jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2023-15-3-92-109jofin-1547Research ArticleОригинальное исследованиеOriginal ResearchРаспространенность генов устойчивости к антибиотикам в составе резистома взрослых жителей Архангельска с учетом тяжести перенесенной COVID-19Prevalence of antibiotic resistance genes in resistome of adult residents of Arkhangelsk with regard to the severity of COVID-19КригерЕ. А.KriegerE. A.

Кригер Екатерина Анатольевна – научный сотрудник международного центра научных компетенций центральной научно-исследовательской лаборатории, доцент кафедры инфекционных болезней СГМУ, кандидат медицинских наук, доцент.

Архангельск

тел.: +7-950-963-57-11

Arkhangelsk

kate-krieger@mail.ruПавленкоА. В.PavlenkoA. V.

Павленко Александр Владимирович – научный сотрудник НИИ СБМ.

Москва

тел.: 8(495)332-01-01 доб. 149

Moscow

pavav@mail.ruЕсинЮ. П.EsinYu. P.

Есин Юрий Игоревич – студент Научно-исследовательского института системной биологии и медицины.

Москва

тел.: 8 (495)332-01-01 доб. 127

Moscow

iu.esin2015@yandex.ruАрхиповаА. Л.ArkhipovaA. L.

Архипова Анна Леонидовна – младший научный сотрудник НИИ СБМ.

Москва

тел.: 8(495) 332-01-01 доб. 127

Moscow

kamfora3@gmail.comКовальчукС. Н.KovalchukS. N.

Ковальчук Светлана Николаевна – старший научный сотрудник НИИ СБМ, кандидат биологических наук.

Москва

тел.: 8(495) 332-01-01 доб. 126

Moscow

s.n.kovalchuk@mail.ruШагровЛ. Л.ShagrovL. L.

Шагров Леонид Леонидович – младший научный сотрудник центра коллективного пользования лабораторным оборудованием центральной научно-исследовательской лаборатории СГМУ.

Архангельск

тел.: +7-950-660-86-85

Arkhangelsk

leonidshagrov@mail.ruБеловаН. И.BelovaN. I.

Белова Наталья Игоревна – младший научный сотрудник центра коллективного пользования лабораторным оборудованием центральной научно-исследовательской лаборатории СГМУ.

Архангельск

тел.: +7-950-660-86-85

Arkhangelsk

leonidshagrov@mail.ruЦывареваН. П.TsyvarevaN. P.

Цыварева Надежда Петровна – студентка 6-го курса факультета медико-профилактического дела и медицинской биохимии СГМУ.

Архангельск

тел.: +7-981-550-55-48

Arkhangelsk

nadia.tsyvareva@yandex.ruКудрявцевА. В.KudryavtsevA. V.

Кудрявцев Александр Валерьевич – заведующий международным центром научных компетенций центральной научно-исследовательской лаборатории СГМУ, Ph.D.

Архангельск

тел.: +7-921-721-21-25

Arkhangelsk

alex.v.kudryavtsev@yandex.ruИльинаЕ. Н.IlinaE. N.

Ильина Елена Николаевна – главный научный сотрудник, заведующий лабораторией математической биологии и биоинформатики НИИ СБМ, доктор биологических наук, член-корреспондент РАН.

Москва

тел.: 8(495)332-01-01 доб. 103

Moscow

ilinaen@sysbiomed.ruСеверный государственный медицинский университетРоссияNorthern State Medical UniversityRussian FederationНаучно-исследовательский институт системной биологии и медициныРоссияResearch Institute for Systems Biology and MedicineRussian Federation20231310202315392109Copyright © Кригер Е.А., Павленко А.В., Есин Ю.П., Архипова А.Л., Ковальчук С.Н., Шагров Л.Л., Белова Н.И., Цыварева Н.П., Кудрявцев А.В., Ильина Е.Н., 20232023Кригер Е.А., Павленко А.В., Есин Ю.П., Архипова А.Л., Ковальчук С.Н., Шагров Л.Л., Белова Н.И., Цыварева Н.П., Кудрявцев А.В., Ильина Е.Н.Krieger E.A., Pavlenko A.V., Esin Y.P., Arkhipova A.L., Kovalchuk S.N., Shagrov L.L., Belova N.I., Tsyvareva N.P., Kudryavtsev A.V., Ilina E.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1547Цель

Цель: оценить распространённость генов устойчивости к антибиотикам в составе резистома взрослых жителей Архангельска с учётом тяжести перенесённой новой коронавирусной инфекции (COVID-19).

