jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2025-17-4-6-18jofin-1884Research ArticleПередовая статьяLead articleМножественная лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у взрослых пациентов на территории Российской Федерации в 2024–2025 гг.Multidrug-Resistance of HIV-1 in Adult Patients in Russia in 2024–2025ЦветковВ. В.TsvetkovV. V.

Цветков Валерий Владимирович – старший научный сотрудник отделения экспериментально-клинических исследований, к.м.н. 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

suppcolor@gmail.comКомиссаровА. Б.KomissarovA. B.

Комиссаров Андрей Борисович – заведующий лабораторией молекулярной вирусологии 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

a.b.komissarov@gmail.comМашарскийА. Э.MasharskiyA. E.

Машарский Алексей Эльвинович – ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии, к.б.н. 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

masharsky@gmail.comЁлшинН. Д.YolshinN. D.

Ёлшин Никита Дмитриевич – научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

nikita.yolshin@gmail.comКомиссароваК. С.KomissarovaK. S.

Комиссарова Ксения Сергеевна – научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

kseniya.sintsova1994@gmail.comИвановаА. А.IvanovaA. A.

Иванова Анна Андреевна – младший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

anna.egorova@influenza.spb.ruФадеевА. В.FadeevA. V.

Фадеев Артем Викторович – старший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

afadeew@gmail.comПлутницкийА. Н.PlutnitskiyA. N.

Плутницкий Андрей Николаевич – заместитель министра здравоохранения Российской Федерации, д.м.н., доцент 

Москва

Moscow

info@minzdrav.gov.ruКуликоваИ. Б.KulikovaI. B.

Куликова Инна Борисовна – директор Департамента организации экстренной медицинской помощи и управления рисками здоровью Министерства здравоохранения Российской Федерации 

Москва

Moscow

info@minzdrav.gov.ruПакскинаН. Д.PakskinaN. D.

Пакскина Наталья Давыдовна – заместитель директора Департамента организации экстренной медицинской помощи и управления рисками здоровью Министерства здравоохранения Российской Федерации 

Москва

Moscow

info@minzdrav.gov.ruМазусА. И.MazusA. I.

Мазус Алексей Израилевич – руководитель, д.м.н. 

Москва

Moscow

aids@spid.ruЛиозновД. А.LioznovD. A.

Лиознов Дмитрий Анатольевич – директор; заведующий кафедрой инфекционных болезней и эпидемиологии, д.м.н., профессор 

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

dlioznov@yandex.ruНаучно-исследовательский институт гриппа им. А.А. СмородинцеваРоссияResearch Institute of Influenza named after A.A. SmorodintsevRussian FederationМинистерство здравоохранения Российской ФедерацииРоссияMinistry of Health of the Russian FederationRussian FederationМосковский городской центр профилактики и борьбы со СПИДРоссияMoscow City Center for AIDS Prevention and ControlRussian FederationНаучно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева; Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. ПавловаРоссияResearch Institute of Influenza named after A.A. Smorodintsev; First Saint-Petersburg State Medical University named after academician I.P. Pavlov UniversityRussian Federation202518122025174618Copyright © Цветков В.В., Комиссаров А.Б., Машарский А.Э., Ёлшин Н.Д., Комиссарова К.С., Иванова А.А., Фадеев А.В., Плутницкий А.Н., Куликова И.Б., Пакскина Н.Д., Мазус А.И., Лиознов Д.А., 20252025Цветков В.В., Комиссаров А.Б., Машарский А.Э., Ёлшин Н.Д., Комиссарова К.С., Иванова А.А., Фадеев А.В., Плутницкий А.Н., Куликова И.Б., Пакскина Н.Д., Мазус А.И., Лиознов Д.А.Tsvetkov V.V., Komissarov A.B., Masharskiy A.E., Yolshin N.D., Komissarova K.S., Ivanova A.A., Fadeev A.V., Plutnitskiy A.N., Kulikova I.B., Pakskina N.D., Mazus A.I., Lioznov D.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1884

