jofinЖурнал инфектологииJournal Infectology2072-6732IPO “АIDSSPbR"10.22625/2072-6732-2023-15-2-6-13jofin-1499Research ArticleПроблемная статьяProblem articleИзменения в серотиповом составе Streptococcus pneumoniae, циркулирующих среди детей в Российской Федерации, после внедрения 13-валентной пневмококковой конъюгированной вакциныChanges in serotype distribution of Streptococcus pneumonia circulating among children in the Russian Federation after 13-valent pneumococcal conjugate vaccine introduction.СидоренкоС. В.SidorenkoS. V.

Сидоренко Сергей Владимирович – заведующий научно-исследовательским отделом, д.м.н., профессор, член-корреспондент РАН; тел.: +7-963-316-08-08

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

sidorserg@gmail.comЛобзинЮ. В.LobzinYu. V.

Лобзин Юрий Владимирович – президент Детского научно-клинического центра инфекционных болезней, д.м.н., профессор, академик РАН; тел.: 8(812) 234-60-04

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

ylobzin@mail.ruРеннертВ.RennertW.

Реннерт Вольфганг – медицинский директор Фонда Ростроповича – Вишневской и профессор департамента педиатрии госпиталя университета Джорджтауна, доктор медицины; тел.: +1(202)2581539

Вашингтон

Washington

wolfgang.P.Rennert@gunet.georgetown.eduНикитинаЕ. В.NikitinaE. V.

Никитина Екатерина Валерьевна – научный сотрудник, к.б.н.; тел.: +7-981-691-47-44

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

caterina.nikitina2010@yandex.ruЦветковаИ. А.TsvetkovaI. A.

Цветкова Ирина Анатольевна – младший научный сотрудник, к.б.н.; тел.: +7-961-811-58-26

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

i.tsvetik@gmail.comАгеевецВ. А.AgeevetsV. A.

Агеевец Владимир Андреевич – научный сотрудник, к.б.н.; тел.: +7-911-951-00-97

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

ageevets@list.ruМартенсЭ. А.MartensE. A.

Мартенс Эльвира Акрамовна – заведующая клинико-диагностической лабораторией, к.м.н., тел.: +7-981-760-84-99

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

eamartens@yandex.ruКалиногорскаяО. С.KalinogorskayaO. S.

Калиногорская Ольга Серафимовна – научный сотрудник, к.м.н., тел.: +7-911-274-41-68

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

kalinogorskaya@bk.ruАрдышеваА. Т.ArdyshevaA. T.

Ардышева Анастасия Тохировна – врач-бактериолог, к.м.н.; тел.: +7-908-268-84-33

Пермь 

Perm 

aardysheva@yandex.ruБаязитоваЛ. Т.BayazitovaL. T.

Баязитова Лира Табрисовна – доцент кафедры микробиологии, к.м.н.; тел.: +7-981-234-19-45

Казань 

Kazan 

bajalt@mail.ruБикмиеваА. В.BikmievaA. V.

Бикмиева Алина Валерьевна – доцент кафедры эпидемиологии и гигиены, к.м.н.; тел.: +7-908-266-16-03

Пермь 

Perm 

Polushckina.a@yandex.ruБолгароваЕ. В.BolgarovaE. V.

Болгарова Екатерина Викторовна – научный сотрудник; тел.: +7-912-208-59-02

Екатеринбург 

Yekaterinburg 

bolgarova.ev@yandex.ruБржозовскаяЕ. А.BrzhozovskaE. A.

Бржозовская Екатерина Анатольевна – врач клинической лабораторной диагностики Российской детской клинической больницы, к.м.н.; тел.: +7-985-177-28-34

Москва 

Moscow 

emmbf@yandex.ruВеренцоваИ. В.VerentsovaI. V.

Веренцова Ирина Викторовна – врач-бактериолог; тел.: +7-908-880-30-02

Ханты-Мансийск 

Khanty-Mansiysk 

iverentsova@mail.ruГиринаА. А.GirinaA. A.

Гирина Асия Ахмедовна – доцент кафедры фармакологии, педиатрии и инфекционных болезней, к.м.н.; тел.: +7-902-914-07-62

Ханты-Мансийск 

Khanty-Mansyisk 

GirinaAA@okbhmao.ruЗахароваЮ. А.ZakharovaYu. A.