Материалы и методы

Материалы и методы: поперечное исследование проведено с октября по ноябрь 2022 г. (через 2,5 года от начала пандемии COVID-19) с участием случайной выборки (N=455) населения Архангельска в возрасте 42–76 лет. Процедура исследования включала опрос, определение иммуноглобулинов G к белкам вируса SARS-CoV-2 и выявление генов устойчивости к антибиотикам в образцах кала методом полимеразной цепной реакции.

Результаты

Результаты: практически все участники (98,5%) имели хотя бы 1 ген устойчивости к антибиотикам, у 5,6% выявлены детерминанты резистентности сразу к 3 классам антибиотиков. Распространённость генов устойчивости к макролидам составила 98,5%, к бета-лактамам – 29,0%, к гликопептидам – 16,0%. Гены резистентности к бета-лактамным антибиотикам чаще выявлялись среди участников, получавших стационарное лечение по поводу COVID-19 (44,8%), и среди лиц, часто болеющих острыми респираторными инфекциями (50,0%). Вакцинированные против SARS-CoV-2 (26,6%) и участники с сердечно-сосудистыми заболеваниями (17,0%) реже имели гены резистентности к бета-лактамам.

Заключение

Заключение: выявлена высокая распространённость генов устойчивости к антибиотикам в составе резистома взрослых жителей Архангельска. Определена связь между резистентностью к бета-лактамам и тяжестью перенесённой COVID-19. Результаты исследования могут быть использованы для оптимизации протоколов стартовой антибиотикотерапии и принятия решений, связанных с назначением антимикробных препаратов различным категориям взрослого населения.

Objective

Objective: to estimate the prevalence of antibiotic resistance genes in the resistome of adult residents of Arkhangelsk with regard to the severity of the novel coronavirus infection (COVID-19).

Materials and methods

Materials and methods. A cross-sectional study was conducted between October and November 2022 (2.5 years after the start of the COVID-19 pandemic) on a random sample (N=455) of Arkhangelsk population aged 42-76 years. The data collection involved a questionnaire survey, assessment of immunoglobulins G to S-, S2, N-proteins of SARS-CoV-2 and detection of antibiotic resistance genes in fecal samples by polymerase chain reaction.

Results

Results. Almost all participants (98.5%) had at least one antibiotic resistance gene, the resistance determinants to three classes of antibiotics simultaneously were detected in 5.6%. The prevalence of resistance genes to macrolides was 98.5%, to beta-lactams – 29.0%, and to glycopeptides – 16.0%. Antibiotic resistance genes to beta-lactams were more prevalent among participants who had previously been hospitalized for COVID-19 (44.8%) and among those having had frequent acute respiratory infections (50.0%). Individuals vaccinated against SARS-CoV-2 (26.6%) and participants with cardiovascular diseases (17.0%) were less likely to have beta-lactam resistance genes.

Conclusion

Conclusion. The high prevalence of antibiotic resistance genes has been revealed in the resistome of adult residents of Arkhangelsk. We determined the association between resistance to beta-lactams and COVID-19 severity. The study results could be used to improve the protocols of antibiotic therapy and to guide a decision-making related to the antibiotic prescription in adults.