Цель: оценить распространенность лекарственной устойчивости и мультирезистентности ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам у взрослых пациентов как с опытом, так и без опыта лечения на территории России в 2024–2025 гг. Материалы и методы: всего исследовано 1888 образцов плазмы крови от взрослых больных ВИЧ-инфекцией из 21 региона России. Средний возраст больных составил 42,08 лет, мужчин – 60,86%, женщин – 39,14%. Сведения об опыте терапии имелись у 77,65% больных, из них никогда не получали лечение – 28,04%, имели опыт лечения – 71,96%. Консенсусные нуклеотидные последовательности гена pol, кодирующие протеазу, обратную транскриптазу и интегразу ВИЧ-1, были получены методом секвенирования нового поколения. Анализ лекарственной устойчивости ВИЧ-1 проводился с помощью базы данных Стенфордского университета HIVdb. Результаты: установлено, что наиболее распространенными надзорными мутациями ВИЧ-1 были замены в обратной транскриптазе – M184V и K103N. У больных с опытом лечения высокие уровни резистентности ВИЧ-1 наблюдались к препаратам ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы (эфавиренз) и нуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы (ламивудин, абакавир), а у наивных пациентов – к препаратам ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы (эфавиренз, невирапин, рилпивирин). Низкие уровни резистентности ВИЧ-1 отмечались к ингибиторам протеазы и интегразы, в том числе к препарату долутегравир. Наиболее распространенными комбинациями надзорных мутаций у больных с опытом лечения были сочетания G190S + K101E, G190S + M184V, K65R + M184V, K103N + M184V и G190S + K65R + Y181C. Наиболее распространенной комбинацией мультирезистентности ВИЧ-1 было сочетание лекарственной устойчивости к нуклеозидному ингибитору обратной транскриптазы + ненуклеозидному ингибитору обратной транскриптазы. Заключение: раннее выявление мутаций лекарственной устойчивости методом секвенирования нового поколения (NGS) с последующим анализом квазивидов может существенным образом изменить подход к выбору схем этиотропной терапии как первой, так и последующих линий, а также повысить клиническую и экономическую эффективность лечения больных ВИЧ-инфекцией.

The purpose. To assess the prevalence of HIV-1 drug resistance and multidrug resistance to antiretroviral drugs in adult patients with and without treatment experience in Russia in 2024–2025. Materials and Methods. A total of 1888 plasma samples from adult HIV-infected patients from 21 regions of Russia were analyzed. The average age of the patients was 42,08 years; 60,86% were men and 39,14% were women. 77,65% of patients had information about treatment experience; 28,04% of these patients were treatment-naive and 71,96% were treatment-experienced. Consensus nucleotide sequences of the pol gene, encoding HIV-1 protease, reverse transcriptase, and integrase, were obtained using next-generation sequencing. HIV-1 drug resistance analysis was conducted using the Stanford University HIVdb database. Results. The most common HIV-1 surveillance mutations were substitutions in the reverse transcriptase – M184V and K103N. In treatment-experienced patients, high levels of HIV-1 resistance were observed to NNRTIs (efavirenz) and NRTIs (lamivudine, abacavir), and in treatment-naive patients – to NNRTIs (efavirenz, nevirapine, rilpivirine). Low levels of HIV-1 resistance were observed to protease and integrase inhibitors, including dolutegravir. The most common combinations of surveillance mutations in treatment-experienced patients were G190S + K101E, G190S + M184V, K65R + M184V, K103N + M184V and G190S + K65R + Y181C. The most common combination of HIV-1 multidrug resistance was NRTI + NNRTI resistance. Conclusion. Early detection of drug resistance mutations using next-generation sequencing (NGS) followed by quasispecies analysis can significantly change the approach to choosing first- and subsequent-line etiotropic treatment regimens and improve the clinical and cost-effectiveness of HIV-1 treatment.