Захарова Юлия Александровна – заместитель директора, д.м.н; тел.: +7-912-643-50-60

Москва 

Moscow 

z.y.alexandrovna@mail.ruИлларионоваТ. В.IllarionovaT. V.

Илларионова Татьяна Владимировна – младший научный сотрудник; тел.: +7-952-460-45-60

Нижний Новгород 

 Nizhny Novgorod 

tatianaillarionov4@yandex.ruИсаеваГ. Ш.IsaevaG. Sh.

Исаева Гузель Шавхатовна – заведующая кафедрой микробиологии, д.м.н.; тел.: +7-917-293-77-23

Казань 

Kazan 

guisaeva@rambler.ruКлимашинаА. В.KlimashinaA. V.

Климашина Алла Вячеславовна – врач-бактериолог, к.м.н.; тел.: +7-908-250-73-04

Пермь 

Khanty-Mansyisk 

allaklimashina@mail.ruКовалишенаО. В.KovalishenaO. V.

Ковалишена Ольга Васильевна – директор научно-исследовательского института профилактической медицины, д.м.н., профессор; тел.: +7-903-608-39-08

Нижний Новгород 

Nizhny Novgorod 

kovalishena@mail.ruКозееваТ. Г.KozeevaT. G.

Козеева Татьяна Геннадьевна – врач-бактериолог, к.м.н.; тел.: +7-919-489-58-39

Пермь 

Perm 

kozeevatg74@mail.ruМаянскийН. А.MayanskyN. A.

Маянский Николай Андреевич – заведующий центром лабораторной диагностики Российской детской клинической больницы, д.м.н., профессор; тел.: +7-936-976-53-65

Москва 

Moscow 

mayanskiy.nikolay@gmail.comНемировченкоИ. А.NemirovchenkoI. A.

Немировченко Илья Аркадьевич – врач клинической лабораторной диагностики; тел.: +7-960-188-86-28

Нижний Новгород 

Nizhny Novgorod 

Ilua7106@yandex.ruПоздееваИ. В.PozdeevaI. V.

Поздеева Ирина Витальевна – врач клинической лабораторной диагностики; тел.: +7-922-430-18-74

Ханты-Мансийск 

Khanty-Mansiysk 

pozdeevaiv@mail.ruСалинаВ. А.SalinaV. A.

Салина Валентина Александровна – биолог, PhD; тел.: +7-908-156-73-40

Нижний Новгород 

Nizhny Novgorod 

tina_salina@mail.ruСоколоваН. А.SokolovaN. A.

Соколова Наталия Владимировна – врач клинической лабораторной диагностики, к.м.н.; тел.: +7-964-195-82-23

Пермь 

Perm 

nata20sokol@mail.ruТомрачеваЛ. В.TomrachevaL. V.

Томрачева Людмила Витальевна – старший преподаватель; тел.: +7-932-402-33-50

Ханты-Мансийск 

Khanty-Mansyisk 

Ltomracheva@bk.ruТюринЮ. А.TyurinYu. A.

Тюрин Юрий Александрович – ведущий научный сотрудник, профессор; тел.: +7-903-314-07-02

Казань 

Kazan 

tyurin.yurii@yandex.ruФельдблюмИ. В.FeldblyumI. V.

Фельдблюм Ирина Викторовна – заведующая кафедрой эпидемиологии, профессор; тел.: +7-912-885-32-36

Пермь 

Perm 

irinablum@mail.ruШироковаИ. Ю.ShirokovaI. Yu.

Широкова Ирина Юрьевна – заведующая бактериологической лабораторией, к.м.н.; тел.: +7-904-780-45-11

Нижний Новгород 

Nizhny Novgorod 

shirokova.i@yandex.ruСкрипковскаяС. М.SkripkovskayaS. M.

Скрипковская Светлана Михайловна – лаборант-исследователь; тел.: +7-962-685-18-42

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

violinelight@gmail.comАлександроваА. Е.AleksandrovaA. E.