резистомантибиотикорезистентностьгены устойчивости к антибиотикамCOVID-19resistomeantibiotic resistanceantibiotic resistance genesCOVID-19Работа выполнена при поддержке государственного задания № 122030900064-9 Роспотребадзора.ReferencesВОЗ. Устойчивость к противомикробным препаратам. 2021. URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/antimicrobial-resistance (дата обращения: 11.07.2023).VOZ. Ustoychivost’ k antimikrobnym preparatam. 2021. URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/antimicrobial-Sersistance (дата обращения: 11.07.2023).O’Neill, J. Antimicrobial resistance: tackling a crisis for the health and wealth of nations. The Review on Antimicrobial Resistance Chaired. – 2014. – 16 с.O’Neill, J. Antimicrobial resistance: tackling a crisis for the health and wealth of nations. The Review on Antimicrobial Resistance Chaired. – 2014. – 16 с.Guimarães, L.C. Inside the Pan-genome – Methods and Software Overview / L.C. Guimarães, J. Florczak-Wyspianska, L.B. de Jesus [et al.]. – DOI: 10.2174/1389202916666150423002311. – Текст: электронный / / Curr Genomics. – 2015. – №16(4). – С.245-252.Guimarães, L.C. Inside the Pan-genome – Methods and Software Overview / L.C. Guimarães, J. Florczak-Wyspianska, L.B. de Jesus [et al.]. – DOI: 10.2174/138920291666615042300 – Текст: электронный / / Curr Genomics. – 2015. – №16(4). – С.245-252.Crits-Christoph, А. Good microbes, bad genes? The dissemination of antimicrobial resistance in the human microbiome / A. Crits-Christoph, H.A. Hallowell, K. Koutouvalis [et al.]. – DOI:10.1080/19490976.2022.2055944. – Текст электронный / / Gut microbes. – 2022. – №14(1).Crits-Christoph, А. Good microbes, bad genes? The dissemination of antimicrobial resistance in the human microbiome / A. Crits-Christoph, H.A. Hallowell, K. Koutouvalis [et al.]. – DOI:10.1080/19490976.2022.2055944. – Текст электронный // Gut microbes. – 2022. – №14(1).Singh, S. The human gut resistome: Current concepts & future prospects / S. Singh, N. Verma, N. Taneja. – DOI:10.4103/ijmr.IJMR_1979_17. – Текст электронный / / Indian J Med Res. – 2019. – №150(4). – С.345-358.Singh, S. The human gut resistome: Current concepts & future prospects / S. Singh, N. Verma, N. Taneja. – DOI:10.4103/ijmr.IJMR_1979_17. – Текст электронный / / Indian J Med Res. – 2019. – №150(4). – С.345-358.van Schaik, W. The human gut resistome / W. van Schaik. – DOI:10.1098/rstb.2014.0087. – Текст электронный / / Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. – 2015. – №370(1670).van Schaik, W. The human gut resistome / W. van Schaik. – DOI:10.1098/rstb.2014.0087. – Текст электронный / / Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. – 2015. – №370(1670).Despotovic, M. Reservoirs of antimicrobial resistance in the context of One Health / M. Despotovic, L. de Nies, S.B. Busi [et al.]. – DOI:10.1016/j.mib.2023.102291. – Текст электронный / / Curr Opin Microbiol. – 2023.Despotovic, M. Reservoirs of antimicrobial resistance in the context of One Health / M. Despotovic, L. de Nies, S.B. Busi [et al.]. – DOI:10.1016/j.mib.2023.102291. – Текст электронный / / Curr Opin Microbiol. – 2023.Toprak, E. Evolutionary paths to antibiotic resistance under dynamically sustained drug selection / E. Toprak, A. Veres, J.B. Michel [et al.]. – DOI:10.1038/ng.1034. – Текст электронный / / Nat Genet. – 2011. – №44(1). – С.101-105.Toprak, E. Evolutionary paths to antibiotic resistance under dynamically sustained drug selection / E. Toprak, A. Veres, J.B. Michel [et al.]. – DOI:10.1038/ng.1034. – Текст электронный / / Nat Genet. – 2011. – №44(1). – С.101-105.Shah, T. The Intestinal Microbiota: Impacts of Antibiotics Therapy, Colonization Resistance, and Diseases / T. Shah, Z. Baloch, Z. Shah [et al.]. – DOI:10.3390/ijms22126597. –Текст электронный // Int J Mol Sci. – 2021. – №22(12).Shah, T. The Intestinal Microbiota: Impacts of Antibiotics Therapy, Colonization Resistance, and Diseases / T. Shah, Z. Baloch, Z. Shah [et al.]