вирус иммунодефицита человекаантиретровирусная терапиялекарственная устойчивостьмутация резистентностимультирезистентностьhuman immunodeficiency virusantiretroviral therapydrug resistanceresistance mutationsmultidrug resistanceИсследование выполнено по Государственному заданию по теме «Разработка набора реагентов для выявления мутаций устойчивости вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) к антиретровирусным препаратам методом полногеномного секвенирования» (№ 124070300038-0).ReferencesKeller S. C. et al. Accuracy of definitions for linkage to care in persons living with HIV // JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. – 2013. – Т. 63. – №. 5. – С. 622-630. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e3182968e87Keller S. C. et al. Accuracy of definitions for linkage to care in persons living with HIV // JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. – 2013. – T. 63. – №. 5. – S. 622-630. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e3182968e87Samji H. et al. Closing the gap: increases in life expectancy among treated HIV-positive individuals in the United States and Canada // PloS one. – 2013. – Т. 8. – №. 12. – С. E81355. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0081355Samji H. et al. Closing the gap: increases in life expectancy among treated HIV-positive individuals in the United States and Canada // PloS one. – 2013. – T. 8. – №. 12. – S. E81355. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0081355Доля ВИЧ-инфицированных лиц, получающих антиретровирусную терапию, от числа состоящих на диспансерном учёте // Единая межведомственная информационно-статистическая система : [Электронный ресурс]. – URL: https://www.fedstat.ru/indicator/43860 (дата обращения: 20.10.2025).Dolya VICh-infitsirovannykh lits, poluchayushchikh antiretrovirusnuyu terapiyu, ot chisla sostoyashchikh na dispansernom uchete // Edinaya mezhvedomstvennaya informatsionno-statisticheskaya sistema : [Electronic resource]. – URL: https://www.fedstat.ru/indicator/43860 (date of access: 20.10.2025). [In Russian].Национальная вирусологическая ассоциация., Московское онкологическое общество. Клинические рекомендации. ВИЧ-инфекция у взрослых // Рубрикатор клинических рекомендаций : [Электронный ресурс]. – 22 июля 2024 года. – URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/clin-rec/79_2 (дата обращения: 20.10.2025).Natsional’naya virusologicheskaya assotsiatsiya., Moskovskoe onkologicheskoe obshchestvo. Klinicheskie rekomendatsii. VICh-infektsiya u vzroslykh // Rubrikator klinicheskikh rekomendatsiy : [Electronic resource]. – 22 july 2024. – URL: https://cr.minzdrav.gov.ru/preview-cr/79_2 (date of access: 20.10.2025). [In Russian].Wensing A. M. et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1 // Topics in antiviral medicine. – 2022. – Т. 30. – №. 4. – С. 559.Wensing A. M. et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1 // Topics in antiviral medicine. – 2022. – T. 30. – №. 4. – S. 559.Puertas M. C. et al. Pan-resistant HIV-1 emergence in the era of integrase strand-transfer inhibitors: a case report // The Lancet Microbe. – 2020. – Т. 1. – №. 3. – С. e130-e135. DOI: https://doi.org/10.1016/S2666-5247(20)30006-9Puertas M. C. et al. Pan-resistant HIV-1 emergence in the era of integrase strand-transfer inhibitors: a case report // The Lancet Microbe. – 2020. – Т. 1. – №. 3. – С. e130-e135. DOI: https://doi.org/10.1016/S2666-5247(20)30006-9Galli L. et al. Burden of disease in PWH harboring a multidrug-resistant virus: data from the PRESTIGIO registry // Open Forum Infectious Diseases. – US : Oxford University Press, 2020. – Т. 7. – №. 11. – С. ofaa456. DOI: https://doi.org/10.1093/ofid/ofaa456Galli L. et al. Burden of disease in PWH harboring a multidrug-resistant virus: data from the PRESTIGIO registry // Open Forum Infectious Diseases. – US : Oxford University Press, 2020. – T. 7. – №. 