Александрова Екатерина Вячеславовна – лаборант-исследователь; тел.: +7-951-722-91-52

Санкт-Петербург 

Saint-Petersburg 

aleksandrova.biotech@gmail.comДетский научно-клинический центр инфекционных болезнейРоссияPediatric Research and Clinical Center for Infectious DiseasesRussian FederationФонд Ростроповича – Вишневской и госпиталь университета ДжорджтаунаСоединённые Штаты АмерикиFoundation of Rostropovich and Vishnevskaya and Georgetown University HospitalUnited StatesПермский клинический центрРоссияPerm Clinical CenterRussian FederationКазанский государственный медицинский университетРоссияKazan State Medical UniversityRussian FederationПермский государственный медицинский университет им. Е.А. ВагнераРоссияPerm State Medical University named after E.A. VagnerRussian FederationФедеральный научно-исследовательский институт вирусных инфекций «Виром»РоссияFederal Research Institute of Virus Infections «Virom»Russian FederationРоссийский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. ПироговаРоссияRussian National Research Medical University named after N.I. PirogovRussian FederationОбластная клиническая больницаРоссияRegional Clinical HospitalRussian FederationХанты-Мансийская государственная медицинская академияРоссияKhanty-Mansiysk State Medical AcademyRussian FederationФедеральный научный центр гигиены им. Ф.Ф. ЭрисманаРоссияFederal Scientific Center for Hygiene named after F.F. ErismanRussian FederationПриволжский исследовательский медицинский университетРоссияPrivolzhsky Research Medical UniversityRussian FederationПермский клинический центрРоссияKhanty-Mansiysk State Medical AcademyRussian Federation202306072023152613Copyright © Сидоренко С.В., Лобзин Ю.В., Реннерт В., Никитина Е.В., Цветкова И.А., Агеевец В.А., Мартенс Э.А., Калиногорская О.С., Ардышева А.Т., Баязитова Л.Т., Бикмиева А.В., Болгарова Е.В., Бржозовская Е.А., Веренцова И.В., Гирина А.А., Захарова Ю.А., Илларионова Т.В., Исаева Г.Ш., Климашина А.В., Ковалишена О.В., Козеева Т.Г., Маянский Н.А., Немировченко И.А., Поздеева И.В., Салина В.А., Соколова Н.А., Томрачева Л.В., Тюрин Ю.А., Фельдблюм И.В., Широкова И.Ю., Скрипковская С.М., Александрова А.Е., 20232023Сидоренко С.В., Лобзин Ю.В., Реннерт В., Никитина Е.В., Цветкова И.А., Агеевец В.А., Мартенс Э.А., Калиногорская О.С., Ардышева А.Т., Баязитова Л.Т., Бикмиева А.В., Болгарова Е.В., Бржозовская Е.А., Веренцова И.В., Гирина А.А., Захарова Ю.А., Илларионова Т.В., Исаева Г.Ш., Климашина А.В., Ковалишена О.В., Козеева Т.Г., Маянский Н.А., Немировченко И.А., Поздеева И.В., Салина В.А., Соколова Н.А., Томрачева Л.В., Тюрин Ю.А., Фельдблюм И.В., Широкова И.Ю., Скрипковская С.М., Александрова А.Е.Sidorenko S.V., Lobzin Y.V., Rennert W., Nikitina E.V., Tsvetkova I.A., Ageevets V.A., Martens E.A., Kalinogorskaya O.S., Ardysheva A.T., Bayazitova L.T., Bikmieva A.V., Bolgarova E.V., Brzhozovska E.A., Verentsova I.V., Girina A.A., Zakharova Y.A., Illarionova T.V., Isaeva G.S., Klimashina A.V., Kovalishena O.V., Kozeeva T.G., Mayansky N.A., Nemirovchenko I.A., Pozdeeva I.V., Salina V.A., Sokolova N.A., Tomracheva L.V., Tyurin Y.A., Feldblyum I.V., Shirokova I.Y., Skripkovskaya S.M., Aleksandrova A.E.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1499