. – DOI:10.3390/ijms22126597. –Текст электронный / / Int J Mol Sci. – 2021. – №22(12).McInnes, R.S. Horizontal transfer of antibiotic resistance genes in the human gut microbiome / R.S McInnes, G.E. Mc-Callum, L.E. Lamberte [et al.]. -DOI:10.1016/j.mib.2020.02.002. – Текст электронный / / Curr Opin Microbiol. – 2020. – №53. – С.35-43.McInnes, R.S. Horizontal transfer of antibiotic resistance genes in the human gut microbiome / R.S McInnes, G.E. Mc-Callum, L.E. Lamberte [et al.]. -DOI:10.1016/j.mib.2020.02.002. – Текст электронный / / Curr Opin Microbiol. – 2020. – №53. – С.35-43.Martinez, J.L. General principles of antibiotic resistance in bacteria / J.L. Martinez. – DOI:10.1016/j.ddtec.2014.02.001. – Текст электронный / / Drug Discov Today Technol. – 2014. – №11. – С.33-39.Martinez, J.L. General principles of antibiotic resistance in bacteria / J.L. Martinez. – DOI:10.1016/j.ddtec.2014.02.001. – Текст электронный / / Drug Discov Today Technol. – 2014. – №11. – С.33-39.Агеевец, В.А. Сравнительная активность карбапенемных антибиотиков в отношении грамотрицательных продуцентов карбапенемаз различных групп / В.А. Агеевец [и др.]. – DOI: 10.37489/0235-2990-2022-67-1-2-9-15. – Текст электронный / / Антибиотики и Химиотерапия. – 2022. – № 67 (1–2). – С. 9–15.Agevets, V.A. Sravnitel’naya aktivnost’ karbapenemicheskikh antibiotikov v otnoshenii gramo -negativnykh proizvoditeley karbapenemaza razlichnykh grupp/ V.A. Agevets, O.S. Sulyan, A.A. Avdeeva [i dr.]. – DOI: 10.37489/0235-2990-2022-67-1-2-9-15. – Текст электронный / / Antibiotiki i khimioterapiya. – 2022. – №. 67 (1-2). – С.9-15.Kern-Zdanowicz, I. pCTX-M3-Structure, Function, and Evolution of a Multi-Resistance Conjugative Plasmid of a Broad Recipient Range / I. Kern-Zdanowicz. – DOI:10.3390/ijms22094606. – Текст электронный / / Int J Mol Sci. – 2021. – №22(9).Kern-Zdanowicz, I. pCTX-M3-Structure, Function, and Evolution of a Multi-Resistance Conjugative Plasmid of a Broad Recipient Range / I. Kern-Zdanowicz. – DOI:10.3390/ijms22094606. – Текст электронный / / Int J Mol Sci. – 2021. – №22(9).Brinkac, L. The Threat of Antimicrobial Resistance on the Human Microbiome / L. Brinkac, A. Voorhies, A. Gomez [et al.]. – DOI:10.1007/s00248-017-0985-z. – Текст электронный // Microb Ecol. – 2017. – №74(4). – С.1001-1008.Brinkac, L. The Threat of Antimicrobial Resistance on the Human Microbiome / L. Brinkac, A. Voorhies, A. Gomez [et al.]. – DOI:10.1007/s00248-017-0985-z. – Текст электронный / / Microb Ecol. – 2017. – №74(4). – С.1001-1008.Rizvi, S.G. COVID-19 and antimicrobial resistance: A cross-study / S.G. Rizvi, S.Z. Ahammad. – DOI:10.1016/j.scitotenv.2021.150873. – Текст электронный / / Sci Total Environ. – 2022.Rizvi, S.G. COVID-19 and antimicrobial resistance: A cross-study / S.G. Rizvi, S.Z. Ahammad. – DOI:10.1016/j.scitotenv.2021.150873. – Текст электронный / / Sci Total Environ. – 2022.Rawson, T.M. Bacterial and Fungal Coinfection in Individuals With Coronavirus: A Rapid Review To Support COVID-19 Antimicrobial Prescribing / T.M. Rawson, L.S.P. Moore, N. Zhu [et al.]. – DOI:10.1093/cid/ciaa530. – Текст электронный // Clin Infect Dis. – 2020. – №71(9). – С.2459-2468.Rawson, T.M. Bacterial and Fungal Coinfection in Individuals With Coronavirus: A Rapid Review To Support COVID-19 Antimicrobial Prescribing / T.M. Rawson, L.S.P. Moore, N. Zhu [et al.]. – DOI:10.1093/cid/ciaa530. – Текст электронный / / Clin Infect Dis. – 2020. – №71(9). – С.2459-2468.Zhou, F. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study / F. Zhou, T. Yu, R. Du [et al.]. – DOI:10.1016/S0140-6736(20)30566-3. – Текст электронный / / Lancet. – 2020. – №395(10229). – С.1054-1062.Zhou, F. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study / F. Zhou, T. Yu, R. Du [et al.]. – DOI:10.1016/S0140-6736(20)30566-3. – Текст электронный / / Lancet. – 2020. – №395(10229). – С.1054-1062.Kang, Y. Alterations of fecal antibiotic resistome in COVID-19 patients after empirical antibiotic exposure / Y. Kang, S. Chen, Y. Chen [et al.]