11. – S. ofaa456. DOI: https://doi.org/10.1093/ofid/ofaa456Quinn T. C. HIV epidemiology and the effects of antiviral therapy on long-term consequences // Aids. – 2008. – Т. 22. – С. S7-S12. DOI: https://doi.org/10.1097/01.aids.0000327510.68503.e8Quinn T. C. HIV epidemiology and the effects of antiviral therapy on long-term consequences // Aids. – 2008. – T. 22. – S. S7-S12. DOI: https://doi.org/10.1097/01.aids.0000327510.68503.e8King J. R. et al. Pharmacokinetic enhancement of protease inhibitor therapy // Clinical pharmacokinetics. – 2004. – Т. 43. – №. 5. – С. 291-310. DOI: https://doi.org/10.2165/00003088-200443050-00003King J. R. et al. Pharmacokinetic enhancement of protease inhibitor therapy // Clinical pharmacokinetics. – 2004. – T. 43. – №. 5. – S. 291-310. DOI: https://doi.org/10.2165/00003088-200443050-00003Beerenwinkel N. et al. Estimating HIV evolutionary pathways and the genetic barrier to drug resistance // The Journal of infectious diseases. – 2005. – Т. 191. – №. 11. – С. 1953-1960.Beerenwinkel N. et al. Estimating HIV evolutionary pathways and the genetic barrier to drug resistance // The Journal of infectious diseases. – 2005. – T. 191. – №. 11. – S. 1953-1960.Смирнов Н. А. и др. Влияние социальных и других факторов на неблагоприятный исход течения ВИЧинфекции // Современные проблемы здравоохранения и медицинской статистики. – 2025. – №. 1. – С. 607-622. DOI: https://doi.org/10.24412/2312-2935-2025-1-607-622Smirnov N. A. i dr. Vliyanie sotsial’nykh i drugikh faktorov na neblagopriyatnyy iskhod techeniya VICh-infektsii // Sovremennye problemy zdravookhraneniya i meditsinskoy statistiki. – 2025. – №. 1. – S. 607-622. [In Russian]. DOI: https://doi.org/10.24412/2312-2935-2025-1-607-622Bangsberg D. R. et al. A single tablet regimen is associated with higher adherence and viral suppression than multiple tablet regimens in HIV+ homeless and marginally housed people // Aids. – 2010. – Т. 24. – №. 18. – С. 2835-2840. DOI: https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328340a209Bangsberg D. R. et al. A single tablet regimen is associated with higher adherence and viral suppression than multiple tablet regimens in HIV+ homeless and marginally housed people // Aids. – 2010. – T. 24. – №. 18. – S. 2835-2840. DOI: https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328340a209Larder B. Mechanisms of HIV-1 drug resistance // Aids. – 2001. – Т. 15. – С. S27-S34.Larder B. Mechanisms of HIV-1 drug resistance // Aids. – 2001. – T. 15. – S. S27-S34.Finzi D. et al. Identification of a reservoir for HIV-1 in patients on highly active antiretroviral therapy // Science. – 1997. – Т. 278. – №. 5341. – С. 1295-1300.Finzi D. et al. Identification of a reservoir for HIV-1 in patients on highly active antiretroviral therapy //Science. – 1997. – T. 278. – №. 5341. – S. 1295-1300.Bruner K. M. et al. A quantitative approach for measuring the reservoir of latent HIV-1 proviruses // Nature. – 2019. – Т. 566. – №. 7742. – С. 120-125. DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-019-0898-8Bruner K. M. et al. A quantitative approach for measuring the reservoir of latent HIV-1 proviruses // Nature. – 2019. – T. 566. – №. 7742. – S. 120-125. DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-019-0898-8Lucas G. M. et al. Longitudinal assessment of the effects of drug and alcohol abuse on HIV-1 treatment outcomes in an urban clinic // Aids. – 2002. – Т. 16. – №. 5. – С. 767-774.Lucas G. M. et al. Longitudinal assessment of the effects of drug and alcohol abuse on HIV-1 treatment outcomes in an urban clinic // Aids. – 2002. – T. 16. – №. 5. – S. 767-774.Viswanathan S. et al. Adherence and HIV RNA suppression in the current era of highly active antiretroviral therapy // JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. – 2015. – Т. 69. – №. 