В ходе проспективного многоцентрового не интервенционного обсервационного исследования была проведена сравнительная оценка серотиповой структуры пневмококков, циркулирующих среди здоровых детей в возрасте до 5 лет и детей этой же возрастной группы с признаками респираторных инфекций в периоды 2016–2018 гг. и 2020–2022 гг. Данные о серотиповой структуры пневмококков в период 2016–2018 гг. были получены из наших предыдущих работ. В 2020–2022 гг. в исследование было включено 2066 здоровых детей и 603 ребенка с респираторными инфекциями. Streptococcus pneumoniae и их ДНК детектировали в назофарингеальных мазках классическими культуральными и молекулярными методами. Типирование проводили молекулярными методами. На территории Российской Федерации происходят процесс вытеснения из циркуляции пневмококков, относящихся к серотипам, входящим в 13-валентную вакцину, и их замещение невакцинными серотипами. Перед внедрением массовой антипневмококковой вакцинации (до 2015 г.) конъюгированная 13-валентная вакцина обеспечивала на тот момент охват от 66,2% до 92% пневмококков, после начала массовой антипневмококковой вакцинации в период 2016–2018 гг. охват снизился до 57,3%. В период с 2020 по 2022 г. охват составил менее 40%. К основным «невакцинным» серотипам/серогруппам, циркулирующим на территории Российской Федерации, относятся 15AF, 11AD, 23A, 9LN, 16F.

During a prospective multicenter non-interventional observational study, a comparative assessment was made of the serotype structure of pneumococci circulating among healthy children under the age of 5 years and children of the same age group with signs of respiratory infections in the periods 2016-2018 and 2020-2022. Data on the serotype structure of pneumococci in the period from 2016-2018 were obtained from our previous works. In 2020-2022 the study included 2066 healthy children and 603 children with respiratory infections. Streptococcus pneumoniae and their DNA were detected in nasopharyngeal swabs by classical culture and molecular methods. Typing was carried out by molecular methods. On the territory of the Russian Federation, pneumococci belonging to the serotypes included in the 13-valent vaccine are being forced out of circulation and replaced by non-vaccine serotypes. Before the introduction of mass antipneumococcal vaccination (until 2015), the 13-valent conjugate vaccine covered from 66.2% to 92% of pneumococci, after the start of mass anti-pneumococcal vaccination in the period 2016-2018, coverage decreased to 57.3%. Between 2020 and 2022, coverage was less than 40%. The main “non-vaccine” serotypes/serogroups circulating in the Russian Federation are 15AF, 11AD, 23A, 9LN and 16F.