. – DOI:10.1016/j.ijheh.2021.113882. – Текст электронный / / Int J Hyg Environ Health. – 2022.Kang, Y. Alterations of fecal antibiotic resistome in COVID-19 patients after empirical antibiotic exposure / Y. Kang, S. Chen, Y. Chen [et al.]. – DOI:10.1016/j.ijheh.2021.113882. – Текст электронный / / Int J Hyg Environ Health. – 2022.Su, Q. Antibiotics and probiotics impact gut antimicrobial resistance gene reservoir in COVID-19 patients / Q. Su, Q. Liu, L. Zhang [et al.]. – DOI:10.1080/19490976.2022.2128603. – Текст электронный / / Gut Microbes. – 2022. – №14(1).Su, Q. Antibiotics and probiotics impact gut antimicrobial resistance gene reservoir in COVID-19 patients / Q. Su, Q. Liu, L. Zhang [et al.]. – DOI:10.1080/19490976.2022.2128603. – Текст электронный / / Gut Microbes. – 2022. – №14(1).Cook, S. Know Your Heart: Rationale, design and conduct of a cross-sectional study of cardiovascular structure, function and risk factors in 4500 men and women aged 35-69 years from two Russian cities, 2015-18 / S. Cook, S. Malyutina, A.V. Kudryavtsev [et al.]. – DOI:10.12688/wellcomeopenres.14619.3. – Текст электронный / / Wellcome Open Res. – 2018.Cook, S. Know Your Heart: Rationale, design and conduct of a cross-sectional study of cardiovascular structure, function and risk factors in 4500 men and women aged 35-69 years from two Russian cities, 2015-18 / S. Cook, S. Malyutina, A.V. Kudryavtsev [et al.]. – DOI:10.12688/wellcomeopenres.14619.3. – Текст электронный / / Wellcome Open Res. – 2018.Li, Y. Asymptomatic and Symptomatic Patients With Non-severe Coronavirus Disease (COVID-19) Have Similar Clinical Features and Virological Courses: A Retrospective Single Center Study / Y. Li, J. Shi, J. Xia [et al.]. – DOI:10.3389/fmicb.2020.01570. – Текст электронный / / Front Microbiol. – 2020.Li, Y. Asymptomatic and Symptomatic Patients With Non-severe Coronavirus Disease (COVID-19) Have Similar Clinical Features and Virological Courses: A Retrospective Single Center Study / Y. Li, J. Shi, J. Xia [et al.]. – DOI:10.3389/fmicb.2020.01570. – Текст электронный / / Front Microbiol. – 2020.Singhal, S. Clinical features and outcomes of COVID-19 in older adults: a systematic review and meta-analysis / S. Singhal, P. Kumar, S. Singh [et al.]. – DOI:10.1186/s12877-021-02261-3. – Текст электронный / / BMC Geriatr. – 2021. – №21(1).Singhal, S. Clinical features and outcomes of COVID-19 in older adults: a systematic review and meta-analysis / S. Singhal, P. Kumar, S. Singh [et al.]. – DOI:10.1186/s12877-021-02261-3. – Текст электронный / / BMC Geriatr. – 2021. – 21(1).Shokouhi, S. Resistance of Streptococcus Pneumoniae to Macrolides in Iran / S. Shokouhi, I. Alavi Darazam, A. Yazdanpanah. – Текст электронный / / Tanaffos. – 2019. – №18(2). – С.104-111.Shokouhi, S. Resistance of Streptococcus Pneumoniae to Macrolides in Iran / S. Shokouhi, I. Alavi Darazam, A. Yazdanpanah. – Текст электронный / / Tanaffos. – 2019. – №18(2). – С.104-111.Berbel, D. An Overview of Macrolide Resistance in Streptococci: Prevalence, Mobile Elements and Dynamics / D. Berbel, A. González-Díaz, G. López de Egea [et a.l]. – DOI:10.3390/microorganisms10122316. – Текст электронный / / Microorganisms. – 2022. – №10(12).Berbel, D. An Overview of Macrolide Resistance in Streptococci: Prevalence, Mobile Elements and Dynamics / D. Berbel, A. González-Díaz, G. López de Egea [et a.l]. – DOI:10.3390/microorganisms10122316. – Текст электронный / / Microorganisms. – 2022. – №10(12).Sulayyim, H.J.A. Antibiotic Resistance during COVID-19: A Systematic Review / H.J.A Sulayyim, R. Ismail, A.A. Hamid [et al.]. – DOI:10.3390/ijerph191911931. – Текст электронный / / Int J Environ Res Public Health. – 2022. – №19(19).Sulayyim, H.J.A. Antibiotic Resistance during COVID-19: A Systematic Review / H.J.A Sulayyim, R. Ismail, A.A. Hamid [et al.]