4. – С. 493-498. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000000643Viswanathan S. et al. Adherence and HIV RNA suppression in the current era of highly active antiretroviral therapy // JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. – 2015. – T. 69. – №. 4. – S. 493-498. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000000643Bennett D. E. et al. HIV drug resistance early warning indicators in cohorts of individuals starting antiretroviral therapy between 2004 and 2009: World Health Organization global report from 50 countries // Clinical infectious diseases. – 2012. – Т. 54. – №. suppl_4. – С. S280-S289.Bennett D. E. et al. HIV drug resistance early warning indicators in cohorts of individuals starting antiretroviral therapy between 2004 and 2009: World Health Organization global report from 50 countries // Clinical infectious diseases. – 2012. – T. 54. – №. suppl_4. – S. S280-S289.Bennett D. E. et al. Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update // PloS one. – 2009. – Т. 4. – №. 3. – С. E4724. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004724Bennett D. E. et al. Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update // PloS one. – 2009. – T. 4. – №. 3. – S. E4724. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004724Bailey A. J., Rhee S. Y., Shafer R. W. Integrase Strand Transfer Inhibitor Resistance in Integrase Strand Transfer Inhibitor-Naive Persons // AIDS Res Hum Retroviruses. – 2021. – T. 37. – №. 10. – С. 736-743. DOI: https://doi.org/10.1089/AID.2020.0261Bailey A. J., Rhee S. Y., Shafer R. W. Integrase Strand Transfer Inhibitor Resistance in Integrase Strand Transfer Inhibitor-Naive Persons // AIDS Res Hum Retroviruses. – 2021. – T. 37. – №. 10. – S. 736-743. DOI: https://doi.org/10.1089/AID.2020.0261Kirichenko A. et al. HIV-1 drug resistance among treatment-naïve patients in Russia: analysis of the national database, 2006–2022 // Viruses. – 2023. – Т. 15. – №. 4. – С. 991. DOI: https://doi.org/10.3390/v15040991Kirichenko A. et al. HIV-1 drug resistance among treatment-naïve patients in Russia: analysis of the national database, 2006–2022 //Viruses. – 2023. – T. 15. – №. 4. – S. 991. DOI: https://doi.org/10.3390/v15040991Kirichenko A. A. et al. Prevalence And Structure Of Hiv-1 Drug Resistance Among Treatment Naïve Patients Since The Introduction Of Antiretroviral Therapy In The Russian Federation // HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. – 2019. – Т. 11. – №. 2. – С. 75-83. DOI: https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-2-75-83Kirichenko A. A. et al. Prevalence And Structure Of Hiv-1 Drug Resistance Among Treatment Naïve Patients Since The Introduction Of Antiretroviral Therapy In The Russian Federation // HIV Infection and Immunosuppressive Disorders. – 2019. – T. 11. – №. 2. – S. 75-83. DOI: https://doi.org/10.3390/v15040991Lapovok I. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naïve patients in Russia from 2005 to 2015 // 14th European Meeting on HIV & Hepatitis, Rome, Italy. – 2016. – С. 25-27.Lapovok I. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naïve patients in Russia from 2005 to 2015 // 14th European Meeting on HIV & Hepatitis, Rome, Italy. – 2016. – S. 25-27.Wymant C. et al. Easy and accurate reconstruction of whole HIV genomes from short-read sequence data with shiver // Virus evolution. – 2018. – Т. 4. – №. 1. – С. vey007. DOI: https://doi.org/10.1093/ve/vey007Wymant C. et al. Easy and accurate reconstruction of whole HIV genomes from short-read sequence data with shiver // Virus evolution. – 2018. – T. 4. – №. 1. – S. vey007. DOI: https://doi.org/10.1093/ve/vey007

The authors declare that there are no conflicts of interest present.