Streptococcus pneumoniaeсеротипывакциныStreptococcus pneumoniaeserotypesvaccinesНастоящее исследование выполнено в рамках проекта SAPIENS (Scientific Assessment of Pneumococcal Infection Epidemiology Networks) совместно с Фондом Ростроповича-Вишневской при финансовой поддержке компании Пфайзер (грант: WI208610).ReferencesHausdorff, W.P.; Bryant, J.; Paradiso, P.R.; Siber, G.R. Which Pneumococcal Serogroups Cause the Most Invasive Disease: Implications for Conjugate Vaccine Formulation and Use, Part I. Clinical Infectious Diseases 2000, 30, 100-121,Hausdorff, W.P.; Bryant, J.; Paradiso, P.R.; Siber, G.R. Which Pneumococcal Serogroups Cause the Most Invasive Disease: Implications for Conjugate Vaccine Formulation and Use, Part I. Clinical Infectious Diseases 2000, 30, 100-121.Whitney, C.G.; Farley, M.M.; Hadler, J.; Harrison, L.H.; Bennett, N.M.; Lynfield, R.; Reingold, A.; Cieslak, P.R.; Pilishvili, T.; Jackson, D.; et al. Decline in invasive pneumococcal disease after the introduction of protein-polysaccharide conjugate vaccine. N Engl J Med 2003, 348, 1737-1746.Whitney, C.G.; Farley, M.M.; Hadler, J.; Harrison, L.H.; Bennett, N.M.; Lynfield, R.; Reingold, A.; Cieslak, P.R.; Pilishvili, T.; Jackson, D.; et al. Decline in invasive pneumococcal disease after the introduction of protein-polysaccharide conjugate vaccine. N Engl J Med 2003, 348, 1737-1746.Leung, M.H.; Bryson, K.; Freystatter, K.; Pichon, B.; Edwards, G.; Charalambous, B.M.; Gillespie, S.H. Sequetyping: serotyping Streptococcus pneumoniae by a single PCR sequencing strategy. J Clin Microbiol 2012, 50, 2419-2427.Leung, M.H.; Bryson, K.; Freystatter, K.; Pichon, B.; Edwards, G.; Charalambous, B.M.; Gillespie, S.H. Sequetyping: serotyping Streptococcus pneumoniae by a single PCR sequencing strategy. J Clin Microbiol 2012, 50, 2419-2427.Sidorenko, S.; Rennert, W.; Lobzin, Y.; Briko, N.; Kozlov, R.; Namazova-Baranova, L.; Tsvetkova, I.; Ageevets, V.; Nikitina, E.; Ardysheva, A.; et al. Multicenter study of serotype distribution of Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal isolates from healthy children in the Russian Federation after introduction of PCV13 into the National Vaccination Calendar. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2020, 96, 114914.Sidorenko, S.; Rennert, W.; Lobzin, Y.; Briko, N.; Kozlov, R.; Namazova-Baranova, L.; Tsvetkova, I.; Ageevets, V.; Nikitina, E.; Ardysheva, A.; et al. Multicenter study of serotype distribution of Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal isolates from healthy children in the Russian Federation after introduction of PCV13 into the National Vaccination Calendar. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2020, 96, 114914.Никитина, Е.В. Серотиповый состав Streptococcus pneumoniae, циркулирующих у детей с респираторными инфекциями, оптимизация молекулярных методов оценки / Е.В. Никитина [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. – 2021. – № 66. – С. 18–24.Nikitina E.V.; Tsvetkova I. A.; Kalinogorskaya O.S.; Gostev V.V.; Belanov S.S.; Mokhov A.S.; Kalisnikova E.L. Serotype composition of Streptococcus pneumoniae circulating in children with respiratory infections, optimization of molecular assessment methods. Antibiotiki i khimioterapiya 2021, 66, 18-24. (In Russian).Downs, S.L.; Olwagen, C.P.; Van Der Merwe, L.; Nzenze, S.; Nunes, M.C.; Madhi, S.A. Streptococcus pneumoniae and other bacterial nasopharyngeal colonisation eight years postintroduction of 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in South African children. International Journal of Infectious Diseases 2023.Downs, S.L.; Olwagen, C.P.; Van Der Merwe, L.; Nzenze, S.; Nunes, M.C.; Madhi, S.A. Streptococcus pneumoniae and other bacterial nasopharyngeal colonisation eight years postintroduction of 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in South African children. International Journal of Infectious Diseases 2023.Kim, S.H.; Chung, D.R.; Song, J.-H.; Baek, J.Y.; Thamlikitkul, V.; Wang, H.; Carlos, C.; Ahmad, N.; Arushothy, R.; Tan, S.H.; et al. Changes in serotype distribution and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae isolates from adult patients in Asia: Emergence of drug-resistant non-vaccine serotypes. Vaccine 2020, 38, 6065-6073.Kim, S.H.; Chung, D.R.; Song, J.-H.; Baek, J.Y.; Thamlikitkul, V.; Wang, H.; Carlos, C.; Ahmad, N.; Arushothy, R.; Tan, S.H.; et al. Changes in serotype distribution and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae isolates from adult patients in Asia: Emergence of drug-resistant non-vaccine serotypes. Vaccine 2020, 38, 6065-6073.Tatochenko, V.; Sidorenko, S.; Namazova-Baranova, L.; Mayanskiy, N.; Kulichenko, T.; Baranov, A.; Lobzin, Y.; Kharit, S.; Kozlov, R.; Andreeva, I.; et al. Streptococcus pneumoniae serotype distribution in children in the Russian Federation before the introduction of pneumococcal conjugate vaccines into the National Immunization Program. Expert Rev Vaccines 2014, 13, 257-264.Tatochenko, V.; Sidorenko, S.; Namazova-Baranova, L.; Mayanskiy, N.; Kulichenko, T.; Baranov, A.; Lobzin, Y.; Kharit, S.; Kozlov, R.; Andreeva, I.; et al. Streptococcus pneumoniae serotype distribution in children in the Russian Federation before the introduction of pneumococcal conjugate vaccines into the National Immunization Program. Expert Rev Vaccines 2014, 13, 257-264.Трухин, В.П. Анализ серотипового пейзажа пневмококков для определения композиционной модели отечественной пневмококковой конъюгированной вакцины / В.П. Трухин [и др.] // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. – 2022. – № 22. – С. 124–141.Trukhin V.P.; Evtushenko A.E.; Salimova E.L.; Konon A.D.; Khaitov M.R.; VA, M. Analysis of the serotype landscape of pneumococci to determine the compositional model of the domestic pneumococcal conjugate vaccine. BIOpreparaty. Profilaktika, diagnostika, lecheniye. 2022, 22, 124-141. (In Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.