. – DOI:10.3390/ijerph191911931. – Текст электронный / / Int J Environ Res Public Health. – 2022. – №19(19).Song, J.H. Macrolide resistance and genotypic characterization of Streptococcus pneumoniae in Asian countries: a study of the Asian Network for Surveillance of Resistant Pathogens (ANSORP) / J.H. Song, H.H. Chang, J.Y. Suh [et al.]. – DOI: 10.1093/jac/dkh118. – Текст электронный / / The Journal of antimicrobial chemotherapy. – 2004. – №53(3). – С.457 – 463.Song, J.H. Macrolide resistance and genotypic characterization of Streptococcus pneumoniae in Asian countries: a study of the Asian Network for Surveillance of Resistant Pathogens (ANSORP) / J.H. Song, H.H. Chang, J.Y. Suh [et al.]. – DOI: 10.1093/jac/dkh118. – Текст электронный / / The Journal of antimicrobial chemotherapy. – 2004. – №53(3). – С.457 – 463.Wolter, N. Molecular basis and clonal nature of increasing pneumococcal macrolide resistance in South Africa, 2000-2005 / N. Wolter, A. von Gottberg, M. du Plessis [et al.]. – DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2008.01.013. – Текст электронный / / International journal of antimicrobial agents. – 2008. – №32(1). – С.62-67.Wolter, N. Molecular basis and clonal nature of increasing pneumococcal macrolide resistance in South Africa, 2000-2005 / N. Wolter, A. von Gottberg, M. du Plessis [et al.]. – DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2008.01.013. – Текст электронный / / International journal of antimicrobial agents. – 2008. – №32(1). – С.62-67.Michels, N. Human microbiome and metabolic health: An overview of systematic reviews / N. Michels, S. Zouiouich, B. Vanderbauwhede [et al.]. – DOI: 10.1111/obr.13409. – Текст электронный / / Official journal of the International Association for the Study of Obesity. – 2022. – №23(4).Michels, N. Human microbiome and metabolic health: An overview of systematic reviews / N. Michels, S. Zouiouich, B. Vanderbauwhede [et al.]. – DOI: 10.1111/obr.13409. – Текст электронный / / Official journal of the International Association for the Study of Obesity. – 2022. – №23(4).Kovaleva, A. Immunomodulatory effects of macrolides during community-acquired pneumonia: a literature review / A. Kovaleva, H.H. Remmelts, G.T. Rijkers [et al.]. – DOI: 10.1093/jac/dkr520. – Текст электронный / / The Journal of antimicrobial chemotherapy. – 2012. – №67(3). – С.530-540.Kovaleva, A. Immunomodulatory effects of macrolides during community-acquired pneumonia: a literature review / A. Kovaleva, H.H. Remmelts, G.T. Rijkers [et al.]. – DOI: 10.1093/jac/dkr520. – Текст электронный / / The Journal of antimicrobial chemotherapy. – 2012. – №67(3). – С.530-540.Камкин, Е.Г. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Временные методические рекомендации / Е.Г. Камкин [и др.]. – М., 2020 (версия 6-9).Kamkin, E.G. [i dr.]. Profilaktika, diagnostika i lecheniye novoy koronavirusnoy infektsii (COVID-19). Vremennyu methodicheskie rekomendacii. Moskva: 2020 (versiya 6-9).Камкин, Е.Г. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Временные методические рекомендации / Е.Г. Камкин [и др.]. – М., 2021 (версия 10 от 8.02.2021).Kamkin, E.G. [i dr.]. Profilaktika, diagnostika i lecheniye novoy koronavirusnoy infektsii (COVID-19). Vremennyu methodicheskie rekomendacii. Moskva: 2021 (versiya 10 ot 8.02.2021).Стецюк, О.У. О селекции устойчивости к макролидам / О.У. Стецюк, И.В. Андреева // Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. – 2010. – № 12 (3). – С. 255–259. – URL: https://cyberleninka.ru/article/n/o-selektsii-ustoychivosti-k-makrolidam (дата обращения: 12.07.2023).Stetsyuk, O.U. On the selection of resistance to macrolides / O.U. Stetsyuk, I.V. Andreeva // Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. – 2010. – №. 12 (3). – С.255-259. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/o-selektsii-utoychivosti-k-makrolidam (дата обращения: 12.07.2023).Makarov, D.A. Antimicrobial resistance of commensal Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from food-producing animals in Russia / D.A.Makarov, O.E. Ivanova, A.V. Pomazkova [et al.]