fenoll, B.G. Spratt // Microb. Drug Resist. – 1998. –Vol. 4. – № 1. – P. 51–55.Coffey T.J. Serotype 19A variants of the Spanish serotype 23F multiresistant clone of Streptococcus pneumoniae /T.J. Coffey, M.C. Enright, M. Daniels, P. Wilkinson, S. Berron, A. Fenoll, B.G. Spratt // Microb. Drug Resist. – 1998. –Vol. 4. – № 1. – P. 51–55.Coffey T.J. Recombinational exchanges at the capsular polysaccharide biosynthetic locus lead to frequent serotype changes among natural isolates of Streptococcus pneumoniae / T.J. Coffey, M.C. Enright, M. Daniels, J.K. Morona, R. Morona, W. Hryniewicz, J.C. Paton, B.G. Spratt // Mol. Microbiol. – 1998. – Vol. 27. – № 1. – P.73–83.Coffey T.J. Recombinational exchanges at the capsular polysaccharide biosynthetic locus lead to frequent serotype changes among natural isolates of Streptococcus pneumoniae / T.J. Coffey, M.C. Enright, M. Daniels, J.K. Morona, R. Morona, W. Hryniewicz, J.C. Paton, B.G. Spratt // Mol. Microbiol. – 1998. – Vol. 27. – № 1. – P.73–83.Brueggemann A.B. Clonal relationships between invasive and carriage Streptococcus pneumoniae and serotypeand clone-specific differences in invasive disease potential / A.B. Brueggemann, D.T. Griffiths, E. Meats, T. Peto, D.W. Crook, B.G. Spratt // J. Infect. Dis. – 2003. – Vol. 187. – № 9. – P. 1424–1432.Brueggemann A.B. Clonal relationships between invasive and carriage Streptococcus pneumoniae and serotypeand clone-specific differences in invasive disease potential / A.B. Brueggemann, D.T. Griffiths, E. Meats, T. Peto, D.W. Crook, B.G. Spratt // J. Infect. Dis. – 2003. – Vol. 187. – № 9. – P. 1424–1432.Sjostrom K. Clonal and capsular types decide whether pneumococci will act as a primary or opportunistic pathogen /Sjostrom K, Spindler C, Ortqvist A, Kalin M, Sandgren A., Kuhlmann-Berenzon S, Henriques-Normark B // Clin. Infect. Dis. – 2006. – Vol. 42. – №4. – P. 451–459.Sjostrom K. Clonal and capsular types decide whether pneumococci will act as a primary or opportunistic pathogen /Sjostrom K, Spindler C, Ortqvist A, Kalin M, Sandgren A., Kuhlmann-Berenzon S, Henriques-Normark B // Clin. Infect. Dis. – 2006. – Vol. 42. – №4. – P. 451–459.Farrell D,J. Emergence and spread of Streptococcus pneumoniae with erm(B) and mef(A) resistance / D.J. Farrell, S.G. Jenkins, S.D. Brown, M. Patel, B.S. Lavin, K.P. Klugman // Emerg. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 11. – № 6. – P. 851–858.Farrell D,J. Emergence and spread of Streptococcus pneumoniae with erm(B) and mef(A) resistance / D.J. Farrell, S.G. Jenkins, S.D. Brown, M. Patel, B.S. Lavin, K.P. Klugman // Emerg. Infect. Dis. – 2005. – Vol. 11. – № 6. – P. 851–858.Zhou J. Identification of the major Spanish clones of penicillin-resistant pneumococci via the Internet using multilocus sequence typing / J. Zhou, M.C. Enright, B.G. Spratt: // J. Clin. Microbiol. – 2000. – Vol. 38. – № 3. – P. 977–986.Zhou J. Identification of the major Spanish clones of penicillin-resistant pneumococci via the Internet using multilocus sequence typing / J. Zhou, M.C. Enright, B.G. Spratt: // J. Clin. Microbiol. – 2000. – Vol. 38. – № 3. – P. 977–986.Pichichero M.E., Casey J.R. Emergence of a multiresistant serotype 19A pneumococcal strain not included in the 7-valent conjugate vaccine as an otopathogen in children. / M.E. Pichichero, J.R. Casey // JAMA. – 2007. – Vol. 298. – № 15. – P. 1772–1778.Pichichero M.E., Casey J.R. Emergence of a multiresistant serotype 19A pneumococcal strain not included in the 7-valent conjugate vaccine as an otopathogen in children. / M.E. Pichichero, J.R. Casey // JAMA. – 2007. – Vol. 298. – № 15. – P. 1772–1778.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.