. – DOI:10.14202/vetworld.2022.611-621. – Текст электронный / / Vet World. – 2022. – №15(3). – С.611-621.Makarov, D.A. Antimicrobial resistance of commensal Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from food-producing animals in Russia / D.A.Makarov, O.E. Ivanova, A.V. Pomazkova [et al.]. – DOI:10.14202/vetworld.2022.611-621. – Текст электронный / / Vet World. – 2022. – №15(3). – С.611-621.Berglund, F. Identification and reconstruction of novel antibiotic resistance genes from metagenomes / F. Berglund, T. sterlund, F. Boulund [et al.]. – DOI:10.1186/s40168-019-0670-1. – Текст электронный / / Microbiome. – 2019. – №7(1).Berglund, F. Identification and reconstruction of novel antibiotic resistance genes from metagenomes / F. Berglund, T. Österlund, F. Boulund [et al.]. – DOI:10.1186/s40168-019-0670-1. – Текст электронный / / Microbiome. – 2019. – №7(1).Peng, Y. Gut microbiome and resistome changes during the first wave of the COVID-19 pandemic in comparison with pre-pandemic travel-related changes / Y. Peng, D. Zhang, T. Chen [et al.]. – DOI:10.1093/jtm/taab067. – Текст электронный / Journal of travel medicine. – 2021. –№28(7).Peng, Y. Gut microbiome and resistome changes during the first wave of the COVID-19 pandemic in comparison with pre-pandemic travel-related changes / Y. Peng, D. Zhang, T. Chen [et al.]. – DOI:10.1093/jtm/taab067. – Текст электронный / Journal of travel medicine. – 2021. –№28(7).Avdeev, S. Antimicrobial Prescribing Patterns in Patients with COVID-19 in Russian Multi-Field Hospitals in 2021: Results of the Global-PPS Project / S. Avdeev, S. Rachina, Y. Belkova [et al.]. – DOI:10.3390/tropicalmed7050075. – Текст электронный / / Trop Med Infect Dis. – 2022. – №7(5).Avdeev, S. Antimicrobial Prescribing Patterns in Patients with COVID-19 in Russian Multi-Field Hospitals in 2021: Results of the Global-PPS Project / S. Avdeev, S. Rachina, Y. Belkova [et al.]. – DOI:10.3390/tropicalmed7050075. – Текст электронный / / Trop Med Infect Dis. – 2022. – №7(5).Woerther, P.L. Trends in human fecal carriage of extended-spectrum β-lactamases in the community: toward the globalization of CTX-M / P.L. Woerther, C. Burdet, E. Chachaty, – DOI:10.1128/CMR.00023-13. – Текст электронный / / Clinical microbiology reviews. – 2013. –№26(4). – С.744-758.Woerther, P.L. Trends in human fecal carriage of extended-spectrum β-lactamases in the community: toward the globalization of CTX-M / P.L. Woerther, C. Burdet, E. Chachaty, – DOI:10.1128/CMR.00023-13. – Текст электронный / / Clinical microbiology reviews. – 2013. –№26(4). – С.744-758.Лазарева, И.В. Распространение и антибактериальная резистентность грамотрицательных бактерий, продуцентов карбапенемаз, в Санкт-Петербурге и некоторых других регионах Российской Федерации / И.В. Лазарева [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. – 2016. – Т. 61, № 11–12. – С. 28–38.Lazareva, I.V. Rasprostraneniye i antibakterial’naya rezistentnost’ gramotritsatel’nykh bakteriy, produtsentov karbapenemaz, v Sankt-Peterburge i nekotorykh drugikh regionakh Rossiyskoy Federatsii / I.V. Lazareva, V.A. Ageyevets, T.A. Yershova [i dr.] // Antibiotiki i khimioterapiya. – 2016. – T. 61. – № 11-12. – С.28-38.Сухорукова, М.В. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2015-2016 / М.В. Сухорукова // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. – T. 21, № 2. – C. 49–56.Sukhorukova, M.V. Antibiotikorezistentnost’ nozokomial’nykh shtammov Enterobacteriaceae v statsionarakh Rossii: rezul’taty mnogotsentrovogo epidemiologicheskogo issledovaniya «MARAFON» 2015-2016 / M.V. Sukhorukova // Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. – 2019. – T. 21. – №2. – C. 49-56.Walsh, T.R. Metallo-beta-lactamases: the quiet before the storm? / T.R. Walsh, M.A.Toleman, L. Poirel [et al.]. – DOI:10.1128/CMR.18.2.306-325.2005. – Текст электронный / / Clinical microbiology reviews. – 2005. – №18(2). – С.306-325.Walsh, T.R. Metallo-beta-lactamases: the quiet before the storm? / T.R. Walsh, M.A.Toleman, L. Poirel [et al.]. – DOI:10.1128/CMR.18.2.306-325.2005. – Текст электронный / / Clinical microbiology reviews. – 2005. – №18(2). – С.306-325.van Duin, D. The global epidemiology of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae / D. van Duin, Y. Doi. – DOI:10.1080/21505594.2016.1222343. – Текст электронный // Virulence. – 2017. – №8(4). – С.460-469.van Duin, D. The global epidemiology of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae / D. van Duin, Y. Doi. – DOI:10.1080/21505594.2016.1222343. – Текст электронный // Virulence. – 2017. – №8(4). – С.460-469.Antimicrobial Resistance in the EU/EEA: A One-Health Response. 2022. URL: https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/antimicrobial-resistance-policy-brief-2022.pdf. (дата обращения: 20.07.2023).Antimicrobial Resistance in the EU/EEA: A One-Health Response. 2022. URL: https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/antimicrobial-resistance-policy-brief-2022.pdf. (дата обращения: 20.07.2023).Zhao, Y. Gut microbiome and cardiovascular disease / Y. Zhao, Z. Wang. – DOI:10.1097/HCO.0000000000000720. – Текст электронный / / Curr Opin Cardiol. – 2020. –№35(3). – С.207-218.Zhao, Y. Gut microbiome and cardiovascular disease / Y. Zhao, Z. Wang. – DOI:10.1097/HCO.0000000000000720. – Текст электронный / / Curr Opin Cardiol. – 2020. –№35(3). – С.207-218.Violi, F. Gut-derived low-grade endotoxaemia, atherothrombosis and cardiovascular disease / F. Violi, V. Cammisotto, S. Bartimoccia [et al.]. – DOI:10.1038/s41569-022-00737-2. – Текст электронный / / Nature reviews Cardiology. – 2023. – №20(1). – С.24-37.Violi, F. Gut-derived low-grade endotoxaemia, atherothrombosis and cardiovascular disease / F. Violi, V. Cammisotto, S. Bartimoccia [et al.]. – DOI:10.1038/s41569-022-00737-2. – Текст электронный / / Nature reviews Cardiology. – 2023. – №20(1). – С.24-37.iabattini, A. Role of the Microbiota in the Modulation of Vaccine Immune Responses / A. Ciabattini, R. Olivieri, E. Lazzeri [et al.]. – DOI:10.3389/fmicb.2019.01305. – Текст электронный / / Frontiers in microbiology. – 2019. – №10.Ciabattini, A. Role of the Microbiota in the Modulation of Vaccine Immune Responses / A. Ciabattini, R. Olivieri, E. Lazzeri [et al.]. – DOI:10.3389/fmicb.2019.01305. – Текст электронный / / Frontiers in microbiology. – 2019. – №10.Davies, N.G. Modeling the effect of vaccination on selection for antibiotic resistance in Streptococcus pneumonia / N.G. Davies, S. Flasche, M. Jit [et al.]. – DOI:10.1126/scitranslmed.aaz8690. – Текст электронный / / Science translational medicine. –2021. – №13(606).Davies, N.G. Modeling the effect of vaccination on selection for antibiotic resistance in Streptococcus pneumonia / N.G. Davies, S. Flasche, M. Jit [et al.]. – DOI:10.1126/scitranslmed.aaz8690. – Текст электронный / / Science translational medicine. –2021. – №13(606).Mishra, R.P. Vaccines and antibiotic resistance / R.P. Mishra, E. Oviedo-Orta, P. Prachi [et al.]. – DOI:10.1016/j.mib.2012.08.002. – Текст электронный / / Curr Opin Microbiol. – 2012. – №15(5). – С.596-602.Mishra, R.P. Vaccines and antibiotic resistance / R.P. Mishra, E. Oviedo-Orta, P. Prachi [et al.]. – DOI:10.1016/j.mib.2012.08.002. – Текст электронный/ / Curr Opin Microbiol. – 2012. – №15(5). – С.596-602.Кригер, Е.А. Оценка распространенности заболеваний с учетом диагностической эффективности тестов на примере использования серологических тестов для диагностики новой коронавирусной инфекции (COVID-19) / Е.А. Кригер, А.М. Гржибовский, В.А. Постоев // Экология человека. – 2022. – Т. 29, № 5. – C. 301–309.Kriger, Ye.A. Otsenka rasprostranennosti zabolevaniy s uchetom diagnosticheskoy effektivnosti testov na primere ispol’zovaniya serologicheskikh testov dlya diagnostiki novoy koronavirusnoy infektsii (COVID-19) / Ye.A. Kriger, A.M. Grzhibovskiy, V.A. Postoyev // Ekologiya cheloveka. – 2022. – T. 29. – №5. – C. 301-309.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.